More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0574 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0574  hypothetical protein  100 
 
 		 321 aa  621  1e-177  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.877456  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1639  hypothetical protein  86.92 
 
 		 334 aa  551  1e-156  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0262  hypothetical protein  83.49 
 
 		 334 aa  535  1e-151  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00766044 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1671  hypothetical protein  64.38 
 
 		 334 aa  381  1e-104  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0245  hypothetical protein  46.86 
 
 		 336 aa  302  6.000000000000001e-81  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0191  hypothetical protein  45.71 
 
 		 336 aa  298  6e-80  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1711  hypothetical protein  44.76 
 
 		 336 aa  294  2e-78  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.1929  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0751  hypothetical protein  45.08 
 
 		 336 aa  293  3e-78  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0445  hypothetical protein  37.08 
 
 		 393 aa  233  5e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000355219  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0372  hypothetical protein  22.67 
 
 		 339 aa  107  3e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2217  hypothetical protein  34.88 
 
 		 351 aa  106  7e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.253249  normal  0.0953517 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1154  hypothetical protein  28.65 
 
 		 358 aa  102  8e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000550105  normal  0.0344505 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1326  hypothetical protein  25.87 
 
 		 354 aa  102  1e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0560  protein of unknown function UPF0118  26.69 
 
 		 339 aa  101  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3492  hypothetical protein  26.1 
 
 		 387 aa  100  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.705437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2944  hypothetical protein  26.69 
 
 		 368 aa  98.6  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.81591  decreased coverage  0.00297728 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3717  hypothetical protein  26.99 
 
 		 353 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396811  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2207  hypothetical protein  26.09 
 
 		 354 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4988  hypothetical protein  27.02 
 
 		 347 aa  96.7  5e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1855  hypothetical protein  26.54 
 
 		 354 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0258165 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4325  permease  25.95 
 
 		 372 aa  95.5  9e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4337  permease  25.95 
 
 		 372 aa  95.5  9e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4490  hypothetical protein  25.66 
 
 		 372 aa  95.5  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0811913  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4841  hypothetical protein  25.66 
 
 		 365 aa  95.1  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4026  hypothetical protein  26.88 
 
 		 360 aa  95.1  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3531  hypothetical protein  26.09 
 
 		 354 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.43917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0614  hypothetical protein  30 
 
 		 358 aa  94.4  3e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4727  hypothetical protein  25.66 
 
 		 365 aa  94  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3210  hypothetical protein  25.62 
 
 		 354 aa  94  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.212604 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4722  sporulation integral membrane protein YtvI  25.66 
 
 		 372 aa  94  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4711  sporulation integral membrane protein YtvI  25.66 
 
 		 372 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000506038 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0987  hypothetical protein  24.85 
 
 		 394 aa  92.8  6e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.89372 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3950  protein of unknown function UPF0118  26.2 
 
 		 360 aa  92.4  8e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1830  hypothetical protein  25.47 
 
 		 354 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2289  hypothetical protein  24.92 
 
 		 353 aa  92  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.864507  normal  0.333993 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3378  hypothetical protein  25.23 
 
 		 354 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11000  hypothetical protein  26.5 
 
 		 346 aa  91.7  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0540  protein of unknown function UPF0118  26.18 
 
 		 349 aa  91.3  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2311  protein of unknown function UPF0118  24.83 
 
 		 393 aa  90.5  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4706  sporulation integral membrane protein YtvI  26.42 
 
 		 372 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3980  hypothetical protein  25.94 
 
 		 352 aa  90.1  4e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0869717 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0531  sporulation integral membrane protein YtvI  26.33 
 
 		 372 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.671743 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3708  hypothetical protein  27.75 
 
 		 355 aa  88.6  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.168874 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3807  hypothetical protein  29.51 
 
 		 353 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.911463  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2416  protein of unknown function UPF0118  25 
 
 		 378 aa  88.2  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.25064  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3717  hypothetical protein  29.51 
 
 		 350 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0661403  normal  0.22421 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0020  hypothetical protein  29.35 
 
 		 358 aa  87.8  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2212  protein of unknown function UPF0118  29.09 
 
 		 355 aa  87.8  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000181482  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4556  hypothetical protein  29.51 
 
 		 398 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.173549  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0901  protein of unknown function UPF0118  23.49 
 
 		 365 aa  88.2  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5533  hypothetical protein  27.75 
 
 		 355 aa  87.8  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2612  protein of unknown function UPF0118  25.41 
 
 		 363 aa  87.4  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.751344  normal  0.787744 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2083  hypothetical protein  26.43 
 
 		 356 aa  87  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.251587 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1653  hypothetical protein  25.45 
 
 		 362 aa  87  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.212682  normal  0.81767 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1267  protein of unknown function UPF0118  28.96 
 
 		 371 aa  85.9  8e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0792338  normal  0.0741439 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4931  hypothetical protein  29.28 
 
 		 353 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.850306  normal  0.602485 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2425  hypothetical protein  28.41 
 
 		 363 aa  85.5  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  35 
 
 		 349 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1907  protein of unknown function UPF0118  31.03 
 
 		 352 aa  84.3  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1821  hypothetical protein  31.03 
 
 		 381 aa  84.7  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.693161 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2642  hypothetical protein  24.77 
 
 		 352 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00776691  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1633  hypothetical protein  24.77 
 
 		 352 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0289  hypothetical protein  24.77 
 
 		 352 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.700262  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0253  hypothetical protein  24.77 
 
 		 352 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.077494  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2503  hypothetical protein  24.77 
 
 		 352 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0937  PerM family permease  25.08 
 
 		 374 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1226  hypothetical protein  30.95 
 
 		 352 aa  84  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1436  hypothetical protein  24.77 
 
 		 352 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1300  protein of unknown function UPF0118  23.68 
 
 		 345 aa  83.6  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.316018  normal  0.608638 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2549  hypothetical protein  29.82 
 
 		 352 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705186  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0292  hypothetical protein  25.69 
 
 		 391 aa  83.2  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4426  sporulation integral membrane protein YtvI  25.84 
 
 		 372 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0529  hypothetical protein  24.77 
 
 		 352 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2709  hypothetical protein  26.93 
 
 		 362 aa  82  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29820  hypothetical protein  29.24 
 
 		 352 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0125581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2413  hypothetical protein  25.48 
 
 		 345 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.480547  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0488  hypothetical protein  28.57 
 
 		 371 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.131577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2012  protein of unknown function UPF0118  28 
 
 		 363 aa  80.5  0.00000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.578603 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2610  protein of unknown function UPF0118  24.29 
 
 		 370 aa  80.1  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0737  hypothetical protein  29.24 
 
 		 356 aa  79.7  0.00000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.203827  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0268  protein of unknown function UPF0118  25.37 
 
 		 363 aa  79.3  0.00000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3249  hypothetical protein  29.24 
 
 		 350 aa  79  0.00000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.691639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4731  hypothetical protein  27.33 
 
 		 359 aa  78.6  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.226742  hitchhiker  0.00240822 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0792  protein of unknown function UPF0118  30.48 
 
 		 344 aa  79  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.101192 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2050  hypothetical protein  30.43 
 
 		 373 aa  78.2  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2958  protein of unknown function UPF0118  25.38 
 
 		 339 aa  77.4  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2573  membrane protein  23.1 
 
 		 361 aa  77.4  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2229  hypothetical protein  27.19 
 
 		 392 aa  77  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  22.81 
 
 		 396 aa  76.6  0.0000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4931  hypothetical protein  25.24 
 
 		 351 aa  77  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0276  protein of unknown function UPF0118  23.53 
 
 		 423 aa  77  0.0000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.133789  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  30.18 
 
 		 392 aa  77  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0854  membrane protein  26.75 
 
 		 363 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0563046  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0338  hypothetical protein  24.07 
 
 		 365 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88474  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4053  hypothetical protein  28.65 
 
 		 361 aa  76.6  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.920687 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2868  hypothetical protein  21.81 
 
 		 358 aa  76.6  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838475  normal  0.0422213 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1563  hypothetical protein  25.73 
 
 		 398 aa  76.3  0.0000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.78708  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1950  protein of unknown function UPF0118  22.36 
 
 		 346 aa  75.9  0.0000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.863146  normal  0.537489 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3280  sporulation integral membrane protein YtvI  23.66 
 
 		 372 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  26.13 
 
 		 355 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>