281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1711 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1711  hypothetical protein  100 
 
 		 336 aa  672    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.1929  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0751  hypothetical protein  94.94 
 
 		 336 aa  642    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0191  hypothetical protein  88.69 
 
 		 336 aa  624  1e-177  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0245  hypothetical protein  72.92 
 
 		 336 aa  522  1e-147  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0262  hypothetical protein  44.71 
 
 		 334 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00766044 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1639  hypothetical protein  42.6 
 
 		 334 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0574  hypothetical protein  44.76 
 
 		 321 aa  294  2e-78  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.877456  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1671  hypothetical protein  45.57 
 
 		 334 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0445  hypothetical protein  40 
 
 		 393 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000355219  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2944  hypothetical protein  27.33 
 
 		 368 aa  119  9e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.81591  decreased coverage  0.00297728 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2217  hypothetical protein  26.05 
 
 		 351 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.253249  normal  0.0953517 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1326  hypothetical protein  22.05 
 
 		 354 aa  109  6e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0372  hypothetical protein  25.15 
 
 		 339 aa  106  5e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0560  protein of unknown function UPF0118  25.84 
 
 		 339 aa  99.4  7e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2311  protein of unknown function UPF0118  26.84 
 
 		 393 aa  95.1  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4988  hypothetical protein  24.32 
 
 		 347 aa  92.4  9e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0614  hypothetical protein  26.75 
 
 		 358 aa  90.9  3e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2050  hypothetical protein  24.07 
 
 		 373 aa  89  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3492  hypothetical protein  26.51 
 
 		 387 aa  87.8  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.705437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0987  hypothetical protein  24.7 
 
 		 394 aa  85.1  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.89372 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4411  protein of unknown function UPF0118  25.36 
 
 		 389 aa  85.1  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2610  protein of unknown function UPF0118  25.81 
 
 		 370 aa  84.3  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4130  hypothetical protein  25.36 
 
 		 406 aa  84  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.189132  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1653  hypothetical protein  26.61 
 
 		 362 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.212682  normal  0.81767 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1821  hypothetical protein  31.28 
 
 		 381 aa  83.6  0.000000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.693161 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1907  protein of unknown function UPF0118  31.28 
 
 		 352 aa  83.6  0.000000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2207  hypothetical protein  27.85 
 
 		 354 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1950  protein of unknown function UPF0118  22.88 
 
 		 346 aa  81.6  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.863146  normal  0.537489 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2612  protein of unknown function UPF0118  25.48 
 
 		 363 aa  81.6  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.751344  normal  0.787744 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1154  hypothetical protein  25 
 
 		 358 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000550105  normal  0.0344505 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0901  protein of unknown function UPF0118  23.1 
 
 		 365 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3531  hypothetical protein  27.85 
 
 		 354 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.43917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3980  hypothetical protein  31.55 
 
 		 352 aa  80.1  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0869717 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3717  hypothetical protein  29.65 
 
 		 353 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396811  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0940  protein of unknown function UPF0118  24.7 
 
 		 345 aa  79.3  0.00000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.726387  normal  0.96935 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3378  hypothetical protein  29.32 
 
 		 354 aa  79.3  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0826  hypothetical protein  23.28 
 
 		 369 aa  78.6  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.981363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2212  protein of unknown function UPF0118  25.93 
 
 		 355 aa  79  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000181482  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2425  hypothetical protein  28.09 
 
 		 363 aa  78.6  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1581  protein of unknown function UPF0118  27.75 
 
 		 341 aa  78.6  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0769558 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2083  hypothetical protein  29.32 
 
 		 356 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.251587 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3708  hypothetical protein  26.34 
 
 		 355 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.168874 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3210  hypothetical protein  27.75 
 
 		 354 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.212604 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1830  hypothetical protein  26.48 
 
 		 354 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1144  protein of unknown function UPF0118  26.76 
 
 		 341 aa  76.6  0.0000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.158987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5533  hypothetical protein  26.34 
 
 		 355 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0540  protein of unknown function UPF0118  26.05 
 
 		 349 aa  76.3  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4731  hypothetical protein  27.68 
 
 		 359 aa  76.3  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.226742  hitchhiker  0.00240822 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1226  hypothetical protein  25.52 
 
 		 352 aa  76.3  0.0000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0020  hypothetical protein  27.53 
 
 		 358 aa  75.9  0.0000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11000  hypothetical protein  24.34 
 
 		 346 aa  75.1  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1855  hypothetical protein  29.07 
 
 		 354 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0258165 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1267  protein of unknown function UPF0118  23.92 
 
 		 371 aa  75.1  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0792338  normal  0.0741439 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4053  hypothetical protein  28.41 
 
 		 361 aa  74.7  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.920687 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0697  protein of unknown function UPF0118  24.2 
 
 		 368 aa  74.7  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.612025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0338  hypothetical protein  22.99 
 
 		 365 aa  74.3  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88474  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3950  protein of unknown function UPF0118  25.29 
 
 		 360 aa  74.3  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29820  hypothetical protein  27.72 
 
 		 352 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0125581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3807  hypothetical protein  25.81 
 
 		 353 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.911463  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2549  hypothetical protein  25 
 
 		 352 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705186  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2289  hypothetical protein  26.34 
 
 		 353 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.864507  normal  0.333993 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3717  hypothetical protein  25.81 
 
 		 350 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0661403  normal  0.22421 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4931  hypothetical protein  26.4 
 
 		 353 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.850306  normal  0.602485 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4556  hypothetical protein  25.81 
 
 		 398 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.173549  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4931  hypothetical protein  23.91 
 
 		 351 aa  72.8  0.000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1300  protein of unknown function UPF0118  25.4 
 
 		 345 aa  72  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.316018  normal  0.608638 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0398  protein of unknown function UPF0118  23.86 
 
 		 425 aa  71.2  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.0034127  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0292  hypothetical protein  22.82 
 
 		 391 aa  71.2  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3249  hypothetical protein  29.55 
 
 		 350 aa  70.1  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.691639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1633  hypothetical protein  27.27 
 
 		 352 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0253  hypothetical protein  27.27 
 
 		 352 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.077494  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2642  hypothetical protein  27.27 
 
 		 352 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00776691  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0529  hypothetical protein  27.27 
 
 		 352 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0792  protein of unknown function UPF0118  28.09 
 
 		 344 aa  69.3  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.101192 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1436  hypothetical protein  27.27 
 
 		 352 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2503  hypothetical protein  27.27 
 
 		 352 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0289  hypothetical protein  27.27 
 
 		 352 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.700262  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0937  PerM family permease  27.27 
 
 		 374 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4026  hypothetical protein  23.75 
 
 		 360 aa  68.6  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2416  protein of unknown function UPF0118  27.81 
 
 		 378 aa  67.4  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.25064  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0488  hypothetical protein  25.28 
 
 		 371 aa  67.4  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.131577  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2709  hypothetical protein  21.52 
 
 		 362 aa  67  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0549  protein of unknown function UPF0118  22.92 
 
 		 384 aa  66.6  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0941477  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2958  protein of unknown function UPF0118  25.19 
 
 		 339 aa  66.6  0.0000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0783  hypothetical protein  26.46 
 
 		 353 aa  66.2  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0276  protein of unknown function UPF0118  23.89 
 
 		 423 aa  66.2  0.0000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.133789  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13258  putative transmembrane protein  27.08 
 
 		 339 aa  65.9  0.0000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3427  hypothetical protein  24.11 
 
 		 355 aa  65.9  0.0000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1111  protein of unknown function UPF0118  25.54 
 
 		 381 aa  65.5  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0737  hypothetical protein  26.4 
 
 		 356 aa  65.9  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.203827  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2998  hypothetical protein  27.88 
 
 		 359 aa  65.9  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1275  hypothetical protein  24.74 
 
 		 354 aa  65.1  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0268  protein of unknown function UPF0118  24.1 
 
 		 363 aa  64.3  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1040  hypothetical protein  26.91 
 
 		 366 aa  63.9  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00428171  unclonable  0.0000000129007 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0113  hypothetical protein  23.67 
 
 		 346 aa  63.5  0.000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0968389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0491  hypothetical protein  22.42 
 
 		 359 aa  63.2  0.000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000229793  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2015  protein of unknown function UPF0118  25.81 
 
 		 354 aa  62.8  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000281213 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2229  hypothetical protein  23.85 
 
 		 392 aa  62.8  0.000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3205  sporulation integral membrane protein YtvI  23.02 
 
 		 362 aa  62.4  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000954806  hitchhiker  0.000000642415 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0888  hypothetical protein  20 
 
 		 370 aa  62.4  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000401846  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>