More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1267 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1267  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 		 371 aa  717    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0792338  normal  0.0741439 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2425  hypothetical protein  45.1 
 
 		 363 aa  304  2.0000000000000002e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0901  protein of unknown function UPF0118  44.38 
 
 		 365 aa  295  7e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3950  protein of unknown function UPF0118  41.11 
 
 		 360 aa  290  3e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1226  hypothetical protein  44.08 
 
 		 352 aa  286  4e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0338  hypothetical protein  41.55 
 
 		 365 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88474  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2083  hypothetical protein  41.42 
 
 		 356 aa  276  4e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.251587 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2207  hypothetical protein  42.01 
 
 		 354 aa  276  5e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0488  hypothetical protein  43.38 
 
 		 371 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.131577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3531  hypothetical protein  42.01 
 
 		 354 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.43917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2549  hypothetical protein  43.62 
 
 		 352 aa  273  3e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705186  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29820  hypothetical protein  43.32 
 
 		 352 aa  272  6e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0125581  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11000  hypothetical protein  41.72 
 
 		 346 aa  272  7e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3980  hypothetical protein  42.61 
 
 		 352 aa  271  1e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0869717 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3717  hypothetical protein  43.2 
 
 		 353 aa  270  2e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396811  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0737  hypothetical protein  40.23 
 
 		 356 aa  270  4e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.203827  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3492  hypothetical protein  42.43 
 
 		 387 aa  269  5.9999999999999995e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.705437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1830  hypothetical protein  42.01 
 
 		 354 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3210  hypothetical protein  41.49 
 
 		 354 aa  266  5e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.212604 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0987  hypothetical protein  39.13 
 
 		 394 aa  265  7e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.89372 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1653  hypothetical protein  45.61 
 
 		 362 aa  265  1e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.212682  normal  0.81767 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2289  hypothetical protein  39.06 
 
 		 353 aa  263  3e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.864507  normal  0.333993 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1855  hypothetical protein  41.42 
 
 		 354 aa  263  3e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0258165 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3378  hypothetical protein  40.56 
 
 		 354 aa  261  1e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0549  protein of unknown function UPF0118  39.15 
 
 		 384 aa  260  3e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0941477  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4053  hypothetical protein  41.49 
 
 		 361 aa  259  5.0000000000000005e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.920687 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4931  hypothetical protein  42.14 
 
 		 351 aa  256  4e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3427  hypothetical protein  40.97 
 
 		 355 aa  251  2e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2050  hypothetical protein  40.22 
 
 		 373 aa  249  4e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3807  hypothetical protein  39.39 
 
 		 353 aa  249  5e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.911463  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4556  hypothetical protein  39.39 
 
 		 398 aa  249  6e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.173549  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5533  hypothetical protein  39.23 
 
 		 355 aa  247  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1907  protein of unknown function UPF0118  40.98 
 
 		 352 aa  246  4.9999999999999997e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1821  hypothetical protein  41.1 
 
 		 381 aa  246  4.9999999999999997e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.693161 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3708  hypothetical protein  38.95 
 
 		 355 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.168874 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3717  hypothetical protein  38.27 
 
 		 350 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0661403  normal  0.22421 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4411  protein of unknown function UPF0118  40.36 
 
 		 389 aa  243  3e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4988  hypothetical protein  38.33 
 
 		 347 aa  243  3e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2868  hypothetical protein  39.88 
 
 		 358 aa  244  3e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838475  normal  0.0422213 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0540  protein of unknown function UPF0118  39.24 
 
 		 349 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3249  hypothetical protein  40.59 
 
 		 350 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.691639  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4130  hypothetical protein  40.36 
 
 		 406 aa  242  6e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.189132  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2998  hypothetical protein  41.25 
 
 		 359 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7289  hypothetical protein  40 
 
 		 353 aa  238  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0826  hypothetical protein  37.02 
 
 		 369 aa  236  6e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.981363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0529  hypothetical protein  40.5 
 
 		 352 aa  232  6e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0460  hypothetical protein  38.16 
 
 		 352 aa  232  7.000000000000001e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.353952  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0400  hypothetical protein  38.16 
 
 		 372 aa  232  7.000000000000001e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.413713  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0020  hypothetical protein  39.17 
 
 		 358 aa  232  8.000000000000001e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2642  hypothetical protein  40.81 
 
 		 352 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00776691  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0253  hypothetical protein  40.81 
 
 		 352 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.077494  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1436  hypothetical protein  40.81 
 
 		 352 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2503  hypothetical protein  40.81 
 
 		 352 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0289  hypothetical protein  40.81 
 
 		 352 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.700262  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1633  hypothetical protein  40.81 
 
 		 352 aa  231  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0937  PerM family permease  40.81 
 
 		 374 aa  230  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4931  hypothetical protein  38.79 
 
 		 353 aa  227  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.850306  normal  0.602485 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2012  protein of unknown function UPF0118  33.24 
 
 		 363 aa  197  4.0000000000000005e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.578603 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2238  protein of unknown function UPF0118  35.47 
 
 		 379 aa  189  4e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.605073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0338  protein of unknown function UPF0118  35.69 
 
 		 363 aa  181  2e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0491  hypothetical protein  33.33 
 
 		 359 aa  180  4e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000229793  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2181  protein of unknown function UPF0118  32.51 
 
 		 376 aa  179  5.999999999999999e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00612132  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0203  hypothetical protein  32.08 
 
 		 362 aa  176  4e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0228  hypothetical protein  34.38 
 
 		 356 aa  176  7e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1563  hypothetical protein  30.35 
 
 		 398 aa  144  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.78708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1154  hypothetical protein  30.03 
 
 		 358 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000550105  normal  0.0344505 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4731  hypothetical protein  29.87 
 
 		 359 aa  138  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.226742  hitchhiker  0.00240822 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2573  membrane protein  27.54 
 
 		 361 aa  138  2e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2369  hypothetical protein  32.96 
 
 		 357 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00120754  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0783  hypothetical protein  28.27 
 
 		 353 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0560  protein of unknown function UPF0118  28.96 
 
 		 339 aa  130  3e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2413  hypothetical protein  27.01 
 
 		 345 aa  124  3e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.480547  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2679  hypothetical protein  31.8 
 
 		 352 aa  123  6e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0689913  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2764  hypothetical protein  28.48 
 
 		 346 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.327799  normal  0.0566584 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2229  hypothetical protein  27.08 
 
 		 392 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2098  hypothetical protein  30.09 
 
 		 368 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1102  hypothetical protein  25.6 
 
 		 365 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00400546  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2709  hypothetical protein  27.59 
 
 		 362 aa  113  6e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3082  protein of unknown function UPF0118  28.96 
 
 		 397 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2311  protein of unknown function UPF0118  27.64 
 
 		 393 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0854  membrane protein  28.7 
 
 		 363 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0563046  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0292  hypothetical protein  25.14 
 
 		 391 aa  110  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2294  hypothetical protein  29.17 
 
 		 360 aa  110  6e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1732  protein of unknown function UPF0118  30.91 
 
 		 355 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000390095  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3189  protein of unknown function UPF0118  27.55 
 
 		 361 aa  109  8.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000846761  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2610  protein of unknown function UPF0118  28.05 
 
 		 370 aa  107  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2448  hypothetical protein  25.38 
 
 		 415 aa  105  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0466557  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0152  putative lipoprotein  26.63 
 
 		 361 aa  104  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0276  protein of unknown function UPF0118  27.79 
 
 		 423 aa  103  4e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.133789  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2958  protein of unknown function UPF0118  26.6 
 
 		 339 aa  103  5e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4026  hypothetical protein  24.56 
 
 		 360 aa  102  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0336  hypothetical protein  23.82 
 
 		 372 aa  101  2e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000639163  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2212  protein of unknown function UPF0118  24.7 
 
 		 355 aa  101  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000181482  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1578  protein of unknown function UPF0118  25.93 
 
 		 373 aa  100  6e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.373133  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1950  protein of unknown function UPF0118  25.76 
 
 		 346 aa  99.8  6e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.863146  normal  0.537489 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0268  protein of unknown function UPF0118  26.46 
 
 		 363 aa  98.6  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0738  acid membrane antigen A  21.97 
 
 		 352 aa  98.6  2e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.444287  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0916  protein of unknown function UPF0118  26.84 
 
 		 355 aa  98.6  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.116301  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4008  hypothetical protein  27.97 
 
 		 360 aa  98.2  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3812  protein of unknown function UPF0118  28.33 
 
 		 356 aa  98.6  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>