More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0916 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0916  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 
355 aa  679    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.116301  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4026  hypothetical protein  27.22 
 
 
360 aa  159  8e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1154  hypothetical protein  25.43 
 
 
358 aa  142  6e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000550105  normal  0.0344505 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3717  hypothetical protein  30.45 
 
 
353 aa  137  4e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396811  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4130  hypothetical protein  29.17 
 
 
406 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.189132  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4411  protein of unknown function UPF0118  28.89 
 
 
389 aa  134  3e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2709  hypothetical protein  27.5 
 
 
362 aa  133  6e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3980  hypothetical protein  28.62 
 
 
352 aa  132  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0869717 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2207  hypothetical protein  29.26 
 
 
354 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4931  hypothetical protein  27.62 
 
 
351 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2083  hypothetical protein  29.64 
 
 
356 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.251587 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11000  hypothetical protein  29.81 
 
 
346 aa  131  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3492  hypothetical protein  27.86 
 
 
387 aa  130  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.705437  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0987  hypothetical protein  29.09 
 
 
394 aa  130  3e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.89372 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3531  hypothetical protein  28.94 
 
 
354 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.43917  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0292  hypothetical protein  28.4 
 
 
391 aa  129  7.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3950  protein of unknown function UPF0118  28.13 
 
 
360 aa  129  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0854  membrane protein  25.93 
 
 
363 aa  127  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0563046  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7289  hypothetical protein  27.13 
 
 
353 aa  126  7e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3378  hypothetical protein  27.67 
 
 
354 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2425  hypothetical protein  26.67 
 
 
363 aa  125  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3210  hypothetical protein  27.67 
 
 
354 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.212604 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29820  hypothetical protein  28.09 
 
 
352 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0125581  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0783  hypothetical protein  25.56 
 
 
353 aa  124  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1830  hypothetical protein  28.94 
 
 
354 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2868  hypothetical protein  25.68 
 
 
358 aa  122  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838475  normal  0.0422213 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1855  hypothetical protein  26.93 
 
 
354 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0258165 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1226  hypothetical protein  27.85 
 
 
352 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2549  hypothetical protein  28.09 
 
 
352 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705186  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0338  hypothetical protein  27.08 
 
 
365 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88474  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0336  hypothetical protein  32.64 
 
 
372 aa  120  4.9999999999999996e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000639163  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1821  hypothetical protein  27.35 
 
 
381 aa  119  9e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.693161 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2050  hypothetical protein  27 
 
 
373 aa  119  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1907  protein of unknown function UPF0118  27.35 
 
 
352 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0488  hypothetical protein  26.45 
 
 
371 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.131577  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2289  hypothetical protein  26.97 
 
 
353 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.864507  normal  0.333993 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0560  protein of unknown function UPF0118  23.21 
 
 
339 aa  116  6e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0737  hypothetical protein  28.53 
 
 
356 aa  116  6e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.203827  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2416  protein of unknown function UPF0118  27.09 
 
 
378 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.25064  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4988  hypothetical protein  22.56 
 
 
347 aa  115  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0826  hypothetical protein  25.82 
 
 
369 aa  114  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.981363  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0549  protein of unknown function UPF0118  25.59 
 
 
384 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0941477  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3249  hypothetical protein  26.48 
 
 
350 aa  114  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.691639  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3427  hypothetical protein  25.91 
 
 
355 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3708  hypothetical protein  27.79 
 
 
355 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.168874 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2098  hypothetical protein  25.15 
 
 
368 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0540  protein of unknown function UPF0118  26.27 
 
 
349 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3734  hypothetical protein  26.49 
 
 
350 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0901  protein of unknown function UPF0118  27.79 
 
 
365 aa  110  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5533  hypothetical protein  27.79 
 
 
355 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4200  hypothetical protein  25.75 
 
 
346 aa  109  6e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0152  putative lipoprotein  24.56 
 
 
361 aa  109  7.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3717  hypothetical protein  27.49 
 
 
350 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0661403  normal  0.22421 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3807  hypothetical protein  26.61 
 
 
353 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.911463  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4556  hypothetical protein  26.61 
 
 
398 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.173549  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0529  hypothetical protein  27.11 
 
 
352 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1436  hypothetical protein  27.41 
 
 
352 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0253  hypothetical protein  27.41 
 
 
352 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.077494  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2029  hypothetical protein  26.93 
 
 
348 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.850073 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0937  PerM family permease  27.41 
 
 
374 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1633  hypothetical protein  27.41 
 
 
352 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2503  hypothetical protein  27.41 
 
 
352 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4053  hypothetical protein  26.67 
 
 
361 aa  108  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.920687 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0289  hypothetical protein  27.41 
 
 
352 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.700262  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1102  hypothetical protein  24.32 
 
 
365 aa  108  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00400546  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2642  hypothetical protein  27.41 
 
 
352 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00776691  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2311  protein of unknown function UPF0118  26.56 
 
 
393 aa  107  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2998  hypothetical protein  26.63 
 
 
359 aa  107  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0020  hypothetical protein  27.41 
 
 
358 aa  106  8e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1950  protein of unknown function UPF0118  23.31 
 
 
346 aa  105  9e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.863146  normal  0.537489 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0810  protein of unknown function UPF0118  24.78 
 
 
351 aa  105  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0276  protein of unknown function UPF0118  22.35 
 
 
423 aa  105  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.133789  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2573  membrane protein  23.62 
 
 
361 aa  105  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0661  hypothetical protein  24.78 
 
 
351 aa  105  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0383  protein of unknown function UPF0118  30.91 
 
 
353 aa  104  2e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.810793  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3181  hypothetical protein  31.87 
 
 
419 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.423402  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0268  protein of unknown function UPF0118  23.12 
 
 
363 aa  103  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1563  hypothetical protein  25.98 
 
 
398 aa  103  6e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.78708  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4731  hypothetical protein  24.84 
 
 
359 aa  103  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.226742  hitchhiker  0.00240822 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1578  protein of unknown function UPF0118  23.92 
 
 
373 aa  102  8e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.373133  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3082  protein of unknown function UPF0118  24.44 
 
 
397 aa  102  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1267  protein of unknown function UPF0118  26.84 
 
 
371 aa  101  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0792338  normal  0.0741439 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4061  hypothetical protein  26.74 
 
 
351 aa  101  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2012  protein of unknown function UPF0118  28.15 
 
 
363 aa  101  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.578603 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4931  hypothetical protein  29.47 
 
 
353 aa  100  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.850306  normal  0.602485 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1653  hypothetical protein  28.81 
 
 
362 aa  100  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.212682  normal  0.81767 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0203  hypothetical protein  24.06 
 
 
362 aa  100  4e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2679  hypothetical protein  25.86 
 
 
352 aa  99.4  8e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0689913  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2448  hypothetical protein  22.66 
 
 
415 aa  98.6  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0466557  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0460  hypothetical protein  25.39 
 
 
352 aa  98.2  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.353952  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1705  hypothetical protein  25.3 
 
 
349 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.873743  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3487  hypothetical protein  24.55 
 
 
354 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0400  hypothetical protein  25.39 
 
 
372 aa  98.2  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.413713  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4162  hypothetical protein  25.45 
 
 
350 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0338  protein of unknown function UPF0118  24.13 
 
 
363 aa  97.1  4e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2221  lipoprotein, putative  26.32 
 
 
349 aa  96.3  8e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0102435  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0491  hypothetical protein  26.2 
 
 
359 aa  95.9  8e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000229793  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0785  hypothetical protein  29.89 
 
 
363 aa  95.9  9e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0785663 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0862  hypothetical protein  25.29 
 
 
360 aa  95.1  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2457  hypothetical protein  26.63 
 
 
362 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>