More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0491 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0491  hypothetical protein  100 
 
 		 359 aa  701    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000229793  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2012  protein of unknown function UPF0118  44.38 
 
 		 363 aa  278  1e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.578603 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2238  protein of unknown function UPF0118  44.95 
 
 		 379 aa  258  1e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.605073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0338  protein of unknown function UPF0118  43.98 
 
 		 363 aa  250  3e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2181  protein of unknown function UPF0118  41.79 
 
 		 376 aa  243  3e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00612132  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0203  hypothetical protein  42.48 
 
 		 362 aa  238  1e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1563  hypothetical protein  37.86 
 
 		 398 aa  236  6e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.78708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2369  hypothetical protein  44.63 
 
 		 357 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00120754  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0228  hypothetical protein  43.47 
 
 		 356 aa  221  9.999999999999999e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0826  hypothetical protein  33.63 
 
 		 369 aa  196  8.000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.981363  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4130  hypothetical protein  35.19 
 
 		 406 aa  195  9e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.189132  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4411  protein of unknown function UPF0118  33.53 
 
 		 389 aa  192  6e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2050  hypothetical protein  33.14 
 
 		 373 aa  182  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3492  hypothetical protein  30.95 
 
 		 387 aa  178  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.705437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0549  protein of unknown function UPF0118  32.35 
 
 		 384 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0941477  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1226  hypothetical protein  29.89 
 
 		 352 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3980  hypothetical protein  32.27 
 
 		 352 aa  172  5.999999999999999e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0869717 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0987  hypothetical protein  31.34 
 
 		 394 aa  172  9e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.89372 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0901  protein of unknown function UPF0118  33.12 
 
 		 365 aa  171  1e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1267  protein of unknown function UPF0118  32.68 
 
 		 371 aa  171  2e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0792338  normal  0.0741439 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2425  hypothetical protein  33.05 
 
 		 363 aa  171  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0338  hypothetical protein  31.62 
 
 		 365 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88474  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3950  protein of unknown function UPF0118  29.86 
 
 		 360 aa  168  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29820  hypothetical protein  31.96 
 
 		 352 aa  168  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0125581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2289  hypothetical protein  30.86 
 
 		 353 aa  167  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.864507  normal  0.333993 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2503  hypothetical protein  34.06 
 
 		 352 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0289  hypothetical protein  34.06 
 
 		 352 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.700262  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0253  hypothetical protein  34.06 
 
 		 352 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.077494  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2642  hypothetical protein  34.06 
 
 		 352 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00776691  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1436  hypothetical protein  34.06 
 
 		 352 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1633  hypothetical protein  34.06 
 
 		 352 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0937  PerM family permease  34.06 
 
 		 374 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2549  hypothetical protein  31.33 
 
 		 352 aa  163  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705186  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0529  hypothetical protein  33.44 
 
 		 352 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5533  hypothetical protein  30.59 
 
 		 355 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3807  hypothetical protein  30.68 
 
 		 353 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.911463  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3210  hypothetical protein  33.54 
 
 		 354 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.212604 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4556  hypothetical protein  30.68 
 
 		 398 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.173549  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3717  hypothetical protein  30.68 
 
 		 350 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0661403  normal  0.22421 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3708  hypothetical protein  31.14 
 
 		 355 aa  162  6e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.168874 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0488  hypothetical protein  31.05 
 
 		 371 aa  162  7e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.131577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1821  hypothetical protein  31.41 
 
 		 381 aa  161  1e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.693161 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1907  protein of unknown function UPF0118  31.41 
 
 		 352 aa  161  1e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3378  hypothetical protein  33.86 
 
 		 354 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0152  putative lipoprotein  29.25 
 
 		 361 aa  159  5e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1855  hypothetical protein  31.7 
 
 		 354 aa  159  9e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0258165 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3717  hypothetical protein  29.91 
 
 		 353 aa  158  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396811  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4931  hypothetical protein  41.05 
 
 		 353 aa  157  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.850306  normal  0.602485 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3427  hypothetical protein  32.84 
 
 		 355 aa  157  3e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1830  hypothetical protein  30.95 
 
 		 354 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3249  hypothetical protein  36.09 
 
 		 350 aa  157  3e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.691639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0540  protein of unknown function UPF0118  30.09 
 
 		 349 aa  157  4e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2083  hypothetical protein  32.55 
 
 		 356 aa  157  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.251587 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4988  hypothetical protein  30.97 
 
 		 347 aa  156  4e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2207  hypothetical protein  30.57 
 
 		 354 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3531  hypothetical protein  30.57 
 
 		 354 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.43917  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11000  hypothetical protein  29.02 
 
 		 346 aa  154  2.9999999999999998e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0737  hypothetical protein  37.37 
 
 		 356 aa  151  2e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.203827  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1653  hypothetical protein  30.46 
 
 		 362 aa  150  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.212682  normal  0.81767 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2868  hypothetical protein  30.17 
 
 		 358 aa  150  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838475  normal  0.0422213 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0020  hypothetical protein  32.5 
 
 		 358 aa  150  4e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4053  hypothetical protein  35.78 
 
 		 361 aa  150  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.920687 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2573  membrane protein  31.32 
 
 		 361 aa  147  4.0000000000000006e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0400  hypothetical protein  31.07 
 
 		 372 aa  147  4.0000000000000006e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.413713  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0460  hypothetical protein  31.55 
 
 		 352 aa  146  6e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.353952  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1102  hypothetical protein  32.12 
 
 		 365 aa  144  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00400546  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0292  hypothetical protein  23.6 
 
 		 391 aa  142  6e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002589  predicted permease  31.03 
 
 		 361 aa  142  9e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00334796  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7289  hypothetical protein  31.23 
 
 		 353 aa  138  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03420  hypothetical protein  30.65 
 
 		 361 aa  138  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4931  hypothetical protein  30 
 
 		 351 aa  137  4e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0783  hypothetical protein  29.07 
 
 		 353 aa  134  3e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2448  hypothetical protein  28.61 
 
 		 415 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0466557  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1154  hypothetical protein  25.64 
 
 		 358 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000550105  normal  0.0344505 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2998  hypothetical protein  31.1 
 
 		 359 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2413  hypothetical protein  27.06 
 
 		 345 aa  125  1e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.480547  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2709  hypothetical protein  25.55 
 
 		 362 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0582  hypothetical protein  27.61 
 
 		 367 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0275552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4026  hypothetical protein  27.02 
 
 		 360 aa  116  5e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0276  protein of unknown function UPF0118  26.9 
 
 		 423 aa  113  5e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.133789  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2676  hypothetical protein  27.16 
 
 		 388 aa  113  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0854  membrane protein  31.25 
 
 		 363 aa  113  6e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0563046  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1381  protein of unknown function UPF0118  26.69 
 
 		 371 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.0000000171014  decreased coverage  0.00070323 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4731  hypothetical protein  29.05 
 
 		 359 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.226742  hitchhiker  0.00240822 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3082  protein of unknown function UPF0118  28.31 
 
 		 397 aa  110  5e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2601  hypothetical protein  27.22 
 
 		 352 aa  108  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.99204  normal  0.455316 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0560  protein of unknown function UPF0118  26 
 
 		 339 aa  108  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2958  protein of unknown function UPF0118  36.21 
 
 		 339 aa  107  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11122  hypothetical protein  27.63 
 
 		 385 aa  107  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2229  hypothetical protein  33.14 
 
 		 392 aa  105  8e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0661  hypothetical protein  30.57 
 
 		 351 aa  105  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0810  protein of unknown function UPF0118  30.57 
 
 		 351 aa  105  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3189  protein of unknown function UPF0118  25.22 
 
 		 361 aa  105  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000846761  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1950  protein of unknown function UPF0118  28.31 
 
 		 346 aa  104  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.863146  normal  0.537489 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1868  hypothetical protein  37.65 
 
 		 399 aa  103  3e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0467497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2069  hypothetical protein  27.22 
 
 		 391 aa  103  5e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0264155 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3734  hypothetical protein  25.7 
 
 		 350 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2212  protein of unknown function UPF0118  28.19 
 
 		 355 aa  102  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000181482  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2679  hypothetical protein  31.34 
 
 		 352 aa  101  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0689913  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4945  protein of unknown function UPF0118  25.83 
 
 		 360 aa  99.4  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0255148  normal  0.175503 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>