More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0582 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0582  hypothetical protein  100 
 
 		 367 aa  709    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0275552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2676  hypothetical protein  83.86 
 
 		 388 aa  586  1e-166  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1381  protein of unknown function UPF0118  62.53 
 
 		 371 aa  426  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.0000000171014  decreased coverage  0.00070323 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3174  hypothetical protein  62.57 
 
 		 371 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169461  normal  0.752301 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1973  hypothetical protein  62.5 
 
 		 382 aa  379  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000012652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4200  hypothetical protein  46.5 
 
 		 346 aa  288  9e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2029  hypothetical protein  45.62 
 
 		 348 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.850073 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3734  hypothetical protein  46.29 
 
 		 350 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2221  lipoprotein, putative  46.2 
 
 		 349 aa  277  2e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0102435  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4162  hypothetical protein  46.59 
 
 		 350 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1705  hypothetical protein  46.88 
 
 		 349 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.873743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3487  hypothetical protein  47.68 
 
 		 354 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2457  hypothetical protein  46.29 
 
 		 362 aa  248  1e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4061  hypothetical protein  41.72 
 
 		 351 aa  240  2e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10160  hypothetical protein  45.35 
 
 		 364 aa  235  8e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.406243  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3648  hypothetical protein  42.03 
 
 		 354 aa  224  2e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.505772  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43510  hypothetical protein  42.03 
 
 		 355 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3486  hypothetical protein  35.54 
 
 		 375 aa  204  2e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.12464 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5665  hypothetical protein  37.43 
 
 		 362 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0192  protein of unknown function UPF0118  35.11 
 
 		 358 aa  188  1e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.146754  normal  0.226796 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0405  hypothetical protein  33.99 
 
 		 374 aa  182  1e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2633  hypothetical protein  33.33 
 
 		 365 aa  180  4.999999999999999e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1746  putative inner membrane protein  34.25 
 
 		 371 aa  179  9e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00422506 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1578  protein of unknown function UPF0118  33.04 
 
 		 373 aa  177  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.373133  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2709  hypothetical protein  32.22 
 
 		 362 aa  176  7e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3398  hypothetical protein  31.86 
 
 		 360 aa  176  8e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1844  putative inner membrane protein  30.51 
 
 		 367 aa  172  6.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1738  putative inner membrane protein  30.51 
 
 		 367 aa  172  6.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2209  hypothetical protein  33.99 
 
 		 409 aa  170  3e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0268  protein of unknown function UPF0118  31.27 
 
 		 363 aa  170  3e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1508  putative inner membrane protein  32.68 
 
 		 370 aa  170  4e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188442 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2597  putative inner membrane protein  30.79 
 
 		 365 aa  170  4e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0862  hypothetical protein  32.54 
 
 		 360 aa  170  5e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01657  predicted inner membrane protein  32.68 
 
 		 370 aa  168  1e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1954  protein of unknown function UPF0118  32.68 
 
 		 370 aa  168  1e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.133227  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1889  putative inner membrane protein  32.68 
 
 		 370 aa  168  1e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1769  putative inner membrane protein  32.68 
 
 		 370 aa  168  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2403  putative inner membrane protein  32.68 
 
 		 370 aa  168  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0340493 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1904  putative inner membrane protein  32.68 
 
 		 370 aa  168  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1943  putative inner membrane protein  32.68 
 
 		 370 aa  168  1e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000987664 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1690  putative inner membrane protein  31.86 
 
 		 370 aa  167  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.534784  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0661  hypothetical protein  36.5 
 
 		 351 aa  167  4e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0810  protein of unknown function UPF0118  36.5 
 
 		 351 aa  167  4e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0271  hypothetical protein  32.18 
 
 		 379 aa  165  9e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0297  hypothetical protein  31.73 
 
 		 379 aa  163  5.0000000000000005e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4043  protein of unknown function UPF0118  31.42 
 
 		 385 aa  162  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5187  hypothetical protein  30.9 
 
 		 381 aa  162  6e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.503723 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2175  hypothetical protein  32.43 
 
 		 366 aa  161  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0131226 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1658  putative inner membrane protein  32.94 
 
 		 364 aa  161  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2756  putative inner membrane protein  31.83 
 
 		 369 aa  160  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1686  hypothetical protein  31.39 
 
 		 390 aa  159  8e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2454  putative inner membrane protein  31.52 
 
 		 395 aa  158  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.272244  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2601  hypothetical protein  32.1 
 
 		 352 aa  156  6e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.99204  normal  0.455316 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1808  putative inner membrane protein  34.02 
 
 		 372 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1460  putative inner membrane protein  33.73 
 
 		 372 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.539422  normal  0.149027 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1979  putative inner membrane protein  33.73 
 
 		 372 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.591827  hitchhiker  0.00000561887 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1495  putative inner membrane protein  33.73 
 
 		 372 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138717 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1476  putative inner membrane protein  33.73 
 
 		 372 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.655079  hitchhiker  0.000276 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2098  hypothetical protein  32.67 
 
 		 368 aa  150  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2169  hypothetical protein  29.76 
 
 		 354 aa  147  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.344347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2819  hypothetical protein  27.47 
 
 		 369 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2299  hypothetical protein  32.72 
 
 		 356 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0984  hypothetical protein  32.72 
 
 		 356 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0752  hypothetical protein  32.53 
 
 		 365 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0379564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2741  hypothetical protein  27.16 
 
 		 369 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1067  hypothetical protein  32.41 
 
 		 356 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1843  hypothetical protein  28.57 
 
 		 383 aa  133  5e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06643  hypothetical protein  30.65 
 
 		 365 aa  132  9e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0748  hypothetical protein  31.12 
 
 		 365 aa  132  9e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1709  hypothetical protein  31.18 
 
 		 388 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.615575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0518  hypothetical protein  32.41 
 
 		 356 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1401  hypothetical protein  32.41 
 
 		 356 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0130  hypothetical protein  32.41 
 
 		 356 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1484  hypothetical protein  32.41 
 
 		 356 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0826  hypothetical protein  30.72 
 
 		 369 aa  130  5.0000000000000004e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.981363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2147  hypothetical protein  30.97 
 
 		 357 aa  129  6e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2910  hypothetical protein  27.47 
 
 		 369 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0691  hypothetical protein  28.3 
 
 		 377 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.627447 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6456  hypothetical protein  30.18 
 
 		 367 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.267604 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0593  hypothetical protein  28.18 
 
 		 376 aa  128  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.356961  normal  0.748294 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0714  permease  30.49 
 
 		 365 aa  126  5e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0333328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2900  hypothetical protein  29.15 
 
 		 379 aa  126  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1696  hypothetical protein  35.27 
 
 		 391 aa  126  5e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.551892  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1702  hypothetical protein  30.59 
 
 		 360 aa  127  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.221894  normal  0.568838 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4469  hypothetical protein  30.96 
 
 		 365 aa  126  5e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0580151  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4130  hypothetical protein  31.47 
 
 		 406 aa  123  4e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.189132  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0477  hypothetical protein  26.84 
 
 		 368 aa  123  5e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4321  hypothetical protein  28.83 
 
 		 380 aa  123  6e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0949244  normal  0.333615 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4608  hypothetical protein  28.61 
 
 		 370 aa  122  8e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.991825  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4411  protein of unknown function UPF0118  31.18 
 
 		 389 aa  122  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0491  hypothetical protein  27.61 
 
 		 359 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000229793  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4274  hypothetical protein  28.53 
 
 		 356 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.444788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001141  hypothetical protein  29.33 
 
 		 382 aa  120  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3243  hypothetical protein  28.22 
 
 		 356 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.340258  normal  0.654322 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3551  hypothetical protein  26.86 
 
 		 364 aa  119  7e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3036  protein of unknown function UPF0118  25.3 
 
 		 363 aa  119  9e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3084  protein of unknown function UPF0118  25.3 
 
 		 363 aa  119  9e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44170  hypothetical protein  29.78 
 
 		 368 aa  118  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.392978  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0013  hypothetical protein  30.89 
 
 		 363 aa  118  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00247664 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0479  hypothetical protein  26.27 
 
 		 372 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>