More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3189 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_3189  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 		 361 aa  696    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000846761  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1154  hypothetical protein  41.55 
 
 		 358 aa  260  3e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000550105  normal  0.0344505 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0854  membrane protein  43.24 
 
 		 363 aa  252  8.000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0563046  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0783  hypothetical protein  38.73 
 
 		 353 aa  248  2e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2212  protein of unknown function UPF0118  34.65 
 
 		 355 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000181482  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2015  protein of unknown function UPF0118  34.39 
 
 		 354 aa  166  5e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000281213 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2207  hypothetical protein  30.53 
 
 		 354 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3531  hypothetical protein  30.53 
 
 		 354 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.43917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1855  hypothetical protein  31.09 
 
 		 354 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0258165 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11000  hypothetical protein  30.48 
 
 		 346 aa  145  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3717  hypothetical protein  31.93 
 
 		 353 aa  145  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396811  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1830  hypothetical protein  30 
 
 		 354 aa  143  5e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4026  hypothetical protein  29.28 
 
 		 360 aa  142  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0020  hypothetical protein  33.04 
 
 		 358 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0268  protein of unknown function UPF0118  30.2 
 
 		 363 aa  139  6e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0987  hypothetical protein  28.62 
 
 		 394 aa  139  8.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.89372 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3492  hypothetical protein  29.2 
 
 		 387 aa  138  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.705437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0549  protein of unknown function UPF0118  28.21 
 
 		 384 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0941477  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3210  hypothetical protein  30.3 
 
 		 354 aa  137  4e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.212604 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2083  hypothetical protein  29.38 
 
 		 356 aa  136  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.251587 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2549  hypothetical protein  31.25 
 
 		 352 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705186  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1578  protein of unknown function UPF0118  32.49 
 
 		 373 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.373133  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3980  hypothetical protein  30.37 
 
 		 352 aa  134  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0869717 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3378  hypothetical protein  30.3 
 
 		 354 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29820  hypothetical protein  29.87 
 
 		 352 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0125581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2098  hypothetical protein  33.24 
 
 		 368 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1381  protein of unknown function UPF0118  32 
 
 		 371 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.0000000171014  decreased coverage  0.00070323 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1102  hypothetical protein  31.76 
 
 		 365 aa  130  3e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00400546  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0488  hypothetical protein  28.57 
 
 		 371 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.131577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0901  protein of unknown function UPF0118  28.26 
 
 		 365 aa  129  6e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2868  hypothetical protein  27.22 
 
 		 358 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838475  normal  0.0422213 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0529  hypothetical protein  28.13 
 
 		 352 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3950  protein of unknown function UPF0118  28.93 
 
 		 360 aa  128  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1907  protein of unknown function UPF0118  31.35 
 
 		 352 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1821  hypothetical protein  30.95 
 
 		 381 aa  126  5e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.693161 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2573  membrane protein  28.24 
 
 		 361 aa  126  5e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0338  hypothetical protein  29.59 
 
 		 365 aa  126  6e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88474  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2425  hypothetical protein  28.36 
 
 		 363 aa  126  7e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7289  hypothetical protein  29.33 
 
 		 353 aa  125  8.000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1226  hypothetical protein  29.19 
 
 		 352 aa  125  9e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3181  hypothetical protein  29.35 
 
 		 419 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.423402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4731  hypothetical protein  28.61 
 
 		 359 aa  124  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.226742  hitchhiker  0.00240822 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4988  hypothetical protein  26.21 
 
 		 347 aa  124  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0152  putative lipoprotein  28.32 
 
 		 361 aa  123  5e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2289  hypothetical protein  26.86 
 
 		 353 aa  123  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.864507  normal  0.333993 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0826  hypothetical protein  26.99 
 
 		 369 aa  123  5e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.981363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0937  PerM family permease  27.83 
 
 		 374 aa  122  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4053  hypothetical protein  28.78 
 
 		 361 aa  122  7e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.920687 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4411  protein of unknown function UPF0118  28.49 
 
 		 389 aa  122  8e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0253  hypothetical protein  27.83 
 
 		 352 aa  122  8e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.077494  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1436  hypothetical protein  27.83 
 
 		 352 aa  122  8e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0289  hypothetical protein  27.83 
 
 		 352 aa  122  8e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.700262  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2503  hypothetical protein  27.83 
 
 		 352 aa  122  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2642  hypothetical protein  27.83 
 
 		 352 aa  122  8e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00776691  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1633  hypothetical protein  27.83 
 
 		 352 aa  122  8e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3082  protein of unknown function UPF0118  29.05 
 
 		 397 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0560  protein of unknown function UPF0118  27.62 
 
 		 339 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2676  hypothetical protein  29.03 
 
 		 388 aa  120  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4130  hypothetical protein  28.48 
 
 		 406 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.189132  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2448  hypothetical protein  29.07 
 
 		 415 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0466557  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2709  hypothetical protein  28.41 
 
 		 362 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3734  hypothetical protein  30.72 
 
 		 350 aa  119  7e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2998  hypothetical protein  29.53 
 
 		 359 aa  119  9e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0661  hypothetical protein  31.99 
 
 		 351 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4064  permease  28.48 
 
 		 349 aa  119  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0582  hypothetical protein  29.28 
 
 		 367 aa  119  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0275552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0810  protein of unknown function UPF0118  31.99 
 
 		 351 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2050  hypothetical protein  26.89 
 
 		 373 aa  119  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0737  hypothetical protein  29.65 
 
 		 356 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.203827  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3174  hypothetical protein  32.29 
 
 		 371 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169461  normal  0.752301 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3807  hypothetical protein  27.14 
 
 		 353 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.911463  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0111  hypothetical protein  28.11 
 
 		 391 aa  117  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.239724 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3717  hypothetical protein  27.14 
 
 		 350 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0661403  normal  0.22421 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4556  hypothetical protein  26.91 
 
 		 398 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.173549  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1973  hypothetical protein  32.61 
 
 		 382 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000012652  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2416  protein of unknown function UPF0118  26.4 
 
 		 378 aa  117  3.9999999999999997e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.25064  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0292  hypothetical protein  26.48 
 
 		 391 aa  117  3.9999999999999997e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0540  protein of unknown function UPF0118  25.15 
 
 		 349 aa  116  6.9999999999999995e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2029  hypothetical protein  29.5 
 
 		 348 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.850073 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5533  hypothetical protein  26.35 
 
 		 355 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2229  hypothetical protein  24.66 
 
 		 392 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4931  hypothetical protein  29.06 
 
 		 351 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3708  hypothetical protein  26.06 
 
 		 355 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.168874 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4931  hypothetical protein  28.36 
 
 		 353 aa  114  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.850306  normal  0.602485 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4200  hypothetical protein  29.19 
 
 		 346 aa  113  5e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0491  hypothetical protein  26.38 
 
 		 359 aa  113  6e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000229793  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2209  hypothetical protein  27.76 
 
 		 409 aa  112  8.000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0336  hypothetical protein  25.56 
 
 		 372 aa  112  9e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000639163  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3249  hypothetical protein  27.81 
 
 		 350 aa  112  9e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.691639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0297  hypothetical protein  27.84 
 
 		 379 aa  112  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0215  hypothetical protein  27.24 
 
 		 406 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.776259 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0013  hypothetical protein  31.72 
 
 		 363 aa  111  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00247664 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0271  hypothetical protein  27.84 
 
 		 379 aa  111  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2679  hypothetical protein  30.18 
 
 		 352 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0689913  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1564  putative transmembrane transport protein  27.24 
 
 		 406 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1267  protein of unknown function UPF0118  27.55 
 
 		 371 aa  110  3e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0792338  normal  0.0741439 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1838  protein of unknown function UPF0118  29.02 
 
 		 398 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00200619  normal  0.0419691 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1275  hypothetical protein  27.47 
 
 		 354 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03420  hypothetical protein  29.48 
 
 		 361 aa  110  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1563  hypothetical protein  28.14 
 
 		 398 aa  110  4.0000000000000004e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.78708  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>