More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1102 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1102  hypothetical protein  100 
 
 		 365 aa  725    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00400546  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0152  putative lipoprotein  44.78 
 
 		 361 aa  298  1e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2573  membrane protein  42.62 
 
 		 361 aa  287  2e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0292  hypothetical protein  39.82 
 
 		 391 aa  284  2.0000000000000002e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002589  predicted permease  44.72 
 
 		 361 aa  271  1e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00334796  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03420  hypothetical protein  44.75 
 
 		 361 aa  257  2e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2448  hypothetical protein  38.79 
 
 		 415 aa  237  3e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0466557  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2294  hypothetical protein  40.17 
 
 		 360 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3082  protein of unknown function UPF0118  40 
 
 		 397 aa  231  1e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1868  hypothetical protein  38.91 
 
 		 399 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0467497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2012  protein of unknown function UPF0118  31.85 
 
 		 363 aa  165  9e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.578603 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1154  hypothetical protein  28.65 
 
 		 358 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000550105  normal  0.0344505 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4026  hypothetical protein  31.52 
 
 		 360 aa  165  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29820  hypothetical protein  32.82 
 
 		 352 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0125581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2549  hypothetical protein  32.19 
 
 		 352 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705186  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2289  hypothetical protein  32.2 
 
 		 353 aa  160  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.864507  normal  0.333993 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4130  hypothetical protein  31.94 
 
 		 406 aa  157  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.189132  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5533  hypothetical protein  32.19 
 
 		 355 aa  157  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3708  hypothetical protein  32.19 
 
 		 355 aa  156  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.168874 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2425  hypothetical protein  32.46 
 
 		 363 aa  156  5.0000000000000005e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4411  protein of unknown function UPF0118  31.02 
 
 		 389 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3717  hypothetical protein  31.91 
 
 		 350 aa  156  6e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0661403  normal  0.22421 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4556  hypothetical protein  31.91 
 
 		 398 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.173549  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3807  hypothetical protein  31.91 
 
 		 353 aa  155  8e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.911463  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0854  membrane protein  32.02 
 
 		 363 aa  153  4e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0563046  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0491  hypothetical protein  31.96 
 
 		 359 aa  152  7e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000229793  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0338  protein of unknown function UPF0118  30.91 
 
 		 363 aa  151  1e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3492  hypothetical protein  33.05 
 
 		 387 aa  151  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.705437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0540  protein of unknown function UPF0118  33.61 
 
 		 349 aa  151  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1707  protein of unknown function UPF0118  39.73 
 
 		 504 aa  150  3e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2238  protein of unknown function UPF0118  29.62 
 
 		 379 aa  150  4e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.605073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0560  protein of unknown function UPF0118  29.66 
 
 		 339 aa  149  6e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2642  hypothetical protein  33.13 
 
 		 352 aa  149  9e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00776691  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0253  hypothetical protein  33.13 
 
 		 352 aa  149  9e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.077494  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0289  hypothetical protein  33.13 
 
 		 352 aa  149  9e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.700262  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1436  hypothetical protein  33.13 
 
 		 352 aa  149  9e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1633  hypothetical protein  33.13 
 
 		 352 aa  149  9e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2503  hypothetical protein  33.13 
 
 		 352 aa  149  9e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0937  PerM family permease  33.13 
 
 		 374 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0529  hypothetical protein  31.33 
 
 		 352 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0203  hypothetical protein  31.18 
 
 		 362 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0549  protein of unknown function UPF0118  30.75 
 
 		 384 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0941477  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0338  hypothetical protein  32.87 
 
 		 365 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88474  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4053  hypothetical protein  32.73 
 
 		 361 aa  147  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.920687 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2050  hypothetical protein  33.43 
 
 		 373 aa  147  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0826  hypothetical protein  34.51 
 
 		 369 aa  145  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.981363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1226  hypothetical protein  30.92 
 
 		 352 aa  144  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0783  hypothetical protein  28.83 
 
 		 353 aa  143  5e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4931  hypothetical protein  32.32 
 
 		 353 aa  142  8e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.850306  normal  0.602485 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11000  hypothetical protein  30.54 
 
 		 346 aa  142  9e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3980  hypothetical protein  34.42 
 
 		 352 aa  142  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0869717 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1563  hypothetical protein  29.49 
 
 		 398 aa  142  9.999999999999999e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.78708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0987  hypothetical protein  32.4 
 
 		 394 aa  140  4.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.89372 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2207  hypothetical protein  30.56 
 
 		 354 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2083  hypothetical protein  31.5 
 
 		 356 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.251587 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3531  hypothetical protein  30.56 
 
 		 354 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.43917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2868  hypothetical protein  30.5 
 
 		 358 aa  136  5e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838475  normal  0.0422213 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1830  hypothetical protein  31 
 
 		 354 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0901  protein of unknown function UPF0118  29.67 
 
 		 365 aa  136  7.000000000000001e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3717  hypothetical protein  30.46 
 
 		 353 aa  135  8e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396811  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1732  protein of unknown function UPF0118  32.07 
 
 		 355 aa  135  9e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000390095  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2181  protein of unknown function UPF0118  29.53 
 
 		 376 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00612132  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3950  protein of unknown function UPF0118  31.35 
 
 		 360 aa  135  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1653  hypothetical protein  30.36 
 
 		 362 aa  134  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.212682  normal  0.81767 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1855  hypothetical protein  29.65 
 
 		 354 aa  133  5e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0258165 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0488  hypothetical protein  28.86 
 
 		 371 aa  133  6e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.131577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0020  hypothetical protein  37.09 
 
 		 358 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1907  protein of unknown function UPF0118  35.4 
 
 		 352 aa  130  3e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0228  hypothetical protein  33.23 
 
 		 356 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1821  hypothetical protein  35.4 
 
 		 381 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.693161 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4931  hypothetical protein  31.37 
 
 		 351 aa  130  5.0000000000000004e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7289  hypothetical protein  31.31 
 
 		 353 aa  129  6e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3189  protein of unknown function UPF0118  30.97 
 
 		 361 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000846761  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4988  hypothetical protein  29.45 
 
 		 347 aa  126  6e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3210  hypothetical protein  30.91 
 
 		 354 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.212604 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0737  hypothetical protein  40.23 
 
 		 356 aa  125  1e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.203827  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3378  hypothetical protein  30.5 
 
 		 354 aa  124  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2212  protein of unknown function UPF0118  27.51 
 
 		 355 aa  122  7e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000181482  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2369  hypothetical protein  29.57 
 
 		 357 aa  122  7e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00120754  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2998  hypothetical protein  34.71 
 
 		 359 aa  122  8e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0400  hypothetical protein  29.55 
 
 		 372 aa  120  3e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.413713  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3249  hypothetical protein  39.2 
 
 		 350 aa  120  4.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.691639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2413  hypothetical protein  26.93 
 
 		 345 aa  119  6e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.480547  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2958  protein of unknown function UPF0118  30.4 
 
 		 339 aa  118  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0785  hypothetical protein  27.22 
 
 		 363 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0785663 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0460  hypothetical protein  29.65 
 
 		 352 aa  117  3.9999999999999997e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.353952  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3427  hypothetical protein  27.98 
 
 		 355 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4731  hypothetical protein  26.77 
 
 		 359 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.226742  hitchhiker  0.00240822 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0916  protein of unknown function UPF0118  25.37 
 
 		 355 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.116301  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1267  protein of unknown function UPF0118  25.6 
 
 		 371 aa  114  3e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0792338  normal  0.0741439 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2229  hypothetical protein  31.71 
 
 		 392 aa  112  9e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0276  protein of unknown function UPF0118  26.84 
 
 		 423 aa  111  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.133789  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2416  protein of unknown function UPF0118  26.85 
 
 		 378 aa  110  3e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.25064  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3181  hypothetical protein  28.25 
 
 		 419 aa  110  6e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.423402  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1950  protein of unknown function UPF0118  32.97 
 
 		 346 aa  108  1e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.863146  normal  0.537489 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2709  hypothetical protein  26.16 
 
 		 362 aa  107  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3734  hypothetical protein  29.32 
 
 		 350 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0268  protein of unknown function UPF0118  26.57 
 
 		 363 aa  108  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11122  hypothetical protein  27.85 
 
 		 385 aa  105  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1705  hypothetical protein  29.05 
 
 		 349 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.873743  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>