More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1950 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1950  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 		 346 aa  666    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.863146  normal  0.537489 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0560  protein of unknown function UPF0118  38.33 
 
 		 339 aa  244  1.9999999999999999e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2958  protein of unknown function UPF0118  35.55 
 
 		 339 aa  182  1e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2610  protein of unknown function UPF0118  35.03 
 
 		 370 aa  179  5.999999999999999e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1111  protein of unknown function UPF0118  34.41 
 
 		 381 aa  164  3e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2311  protein of unknown function UPF0118  33.93 
 
 		 393 aa  163  5.0000000000000005e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0940  protein of unknown function UPF0118  32.41 
 
 		 345 aa  156  6e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.726387  normal  0.96935 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0398  protein of unknown function UPF0118  35.91 
 
 		 425 aa  146  4.0000000000000006e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.0034127  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0549  protein of unknown function UPF0118  29.48 
 
 		 384 aa  133  5e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0941477  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2083  hypothetical protein  29.14 
 
 		 356 aa  122  8e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.251587 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3492  hypothetical protein  28.41 
 
 		 387 aa  121  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.705437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0292  hypothetical protein  26.17 
 
 		 391 aa  121  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0987  hypothetical protein  28.41 
 
 		 394 aa  120  3e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.89372 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11000  hypothetical protein  26.48 
 
 		 346 aa  120  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0901  protein of unknown function UPF0118  30.8 
 
 		 365 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3950  protein of unknown function UPF0118  26.65 
 
 		 360 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1226  hypothetical protein  31.03 
 
 		 352 aa  117  3e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4988  hypothetical protein  28.17 
 
 		 347 aa  117  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29820  hypothetical protein  26.84 
 
 		 352 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0125581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1154  hypothetical protein  26.92 
 
 		 358 aa  116  5e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000550105  normal  0.0344505 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0488  hypothetical protein  34.04 
 
 		 371 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.131577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3531  hypothetical protein  30.49 
 
 		 354 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.43917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3249  hypothetical protein  34.76 
 
 		 350 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.691639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0826  hypothetical protein  27.97 
 
 		 369 aa  115  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.981363  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2207  hypothetical protein  30.49 
 
 		 354 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3980  hypothetical protein  30.43 
 
 		 352 aa  114  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0869717 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3210  hypothetical protein  27.99 
 
 		 354 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.212604 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2549  hypothetical protein  26.32 
 
 		 352 aa  113  6e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705186  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2289  hypothetical protein  28.37 
 
 		 353 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.864507  normal  0.333993 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3378  hypothetical protein  28.01 
 
 		 354 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1830  hypothetical protein  32.6 
 
 		 354 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1821  hypothetical protein  30.99 
 
 		 381 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.693161 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1907  protein of unknown function UPF0118  30.99 
 
 		 352 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0338  hypothetical protein  26.35 
 
 		 365 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88474  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1653  hypothetical protein  29.83 
 
 		 362 aa  110  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.212682  normal  0.81767 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4931  hypothetical protein  28.57 
 
 		 351 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2050  hypothetical protein  27.65 
 
 		 373 aa  110  4.0000000000000004e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4411  protein of unknown function UPF0118  26.78 
 
 		 389 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3708  hypothetical protein  34.81 
 
 		 355 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.168874 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4130  hypothetical protein  26.78 
 
 		 406 aa  108  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.189132  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2448  hypothetical protein  25.38 
 
 		 415 aa  108  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0466557  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2238  protein of unknown function UPF0118  28.9 
 
 		 379 aa  108  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.605073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1563  hypothetical protein  29.74 
 
 		 398 aa  108  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.78708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2425  hypothetical protein  30.77 
 
 		 363 aa  108  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1855  hypothetical protein  31.49 
 
 		 354 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0258165 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0529  hypothetical protein  34.81 
 
 		 352 aa  108  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2229  hypothetical protein  31.28 
 
 		 392 aa  107  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5533  hypothetical protein  34.25 
 
 		 355 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3734  hypothetical protein  32.83 
 
 		 350 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4931  hypothetical protein  34.81 
 
 		 353 aa  107  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.850306  normal  0.602485 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2868  hypothetical protein  29.58 
 
 		 358 aa  106  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838475  normal  0.0422213 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2413  hypothetical protein  25.82 
 
 		 345 aa  106  5e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.480547  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3717  hypothetical protein  34.81 
 
 		 350 aa  106  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0661403  normal  0.22421 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0268  protein of unknown function UPF0118  33.88 
 
 		 363 aa  106  6e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4556  hypothetical protein  34.81 
 
 		 398 aa  106  6e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.173549  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3807  hypothetical protein  34.81 
 
 		 353 aa  106  6e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.911463  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0783  hypothetical protein  25.21 
 
 		 353 aa  106  6e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0540  protein of unknown function UPF0118  27.12 
 
 		 349 aa  106  7e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0152  putative lipoprotein  23.99 
 
 		 361 aa  105  9e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2012  protein of unknown function UPF0118  26.64 
 
 		 363 aa  105  9e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.578603 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0737  hypothetical protein  26.63 
 
 		 356 aa  105  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.203827  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0020  hypothetical protein  30.73 
 
 		 358 aa  105  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3427  hypothetical protein  27.53 
 
 		 355 aa  105  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3487  hypothetical protein  34.14 
 
 		 354 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1578  protein of unknown function UPF0118  33.47 
 
 		 373 aa  104  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.373133  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0491  hypothetical protein  28.31 
 
 		 359 aa  104  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000229793  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3717  hypothetical protein  31.52 
 
 		 353 aa  104  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396811  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0203  hypothetical protein  26.18 
 
 		 362 aa  104  3e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4053  hypothetical protein  26.58 
 
 		 361 aa  104  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.920687 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0271  hypothetical protein  31.58 
 
 		 379 aa  103  5e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1102  hypothetical protein  33.53 
 
 		 365 aa  103  5e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00400546  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0937  PerM family permease  27.7 
 
 		 374 aa  103  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4200  hypothetical protein  31.1 
 
 		 346 aa  103  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4162  hypothetical protein  33.43 
 
 		 350 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2503  hypothetical protein  28.53 
 
 		 352 aa  102  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0253  hypothetical protein  28.53 
 
 		 352 aa  102  7e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.077494  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0916  protein of unknown function UPF0118  21.97 
 
 		 355 aa  102  7e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.116301  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1436  hypothetical protein  28.53 
 
 		 352 aa  102  7e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0289  hypothetical protein  28.53 
 
 		 352 aa  102  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.700262  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1633  hypothetical protein  28.53 
 
 		 352 aa  102  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2642  hypothetical protein  28.53 
 
 		 352 aa  102  7e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00776691  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1705  hypothetical protein  33.43 
 
 		 349 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.873743  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0854  membrane protein  28.09 
 
 		 363 aa  102  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0563046  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2709  hypothetical protein  26.71 
 
 		 362 aa  101  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4349  hypothetical protein  28.23 
 
 		 400 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.632987  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2573  membrane protein  24.86 
 
 		 361 aa  102  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0297  hypothetical protein  31.76 
 
 		 379 aa  102  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0582  hypothetical protein  28.74 
 
 		 367 aa  102  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0275552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4118  hypothetical protein  28.23 
 
 		 400 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00655828  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1732  protein of unknown function UPF0118  26.72 
 
 		 355 aa  102  1e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000390095  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4193  hypothetical protein  28.23 
 
 		 400 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.662681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2029  hypothetical protein  31.53 
 
 		 348 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.850073 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2998  hypothetical protein  38.06 
 
 		 359 aa  101  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2181  protein of unknown function UPF0118  29.11 
 
 		 376 aa  100  4e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00612132  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1300  protein of unknown function UPF0118  23.96 
 
 		 345 aa  98.2  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.316018  normal  0.608638 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2069  hypothetical protein  26.27 
 
 		 391 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0264155 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4731  hypothetical protein  32.78 
 
 		 359 aa  97.1  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.226742  hitchhiker  0.00240822 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3082  protein of unknown function UPF0118  31.18 
 
 		 397 aa  97.1  4e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0276  protein of unknown function UPF0118  28.51 
 
 		 423 aa  97.1  4e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.133789  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0338  protein of unknown function UPF0118  24.18 
 
 		 363 aa  96.7  6e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>