More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3249 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_3249  hypothetical protein  100 
 
 
350 aa  687    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.691639  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3980  hypothetical protein  72.21 
 
 
352 aa  501  1e-141  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0869717 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1907  protein of unknown function UPF0118  75.14 
 
 
352 aa  481  1e-135  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1821  hypothetical protein  75.14 
 
 
381 aa  482  1e-135  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.693161 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3492  hypothetical protein  69.03 
 
 
387 aa  460  9.999999999999999e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.705437  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2549  hypothetical protein  65.6 
 
 
352 aa  434  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705186  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29820  hypothetical protein  65.89 
 
 
352 aa  432  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0125581  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0737  hypothetical protein  63.66 
 
 
356 aa  424  1e-117  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.203827  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3950  protein of unknown function UPF0118  60.35 
 
 
360 aa  419  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0987  hypothetical protein  60.64 
 
 
394 aa  419  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.89372 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2083  hypothetical protein  57.14 
 
 
356 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.251587 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1226  hypothetical protein  59.59 
 
 
352 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0338  hypothetical protein  58.19 
 
 
365 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88474  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3717  hypothetical protein  55.98 
 
 
353 aa  389  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396811  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2289  hypothetical protein  55.43 
 
 
353 aa  389  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.864507  normal  0.333993 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4053  hypothetical protein  61.92 
 
 
361 aa  390  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.920687 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2207  hypothetical protein  56.4 
 
 
354 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3708  hypothetical protein  55.43 
 
 
355 aa  381  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.168874 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3531  hypothetical protein  55.81 
 
 
354 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.43917  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0540  protein of unknown function UPF0118  60.42 
 
 
349 aa  381  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3717  hypothetical protein  56.29 
 
 
350 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0661403  normal  0.22421 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4556  hypothetical protein  56.29 
 
 
398 aa  381  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.173549  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5533  hypothetical protein  55.71 
 
 
355 aa  381  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3807  hypothetical protein  56.29 
 
 
353 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.911463  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1830  hypothetical protein  55.81 
 
 
354 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0549  protein of unknown function UPF0118  55.33 
 
 
384 aa  378  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0941477  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1855  hypothetical protein  55.81 
 
 
354 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0258165 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3378  hypothetical protein  56.98 
 
 
354 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3210  hypothetical protein  55.81 
 
 
354 aa  375  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.212604 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2503  hypothetical protein  60.62 
 
 
352 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0253  hypothetical protein  60.62 
 
 
352 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.077494  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0937  PerM family permease  60.62 
 
 
374 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1436  hypothetical protein  60.62 
 
 
352 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0529  hypothetical protein  60.94 
 
 
352 aa  372  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0289  hypothetical protein  60.62 
 
 
352 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.700262  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1633  hypothetical protein  60.62 
 
 
352 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2642  hypothetical protein  60.62 
 
 
352 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00776691  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0488  hypothetical protein  55.56 
 
 
371 aa  360  2e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.131577  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4931  hypothetical protein  57.27 
 
 
353 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.850306  normal  0.602485 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11000  hypothetical protein  50.29 
 
 
346 aa  353  2e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1653  hypothetical protein  53.16 
 
 
362 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.212682  normal  0.81767 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7289  hypothetical protein  53.49 
 
 
353 aa  350  3e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2998  hypothetical protein  57.1 
 
 
359 aa  348  8e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4931  hypothetical protein  53.18 
 
 
351 aa  345  1e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0020  hypothetical protein  53.71 
 
 
358 aa  342  8e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3427  hypothetical protein  51.16 
 
 
355 aa  338  9.999999999999999e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2050  hypothetical protein  47.31 
 
 
373 aa  326  3e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0901  protein of unknown function UPF0118  50.63 
 
 
365 aa  325  1e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4988  hypothetical protein  46.06 
 
 
347 aa  323  3e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0826  hypothetical protein  46.55 
 
 
369 aa  322  8e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.981363  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0460  hypothetical protein  49.57 
 
 
352 aa  317  3e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.353952  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0400  hypothetical protein  49.57 
 
 
372 aa  316  3e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.413713  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4411  protein of unknown function UPF0118  46.41 
 
 
389 aa  314  9.999999999999999e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4130  hypothetical protein  45.81 
 
 
406 aa  311  9e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.189132  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2868  hypothetical protein  47.48 
 
 
358 aa  311  2e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838475  normal  0.0422213 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2425  hypothetical protein  46.45 
 
 
363 aa  295  8e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1267  protein of unknown function UPF0118  40.29 
 
 
371 aa  253  5.000000000000001e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0792338  normal  0.0741439 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2012  protein of unknown function UPF0118  31.72 
 
 
363 aa  179  4.999999999999999e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.578603 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0491  hypothetical protein  31.87 
 
 
359 aa  170  4e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000229793  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0338  protein of unknown function UPF0118  32.52 
 
 
363 aa  169  5e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1154  hypothetical protein  32.02 
 
 
358 aa  165  8e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000550105  normal  0.0344505 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2238  protein of unknown function UPF0118  29.97 
 
 
379 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.605073  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0203  hypothetical protein  31.29 
 
 
362 aa  164  3e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4731  hypothetical protein  33.02 
 
 
359 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.226742  hitchhiker  0.00240822 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0783  hypothetical protein  31.25 
 
 
353 aa  157  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2181  protein of unknown function UPF0118  32.78 
 
 
376 aa  152  8.999999999999999e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00612132  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0228  hypothetical protein  33.33 
 
 
356 aa  151  2e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0854  membrane protein  31.55 
 
 
363 aa  146  6e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0563046  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2573  membrane protein  31.2 
 
 
361 aa  144  3e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1563  hypothetical protein  34.1 
 
 
398 aa  144  3e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.78708  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0560  protein of unknown function UPF0118  29.15 
 
 
339 aa  140  3e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0152  putative lipoprotein  29.18 
 
 
361 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2679  hypothetical protein  35.39 
 
 
352 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0689913  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2311  protein of unknown function UPF0118  30.61 
 
 
393 aa  135  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0292  hypothetical protein  28.35 
 
 
391 aa  134  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2709  hypothetical protein  30.84 
 
 
362 aa  130  3e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2369  hypothetical protein  30.7 
 
 
357 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00120754  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0940  protein of unknown function UPF0118  30.25 
 
 
345 aa  127  3e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.726387  normal  0.96935 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4026  hypothetical protein  28.62 
 
 
360 aa  125  9e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1950  protein of unknown function UPF0118  30.4 
 
 
346 aa  125  9e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.863146  normal  0.537489 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0916  protein of unknown function UPF0118  26.48 
 
 
355 aa  125  1e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.116301  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2229  hypothetical protein  29.52 
 
 
392 aa  125  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2610  protein of unknown function UPF0118  28.66 
 
 
370 aa  124  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2413  hypothetical protein  26.84 
 
 
345 aa  124  3e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.480547  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0810  protein of unknown function UPF0118  30.18 
 
 
351 aa  123  5e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0661  hypothetical protein  30.18 
 
 
351 aa  123  5e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2601  hypothetical protein  31.71 
 
 
352 aa  122  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.99204  normal  0.455316 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0271  hypothetical protein  29.89 
 
 
379 aa  121  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3189  protein of unknown function UPF0118  27.81 
 
 
361 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000846761  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2212  protein of unknown function UPF0118  27.09 
 
 
355 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000181482  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0297  hypothetical protein  29.78 
 
 
379 aa  117  3e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0268  protein of unknown function UPF0118  28.57 
 
 
363 aa  116  5e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0792  protein of unknown function UPF0118  23.85 
 
 
344 aa  116  6e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.101192 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1102  hypothetical protein  31.13 
 
 
365 aa  113  5e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00400546  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1578  protein of unknown function UPF0118  28.4 
 
 
373 aa  113  6e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.373133  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0398  protein of unknown function UPF0118  30.82 
 
 
425 aa  112  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.0034127  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2294  hypothetical protein  31.92 
 
 
360 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002589  predicted permease  28.32 
 
 
361 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00334796  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2448  hypothetical protein  27.73 
 
 
415 aa  109  6e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0466557  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0276  protein of unknown function UPF0118  27.94 
 
 
423 aa  109  6e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.133789  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>