More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_1226 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_1226  hypothetical protein  100 
 
 
352 aa  693    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2549  hypothetical protein  68.02 
 
 
352 aa  464  1e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705186  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29820  hypothetical protein  67.73 
 
 
352 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0125581  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3492  hypothetical protein  61.25 
 
 
387 aa  437  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.705437  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0737  hypothetical protein  59.54 
 
 
356 aa  423  1e-117  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.203827  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3980  hypothetical protein  61.93 
 
 
352 aa  423  1e-117  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0869717 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3950  protein of unknown function UPF0118  59.14 
 
 
360 aa  423  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2207  hypothetical protein  57.47 
 
 
354 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3717  hypothetical protein  58.33 
 
 
353 aa  412  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396811  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2289  hypothetical protein  60.23 
 
 
353 aa  414  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.864507  normal  0.333993 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0987  hypothetical protein  58.67 
 
 
394 aa  412  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.89372 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3378  hypothetical protein  59.08 
 
 
354 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3531  hypothetical protein  56.9 
 
 
354 aa  408  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.43917  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1907  protein of unknown function UPF0118  63.3 
 
 
352 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3210  hypothetical protein  58.21 
 
 
354 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.212604 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1855  hypothetical protein  57.47 
 
 
354 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0258165 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1821  hypothetical protein  63.3 
 
 
381 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.693161 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1830  hypothetical protein  57.18 
 
 
354 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4053  hypothetical protein  62.17 
 
 
361 aa  404  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.920687 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3708  hypothetical protein  59.65 
 
 
355 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.168874 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4556  hypothetical protein  59.08 
 
 
398 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.173549  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5533  hypothetical protein  59.65 
 
 
355 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3807  hypothetical protein  59.08 
 
 
353 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.911463  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3717  hypothetical protein  59.08 
 
 
350 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0661403  normal  0.22421 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0529  hypothetical protein  60.29 
 
 
352 aa  394  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2083  hypothetical protein  56.1 
 
 
356 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.251587 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0540  protein of unknown function UPF0118  59.94 
 
 
349 aa  397  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0253  hypothetical protein  60.86 
 
 
352 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.077494  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0289  hypothetical protein  60.86 
 
 
352 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.700262  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0937  PerM family permease  60.86 
 
 
374 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2503  hypothetical protein  60.86 
 
 
352 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1436  hypothetical protein  60.86 
 
 
352 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0338  hypothetical protein  55.49 
 
 
365 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88474  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2642  hypothetical protein  60.86 
 
 
352 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00776691  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1633  hypothetical protein  60.86 
 
 
352 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3249  hypothetical protein  59.59 
 
 
350 aa  388  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.691639  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11000  hypothetical protein  53.04 
 
 
346 aa  379  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4931  hypothetical protein  59.37 
 
 
353 aa  379  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.850306  normal  0.602485 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0488  hypothetical protein  54.76 
 
 
371 aa  381  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.131577  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0020  hypothetical protein  54.2 
 
 
358 aa  372  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1653  hypothetical protein  54.47 
 
 
362 aa  366  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.212682  normal  0.81767 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0549  protein of unknown function UPF0118  52.63 
 
 
384 aa  362  7.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0941477  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2998  hypothetical protein  55.1 
 
 
359 aa  349  4e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7289  hypothetical protein  54.09 
 
 
353 aa  344  1e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0901  protein of unknown function UPF0118  51.58 
 
 
365 aa  335  5.999999999999999e-91  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3427  hypothetical protein  50.44 
 
 
355 aa  333  4e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2050  hypothetical protein  49.13 
 
 
373 aa  329  4e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4931  hypothetical protein  48.7 
 
 
351 aa  329  4e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2425  hypothetical protein  50 
 
 
363 aa  325  6e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4988  hypothetical protein  45.82 
 
 
347 aa  320  1.9999999999999998e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0400  hypothetical protein  49.27 
 
 
372 aa  317  2e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.413713  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0460  hypothetical protein  49.27 
 
 
352 aa  317  2e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.353952  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4411  protein of unknown function UPF0118  47.09 
 
 
389 aa  312  4.999999999999999e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4130  hypothetical protein  47.31 
 
 
406 aa  311  1e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.189132  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0826  hypothetical protein  46.71 
 
 
369 aa  302  7.000000000000001e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.981363  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2868  hypothetical protein  43.57 
 
 
358 aa  298  9e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838475  normal  0.0422213 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1267  protein of unknown function UPF0118  43.44 
 
 
371 aa  282  8.000000000000001e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0792338  normal  0.0741439 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0491  hypothetical protein  29.89 
 
 
359 aa  179  9e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000229793  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0203  hypothetical protein  32.57 
 
 
362 aa  176  4e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2012  protein of unknown function UPF0118  38.57 
 
 
363 aa  169  6e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.578603 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0338  protein of unknown function UPF0118  32.77 
 
 
363 aa  168  1e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1154  hypothetical protein  31.12 
 
 
358 aa  160  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000550105  normal  0.0344505 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0228  hypothetical protein  35.21 
 
 
356 aa  159  5e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2181  protein of unknown function UPF0118  32.28 
 
 
376 aa  158  2e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00612132  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2238  protein of unknown function UPF0118  32.48 
 
 
379 aa  156  4e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.605073  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0783  hypothetical protein  29.79 
 
 
353 aa  152  8.999999999999999e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1563  hypothetical protein  32.49 
 
 
398 aa  149  5e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.78708  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2311  protein of unknown function UPF0118  30.15 
 
 
393 aa  146  4.0000000000000006e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2573  membrane protein  29.23 
 
 
361 aa  144  2e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2679  hypothetical protein  33.76 
 
 
352 aa  144  3e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0689913  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4731  hypothetical protein  30.43 
 
 
359 aa  142  7e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.226742  hitchhiker  0.00240822 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0854  membrane protein  32.14 
 
 
363 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0563046  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1102  hypothetical protein  31.19 
 
 
365 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00400546  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2369  hypothetical protein  32.19 
 
 
357 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00120754  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0292  hypothetical protein  27.12 
 
 
391 aa  137  4e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0560  protein of unknown function UPF0118  28.66 
 
 
339 aa  134  3e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0152  putative lipoprotein  28.49 
 
 
361 aa  133  5e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2610  protein of unknown function UPF0118  28.25 
 
 
370 aa  128  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0916  protein of unknown function UPF0118  28.21 
 
 
355 aa  125  2e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.116301  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2229  hypothetical protein  29.58 
 
 
392 aa  123  4e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0336  hypothetical protein  27.87 
 
 
372 aa  122  7e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000639163  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3189  protein of unknown function UPF0118  29.19 
 
 
361 aa  122  7e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000846761  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4026  hypothetical protein  27.74 
 
 
360 aa  122  8e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2294  hypothetical protein  30.39 
 
 
360 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2764  hypothetical protein  31.5 
 
 
346 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.327799  normal  0.0566584 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3082  protein of unknown function UPF0118  30.03 
 
 
397 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2709  hypothetical protein  28.48 
 
 
362 aa  120  3e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2098  hypothetical protein  28.13 
 
 
368 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002589  predicted permease  28.45 
 
 
361 aa  118  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00334796  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1950  protein of unknown function UPF0118  28.16 
 
 
346 aa  118  9.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.863146  normal  0.537489 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03420  hypothetical protein  29.79 
 
 
361 aa  117  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1381  protein of unknown function UPF0118  28.77 
 
 
371 aa  117  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.0000000171014  decreased coverage  0.00070323 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2448  hypothetical protein  27.11 
 
 
415 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0466557  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2601  hypothetical protein  29.41 
 
 
352 aa  114  3e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.99204  normal  0.455316 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0940  protein of unknown function UPF0118  28.2 
 
 
345 aa  114  4.0000000000000004e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.726387  normal  0.96935 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2413  hypothetical protein  25.65 
 
 
345 aa  113  6e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.480547  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2416  protein of unknown function UPF0118  25.54 
 
 
378 aa  112  9e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.25064  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0582  hypothetical protein  27.75 
 
 
367 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0275552  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0398  protein of unknown function UPF0118  29.14 
 
 
425 aa  110  4.0000000000000004e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.0034127  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2015  protein of unknown function UPF0118  25.83 
 
 
354 aa  108  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000281213 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>