More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2311 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_2311  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 
393 aa  753    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0940  protein of unknown function UPF0118  63.24 
 
 
345 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.726387  normal  0.96935 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0398  protein of unknown function UPF0118  57.47 
 
 
425 aa  380  1e-104  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.0034127  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0560  protein of unknown function UPF0118  39.22 
 
 
339 aa  221  1.9999999999999999e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2958  protein of unknown function UPF0118  38.3 
 
 
339 aa  177  4e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2610  protein of unknown function UPF0118  33.62 
 
 
370 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1950  protein of unknown function UPF0118  34.41 
 
 
346 aa  163  4.0000000000000004e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.863146  normal  0.537489 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0901  protein of unknown function UPF0118  28.96 
 
 
365 aa  139  1e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0338  hypothetical protein  31.88 
 
 
365 aa  139  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88474  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3492  hypothetical protein  30.59 
 
 
387 aa  138  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.705437  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0737  hypothetical protein  31.69 
 
 
356 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.203827  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0549  protein of unknown function UPF0118  30.64 
 
 
384 aa  137  4e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0941477  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1111  protein of unknown function UPF0118  34.15 
 
 
381 aa  136  5e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4988  hypothetical protein  31.2 
 
 
347 aa  136  6.0000000000000005e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1653  hypothetical protein  31.36 
 
 
362 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.212682  normal  0.81767 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2083  hypothetical protein  31.21 
 
 
356 aa  136  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.251587 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2425  hypothetical protein  30.86 
 
 
363 aa  135  9e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2868  hypothetical protein  28.91 
 
 
358 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838475  normal  0.0422213 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1226  hypothetical protein  30.15 
 
 
352 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0987  hypothetical protein  28.13 
 
 
394 aa  134  3e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.89372 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2207  hypothetical protein  30.28 
 
 
354 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3980  hypothetical protein  31.33 
 
 
352 aa  130  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0869717 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3531  hypothetical protein  29.97 
 
 
354 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.43917  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29820  hypothetical protein  28.4 
 
 
352 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0125581  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2549  hypothetical protein  28.92 
 
 
352 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705186  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11000  hypothetical protein  30.19 
 
 
346 aa  124  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3378  hypothetical protein  28.16 
 
 
354 aa  125  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1830  hypothetical protein  29.36 
 
 
354 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0540  protein of unknown function UPF0118  29.02 
 
 
349 aa  124  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2289  hypothetical protein  27.54 
 
 
353 aa  124  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.864507  normal  0.333993 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1855  hypothetical protein  29.69 
 
 
354 aa  124  4e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0258165 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3717  hypothetical protein  27.52 
 
 
353 aa  122  8e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396811  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3210  hypothetical protein  28.25 
 
 
354 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.212604 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0020  hypothetical protein  29.65 
 
 
358 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3950  protein of unknown function UPF0118  30.57 
 
 
360 aa  122  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1821  hypothetical protein  30 
 
 
381 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.693161 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3427  hypothetical protein  29.88 
 
 
355 aa  122  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1907  protein of unknown function UPF0118  29.97 
 
 
352 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0488  hypothetical protein  31.27 
 
 
371 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.131577  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0529  hypothetical protein  27.61 
 
 
352 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4931  hypothetical protein  30.09 
 
 
351 aa  116  6e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0937  PerM family permease  27.61 
 
 
374 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4053  hypothetical protein  30.77 
 
 
361 aa  115  8.999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.920687 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1633  hypothetical protein  27.61 
 
 
352 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0289  hypothetical protein  27.61 
 
 
352 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.700262  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0253  hypothetical protein  27.61 
 
 
352 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.077494  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2503  hypothetical protein  27.61 
 
 
352 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2642  hypothetical protein  27.61 
 
 
352 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00776691  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1436  hypothetical protein  27.61 
 
 
352 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2069  hypothetical protein  29.04 
 
 
391 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0264155 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4026  hypothetical protein  28.04 
 
 
360 aa  113  5e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3708  hypothetical protein  26.95 
 
 
355 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.168874 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5533  hypothetical protein  26.95 
 
 
355 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3249  hypothetical protein  30.36 
 
 
350 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.691639  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4556  hypothetical protein  26.43 
 
 
398 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.173549  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0152  putative lipoprotein  26.85 
 
 
361 aa  110  4.0000000000000004e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3807  hypothetical protein  26.35 
 
 
353 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.911463  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3717  hypothetical protein  26.35 
 
 
350 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0661403  normal  0.22421 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7289  hypothetical protein  28.96 
 
 
353 aa  108  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4731  hypothetical protein  28.79 
 
 
359 aa  108  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.226742  hitchhiker  0.00240822 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1267  protein of unknown function UPF0118  27.83 
 
 
371 aa  108  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0792338  normal  0.0741439 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0445  hypothetical protein  21.37 
 
 
393 aa  108  2e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000355219  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2998  hypothetical protein  31.55 
 
 
359 aa  106  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3181  hypothetical protein  29.93 
 
 
419 aa  105  9e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.423402  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4411  protein of unknown function UPF0118  25.2 
 
 
389 aa  105  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0826  hypothetical protein  25.81 
 
 
369 aa  105  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.981363  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3082  protein of unknown function UPF0118  27.17 
 
 
397 aa  104  3e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2413  hypothetical protein  26.36 
 
 
345 aa  104  3e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.480547  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4130  hypothetical protein  24.14 
 
 
406 aa  104  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.189132  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0292  hypothetical protein  24.94 
 
 
391 aa  103  5e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0783  hypothetical protein  29.15 
 
 
353 aa  103  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4931  hypothetical protein  26.19 
 
 
353 aa  102  9e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.850306  normal  0.602485 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0400  hypothetical protein  27.73 
 
 
372 aa  102  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.413713  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0460  hypothetical protein  27.73 
 
 
352 aa  101  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.353952  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2573  membrane protein  25.78 
 
 
361 aa  101  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2448  hypothetical protein  24.7 
 
 
415 aa  101  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0466557  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2050  hypothetical protein  25.08 
 
 
373 aa  100  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0916  protein of unknown function UPF0118  26.56 
 
 
355 aa  100  5e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.116301  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0276  protein of unknown function UPF0118  28.9 
 
 
423 aa  99  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.133789  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0262  hypothetical protein  27.62 
 
 
334 aa  97.1  5e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00766044 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2029  hypothetical protein  27.38 
 
 
348 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.850073 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002589  predicted permease  28.27 
 
 
361 aa  95.9  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00334796  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4645  hypothetical protein  27.11 
 
 
396 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1711  hypothetical protein  27.6 
 
 
336 aa  94  4e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.1929  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0191  hypothetical protein  26.56 
 
 
336 aa  93.6  6e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1732  protein of unknown function UPF0118  28.13 
 
 
355 aa  92.8  1e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000390095  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2221  lipoprotein, putative  29.82 
 
 
349 aa  92  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0102435  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3189  protein of unknown function UPF0118  29.31 
 
 
361 aa  91.3  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000846761  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2012  protein of unknown function UPF0118  30.72 
 
 
363 aa  92  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.578603 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3734  hypothetical protein  27.95 
 
 
350 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0751  hypothetical protein  25.78 
 
 
336 aa  91.3  3e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2238  protein of unknown function UPF0118  24.69 
 
 
379 aa  90.9  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.605073  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2209  hypothetical protein  28.12 
 
 
409 aa  90.5  5e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1154  hypothetical protein  26.12 
 
 
358 aa  89.7  7e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000550105  normal  0.0344505 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03420  hypothetical protein  27.22 
 
 
361 aa  90.1  7e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0574  hypothetical protein  24.83 
 
 
321 aa  89.4  1e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.877456  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4200  hypothetical protein  25.91 
 
 
346 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1563  hypothetical protein  27.58 
 
 
398 aa  88.2  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.78708  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3487  hypothetical protein  28.09 
 
 
354 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4608  hypothetical protein  25.79 
 
 
370 aa  87.8  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.991825  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>