More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2610 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_2610  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 
370 aa  702    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1111  protein of unknown function UPF0118  64.91 
 
 
381 aa  395  1e-109  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0560  protein of unknown function UPF0118  43.15 
 
 
339 aa  244  1.9999999999999999e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2958  protein of unknown function UPF0118  40.87 
 
 
339 aa  196  7e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1950  protein of unknown function UPF0118  34.55 
 
 
346 aa  186  7e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.863146  normal  0.537489 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2311  protein of unknown function UPF0118  35.22 
 
 
393 aa  167  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11000  hypothetical protein  33.73 
 
 
346 aa  155  9e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0940  protein of unknown function UPF0118  31.43 
 
 
345 aa  149  9e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.726387  normal  0.96935 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0549  protein of unknown function UPF0118  29.07 
 
 
384 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0941477  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0338  hypothetical protein  28.73 
 
 
365 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88474  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3492  hypothetical protein  31.08 
 
 
387 aa  138  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.705437  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3980  hypothetical protein  30.26 
 
 
352 aa  135  9e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0869717 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4931  hypothetical protein  32.85 
 
 
351 aa  135  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2083  hypothetical protein  29.89 
 
 
356 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.251587 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2425  hypothetical protein  28.97 
 
 
363 aa  134  3.9999999999999996e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0737  hypothetical protein  28.45 
 
 
356 aa  133  6e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.203827  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0901  protein of unknown function UPF0118  31.87 
 
 
365 aa  130  5.0000000000000004e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0987  hypothetical protein  28.1 
 
 
394 aa  129  7.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.89372 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2868  hypothetical protein  29.71 
 
 
358 aa  129  8.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838475  normal  0.0422213 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2050  hypothetical protein  28.69 
 
 
373 aa  129  9.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0488  hypothetical protein  32.42 
 
 
371 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.131577  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4988  hypothetical protein  32.71 
 
 
347 aa  128  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2549  hypothetical protein  26.81 
 
 
352 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705186  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29820  hypothetical protein  28.22 
 
 
352 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0125581  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4411  protein of unknown function UPF0118  26.82 
 
 
389 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1226  hypothetical protein  28.32 
 
 
352 aa  126  7e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0826  hypothetical protein  28.82 
 
 
369 aa  125  8.000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.981363  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1821  hypothetical protein  29.35 
 
 
381 aa  125  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.693161 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0529  hypothetical protein  28.09 
 
 
352 aa  125  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0398  protein of unknown function UPF0118  32.3 
 
 
425 aa  125  1e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.0034127  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3950  protein of unknown function UPF0118  27.99 
 
 
360 aa  125  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1907  protein of unknown function UPF0118  29.29 
 
 
352 aa  125  1e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4130  hypothetical protein  27.45 
 
 
406 aa  125  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.189132  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2207  hypothetical protein  26.84 
 
 
354 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3427  hypothetical protein  29.88 
 
 
355 aa  124  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0020  hypothetical protein  31.3 
 
 
358 aa  124  3e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3531  hypothetical protein  26.55 
 
 
354 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.43917  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0937  PerM family permease  28.37 
 
 
374 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1830  hypothetical protein  26.55 
 
 
354 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1633  hypothetical protein  28.09 
 
 
352 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1436  hypothetical protein  28.09 
 
 
352 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0253  hypothetical protein  28.09 
 
 
352 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.077494  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0289  hypothetical protein  28.09 
 
 
352 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.700262  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2642  hypothetical protein  28.09 
 
 
352 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00776691  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2503  hypothetical protein  28.09 
 
 
352 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3249  hypothetical protein  32 
 
 
350 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.691639  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1855  hypothetical protein  25.66 
 
 
354 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0258165 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2289  hypothetical protein  25.21 
 
 
353 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.864507  normal  0.333993 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3378  hypothetical protein  26.79 
 
 
354 aa  117  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2413  hypothetical protein  27.45 
 
 
345 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.480547  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0292  hypothetical protein  24.53 
 
 
391 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4556  hypothetical protein  25.37 
 
 
398 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.173549  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5533  hypothetical protein  25.44 
 
 
355 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3210  hypothetical protein  27.1 
 
 
354 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.212604 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4053  hypothetical protein  28.4 
 
 
361 aa  114  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.920687 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3807  hypothetical protein  25.15 
 
 
353 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.911463  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3717  hypothetical protein  25.15 
 
 
350 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0661403  normal  0.22421 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3708  hypothetical protein  25.15 
 
 
355 aa  113  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.168874 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0540  protein of unknown function UPF0118  25.66 
 
 
349 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4931  hypothetical protein  25.66 
 
 
353 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.850306  normal  0.602485 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3717  hypothetical protein  24.78 
 
 
353 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396811  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2012  protein of unknown function UPF0118  31.66 
 
 
363 aa  109  7.000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.578603 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1653  hypothetical protein  30.03 
 
 
362 aa  108  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.212682  normal  0.81767 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0152  putative lipoprotein  27.36 
 
 
361 aa  107  4e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1563  hypothetical protein  29.57 
 
 
398 aa  107  4e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.78708  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2238  protein of unknown function UPF0118  37.27 
 
 
379 aa  106  7e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.605073  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3181  hypothetical protein  29.11 
 
 
419 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.423402  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0783  hypothetical protein  26.57 
 
 
353 aa  105  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0338  protein of unknown function UPF0118  37.74 
 
 
363 aa  102  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2229  hypothetical protein  32.17 
 
 
392 aa  102  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2998  hypothetical protein  33.19 
 
 
359 aa  101  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7289  hypothetical protein  29.79 
 
 
353 aa  101  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2573  membrane protein  25.71 
 
 
361 aa  99.4  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0400  hypothetical protein  28.7 
 
 
372 aa  97.8  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.413713  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0460  hypothetical protein  28.7 
 
 
352 aa  97.4  3e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.353952  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1707  protein of unknown function UPF0118  31.58 
 
 
504 aa  97.4  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1154  hypothetical protein  27.78 
 
 
358 aa  97.1  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000550105  normal  0.0344505 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3189  protein of unknown function UPF0118  30.32 
 
 
361 aa  97.1  5e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000846761  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3082  protein of unknown function UPF0118  32.54 
 
 
397 aa  96.7  6e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1267  protein of unknown function UPF0118  27.97 
 
 
371 aa  96.7  6e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0792338  normal  0.0741439 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0276  protein of unknown function UPF0118  27.44 
 
 
423 aa  96.3  7e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.133789  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4731  hypothetical protein  28.57 
 
 
359 aa  96.7  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.226742  hitchhiker  0.00240822 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2764  hypothetical protein  26.79 
 
 
346 aa  95.9  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.327799  normal  0.0566584 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2448  hypothetical protein  33.13 
 
 
415 aa  95.1  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0466557  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0203  hypothetical protein  27.93 
 
 
362 aa  94.4  3e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0445  hypothetical protein  23.22 
 
 
393 aa  94.4  3e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000355219  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2741  protein of unknown function UPF0118  25.8 
 
 
355 aa  92.8  9e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000351921  hitchhiker  0.0000000742293 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002589  predicted permease  26.19 
 
 
361 aa  92.8  9e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00334796  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2069  hypothetical protein  27.18 
 
 
391 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0264155 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0792  protein of unknown function UPF0118  26.15 
 
 
344 aa  92.4  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.101192 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0582  hypothetical protein  28.05 
 
 
367 aa  92.4  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0275552  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1102  hypothetical protein  25.46 
 
 
365 aa  91.7  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00400546  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0854  membrane protein  29.27 
 
 
363 aa  91.3  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0563046  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4237  protein of unknown function UPF0118  27.36 
 
 
350 aa  90.1  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2676  hypothetical protein  28.66 
 
 
388 aa  90.1  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1639  hypothetical protein  25.31 
 
 
334 aa  90.1  6e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03420  hypothetical protein  26.67 
 
 
361 aa  88.6  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2369  hypothetical protein  28.76 
 
 
357 aa  87.4  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00120754  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0916  protein of unknown function UPF0118  30 
 
 
355 aa  87  4e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.116301  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4645  hypothetical protein  24.8 
 
 
396 aa  87.4  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>