More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2425 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_2425  hypothetical protein  100 
 
 
363 aa  709    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0901  protein of unknown function UPF0118  54.57 
 
 
365 aa  368  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2549  hypothetical protein  51.74 
 
 
352 aa  344  1e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705186  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29820  hypothetical protein  51.16 
 
 
352 aa  342  7e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0125581  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3492  hypothetical protein  48.53 
 
 
387 aa  331  1e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.705437  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11000  hypothetical protein  47.79 
 
 
346 aa  329  6e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0987  hypothetical protein  49.12 
 
 
394 aa  327  2.0000000000000001e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.89372 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1226  hypothetical protein  50 
 
 
352 aa  325  9e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3717  hypothetical protein  48.83 
 
 
353 aa  324  1e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396811  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1830  hypothetical protein  48.52 
 
 
354 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2289  hypothetical protein  47.94 
 
 
353 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.864507  normal  0.333993 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3210  hypothetical protein  49.54 
 
 
354 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.212604 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2083  hypothetical protein  47.04 
 
 
356 aa  318  6e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.251587 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1855  hypothetical protein  47.93 
 
 
354 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0258165 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0737  hypothetical protein  50.44 
 
 
356 aa  317  3e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.203827  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0338  hypothetical protein  49.85 
 
 
365 aa  315  6e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88474  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3531  hypothetical protein  47.04 
 
 
354 aa  315  8e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.43917  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3378  hypothetical protein  47.65 
 
 
354 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0540  protein of unknown function UPF0118  50 
 
 
349 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3950  protein of unknown function UPF0118  47.08 
 
 
360 aa  313  3.9999999999999997e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2207  hypothetical protein  46.75 
 
 
354 aa  312  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3717  hypothetical protein  47.65 
 
 
350 aa  311  9e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0661403  normal  0.22421 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4556  hypothetical protein  47.65 
 
 
398 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.173549  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3807  hypothetical protein  47.65 
 
 
353 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.911463  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1653  hypothetical protein  47.79 
 
 
362 aa  310  2e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.212682  normal  0.81767 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3708  hypothetical protein  47.06 
 
 
355 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.168874 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5533  hypothetical protein  47.06 
 
 
355 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0020  hypothetical protein  50.73 
 
 
358 aa  305  7e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0253  hypothetical protein  50.78 
 
 
352 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.077494  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2642  hypothetical protein  50.78 
 
 
352 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00776691  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3980  hypothetical protein  47.2 
 
 
352 aa  305  1.0000000000000001e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0869717 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1436  hypothetical protein  50.78 
 
 
352 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0289  hypothetical protein  50.78 
 
 
352 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.700262  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2503  hypothetical protein  50.78 
 
 
352 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1633  hypothetical protein  50.78 
 
 
352 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0937  PerM family permease  50.78 
 
 
374 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0529  hypothetical protein  50.78 
 
 
352 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1267  protein of unknown function UPF0118  45.61 
 
 
371 aa  299  6e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0792338  normal  0.0741439 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4053  hypothetical protein  46.11 
 
 
361 aa  298  9e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.920687 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0549  protein of unknown function UPF0118  47.48 
 
 
384 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0941477  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1821  hypothetical protein  49.13 
 
 
381 aa  297  2e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.693161 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1907  protein of unknown function UPF0118  48.99 
 
 
352 aa  296  3e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3427  hypothetical protein  45.79 
 
 
355 aa  295  6e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0488  hypothetical protein  46.01 
 
 
371 aa  295  9e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.131577  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4130  hypothetical protein  43.05 
 
 
406 aa  295  1e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.189132  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4411  protein of unknown function UPF0118  45.18 
 
 
389 aa  293  2e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4931  hypothetical protein  48.67 
 
 
353 aa  293  2e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.850306  normal  0.602485 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4931  hypothetical protein  47.49 
 
 
351 aa  289  6e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2050  hypothetical protein  45.18 
 
 
373 aa  288  1e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2998  hypothetical protein  47.47 
 
 
359 aa  287  2e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0826  hypothetical protein  43.09 
 
 
369 aa  285  8e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.981363  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2868  hypothetical protein  45.32 
 
 
358 aa  282  5.000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838475  normal  0.0422213 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0460  hypothetical protein  46 
 
 
352 aa  281  9e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.353952  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0400  hypothetical protein  46 
 
 
372 aa  281  1e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.413713  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3249  hypothetical protein  46.45 
 
 
350 aa  280  3e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.691639  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4988  hypothetical protein  42.4 
 
 
347 aa  270  2.9999999999999997e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7289  hypothetical protein  45.4 
 
 
353 aa  261  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0338  protein of unknown function UPF0118  44.5 
 
 
363 aa  177  3e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2012  protein of unknown function UPF0118  31.52 
 
 
363 aa  176  7e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.578603 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0491  hypothetical protein  33.05 
 
 
359 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000229793  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0203  hypothetical protein  32.75 
 
 
362 aa  172  9e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2238  protein of unknown function UPF0118  32.15 
 
 
379 aa  170  4e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.605073  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0152  putative lipoprotein  31.9 
 
 
361 aa  160  5e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1154  hypothetical protein  31.48 
 
 
358 aa  158  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000550105  normal  0.0344505 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1102  hypothetical protein  32.01 
 
 
365 aa  158  1e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00400546  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0292  hypothetical protein  28.93 
 
 
391 aa  157  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1563  hypothetical protein  32.41 
 
 
398 aa  157  3e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.78708  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2181  protein of unknown function UPF0118  30.15 
 
 
376 aa  155  1e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00612132  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002589  predicted permease  32.66 
 
 
361 aa  154  2.9999999999999998e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00334796  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0228  hypothetical protein  31.63 
 
 
356 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2311  protein of unknown function UPF0118  30.86 
 
 
393 aa  147  3e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2573  membrane protein  30.06 
 
 
361 aa  147  3e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2610  protein of unknown function UPF0118  29.85 
 
 
370 aa  142  8e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03420  hypothetical protein  32.43 
 
 
361 aa  142  9e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0783  hypothetical protein  27.17 
 
 
353 aa  142  9e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2229  hypothetical protein  29.85 
 
 
392 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2679  hypothetical protein  33.12 
 
 
352 aa  139  7.999999999999999e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0689913  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0560  protein of unknown function UPF0118  28.36 
 
 
339 aa  137  3.0000000000000003e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4731  hypothetical protein  29.22 
 
 
359 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.226742  hitchhiker  0.00240822 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2448  hypothetical protein  27.68 
 
 
415 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0466557  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2369  hypothetical protein  29.56 
 
 
357 aa  129  8.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00120754  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2294  hypothetical protein  32 
 
 
360 aa  127  3e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2413  hypothetical protein  27.58 
 
 
345 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.480547  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4026  hypothetical protein  26.79 
 
 
360 aa  126  7e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0854  membrane protein  30.88 
 
 
363 aa  125  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0563046  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3082  protein of unknown function UPF0118  30.65 
 
 
397 aa  124  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2212  protein of unknown function UPF0118  25.27 
 
 
355 aa  123  4e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000181482  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1578  protein of unknown function UPF0118  30.52 
 
 
373 aa  123  6e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.373133  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0916  protein of unknown function UPF0118  26.67 
 
 
355 aa  122  9e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.116301  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3189  protein of unknown function UPF0118  28.35 
 
 
361 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000846761  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2015  protein of unknown function UPF0118  26.79 
 
 
354 aa  120  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000281213 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0940  protein of unknown function UPF0118  28.13 
 
 
345 aa  119  6e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.726387  normal  0.96935 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2709  hypothetical protein  26.74 
 
 
362 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0268  protein of unknown function UPF0118  29.6 
 
 
363 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0336  hypothetical protein  24.07 
 
 
372 aa  117  3.9999999999999997e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000639163  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2958  protein of unknown function UPF0118  31.96 
 
 
339 aa  117  3.9999999999999997e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2764  hypothetical protein  29.05 
 
 
346 aa  114  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.327799  normal  0.0566584 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1732  protein of unknown function UPF0118  29.11 
 
 
355 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000390095  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2676  hypothetical protein  30.86 
 
 
388 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0398  protein of unknown function UPF0118  29.53 
 
 
425 aa  112  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.0034127  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>