More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0940 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0940  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 		 345 aa  659    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.726387  normal  0.96935 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2311  protein of unknown function UPF0118  63.13 
 
 		 393 aa  424  1e-118  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0398  protein of unknown function UPF0118  59.53 
 
 		 425 aa  360  1e-98  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.0034127  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0560  protein of unknown function UPF0118  35.95 
 
 		 339 aa  207  2e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2958  protein of unknown function UPF0118  35.03 
 
 		 339 aa  167  2e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1950  protein of unknown function UPF0118  33.03 
 
 		 346 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.863146  normal  0.537489 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2610  protein of unknown function UPF0118  31.43 
 
 		 370 aa  148  1.0000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4988  hypothetical protein  30.65 
 
 		 347 aa  127  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3492  hypothetical protein  29.91 
 
 		 387 aa  125  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.705437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29820  hypothetical protein  29.76 
 
 		 352 aa  124  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0125581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0549  protein of unknown function UPF0118  29.79 
 
 		 384 aa  122  9e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0941477  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2868  hypothetical protein  29.5 
 
 		 358 aa  122  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838475  normal  0.0422213 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2549  hypothetical protein  29.46 
 
 		 352 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705186  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0987  hypothetical protein  28.06 
 
 		 394 aa  120  3.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.89372 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2289  hypothetical protein  28.05 
 
 		 353 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.864507  normal  0.333993 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2448  hypothetical protein  28.35 
 
 		 415 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0466557  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4931  hypothetical protein  32.48 
 
 		 351 aa  119  4.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1111  protein of unknown function UPF0118  31.58 
 
 		 381 aa  119  7e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3378  hypothetical protein  28.3 
 
 		 354 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2083  hypothetical protein  30.21 
 
 		 356 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.251587 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3210  hypothetical protein  28.3 
 
 		 354 aa  116  6e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.212604 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11000  hypothetical protein  26.88 
 
 		 346 aa  115  7.999999999999999e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3427  hypothetical protein  29.64 
 
 		 355 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3249  hypothetical protein  30.38 
 
 		 350 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.691639  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2207  hypothetical protein  28 
 
 		 354 aa  113  6e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3531  hypothetical protein  28.31 
 
 		 354 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.43917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3717  hypothetical protein  27.55 
 
 		 353 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396811  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3950  protein of unknown function UPF0118  28.71 
 
 		 360 aa  111  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4053  hypothetical protein  28.24 
 
 		 361 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.920687 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2425  hypothetical protein  28.07 
 
 		 363 aa  110  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1830  hypothetical protein  28.22 
 
 		 354 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0338  hypothetical protein  30.67 
 
 		 365 aa  110  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88474  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1855  hypothetical protein  28.39 
 
 		 354 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0258165 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5533  hypothetical protein  28.74 
 
 		 355 aa  109  5e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4556  hypothetical protein  27.74 
 
 		 398 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.173549  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4411  protein of unknown function UPF0118  29.67 
 
 		 389 aa  109  8.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1653  hypothetical protein  29.59 
 
 		 362 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.212682  normal  0.81767 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3717  hypothetical protein  27.74 
 
 		 350 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0661403  normal  0.22421 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0737  hypothetical protein  29.23 
 
 		 356 aa  108  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.203827  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3708  hypothetical protein  28.44 
 
 		 355 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.168874 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3807  hypothetical protein  27.74 
 
 		 353 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.911463  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3980  hypothetical protein  27.33 
 
 		 352 aa  108  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0869717 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0529  hypothetical protein  27.74 
 
 		 352 aa  108  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4026  hypothetical protein  29.28 
 
 		 360 aa  108  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0937  PerM family permease  28.17 
 
 		 374 aa  107  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1226  hypothetical protein  28.84 
 
 		 352 aa  107  4e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4130  hypothetical protein  30.36 
 
 		 406 aa  106  5e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.189132  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1907  protein of unknown function UPF0118  27.91 
 
 		 352 aa  106  5e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2642  hypothetical protein  28.17 
 
 		 352 aa  106  7e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00776691  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1633  hypothetical protein  28.17 
 
 		 352 aa  106  7e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0253  hypothetical protein  28.17 
 
 		 352 aa  106  7e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.077494  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0289  hypothetical protein  28.17 
 
 		 352 aa  106  7e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.700262  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1436  hypothetical protein  28.17 
 
 		 352 aa  106  7e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1821  hypothetical protein  27.91 
 
 		 381 aa  106  7e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.693161 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2503  hypothetical protein  28.17 
 
 		 352 aa  106  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0540  protein of unknown function UPF0118  27.91 
 
 		 349 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4731  hypothetical protein  29.46 
 
 		 359 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.226742  hitchhiker  0.00240822 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0901  protein of unknown function UPF0118  24.85 
 
 		 365 aa  104  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2050  hypothetical protein  29.6 
 
 		 373 aa  103  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1563  hypothetical protein  28.04 
 
 		 398 aa  104  3e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.78708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0292  hypothetical protein  25.22 
 
 		 391 aa  103  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3181  hypothetical protein  30.65 
 
 		 419 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.423402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3082  protein of unknown function UPF0118  25.55 
 
 		 397 aa  103  5e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2413  hypothetical protein  25 
 
 		 345 aa  103  6e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.480547  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7289  hypothetical protein  29.69 
 
 		 353 aa  102  9e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0488  hypothetical protein  28.99 
 
 		 371 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.131577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2012  protein of unknown function UPF0118  30.49 
 
 		 363 aa  100  5e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.578603 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2209  hypothetical protein  29.89 
 
 		 409 aa  100  5e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4200  hypothetical protein  27.41 
 
 		 346 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3734  hypothetical protein  29.46 
 
 		 350 aa  99.4  9e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0338  protein of unknown function UPF0118  27.85 
 
 		 363 aa  99  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3487  hypothetical protein  28.99 
 
 		 354 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0826  hypothetical protein  29.26 
 
 		 369 aa  97.1  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.981363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2029  hypothetical protein  28.1 
 
 		 348 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.850073 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2238  protein of unknown function UPF0118  33.12 
 
 		 379 aa  97.1  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.605073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0271  hypothetical protein  29.25 
 
 		 379 aa  96.3  8e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0400  hypothetical protein  26.83 
 
 		 372 aa  95.5  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.413713  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0460  hypothetical protein  26.83 
 
 		 352 aa  95.5  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.353952  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2229  hypothetical protein  27 
 
 		 392 aa  95.1  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0792  protein of unknown function UPF0118  28.85 
 
 		 344 aa  95.9  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.101192 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2221  lipoprotein, putative  28.74 
 
 		 349 aa  94  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0102435  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4162  hypothetical protein  30.24 
 
 		 350 aa  94  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0297  hypothetical protein  28.95 
 
 		 379 aa  93.6  5e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1154  hypothetical protein  26.43 
 
 		 358 aa  92.8  9e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000550105  normal  0.0344505 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1705  hypothetical protein  30.24 
 
 		 349 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.873743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0020  hypothetical protein  28.71 
 
 		 358 aa  92  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0783  hypothetical protein  24.64 
 
 		 353 aa  92.4  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4931  hypothetical protein  27.24 
 
 		 353 aa  91.7  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.850306  normal  0.602485 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0152  putative lipoprotein  23.95 
 
 		 361 aa  89.7  6e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2998  hypothetical protein  30.1 
 
 		 359 aa  89.4  9e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2069  hypothetical protein  25.68 
 
 		 391 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0264155 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0916  protein of unknown function UPF0118  26.23 
 
 		 355 aa  88.2  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.116301  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1102  hypothetical protein  26.69 
 
 		 365 aa  87.4  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00400546  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0445  hypothetical protein  23.72 
 
 		 393 aa  87  4e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000355219  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0276  protein of unknown function UPF0118  23.88 
 
 		 423 aa  87  5e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.133789  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0203  hypothetical protein  27.3 
 
 		 362 aa  86.7  6e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4061  hypothetical protein  29.41 
 
 		 351 aa  85.1  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0854  membrane protein  33.85 
 
 		 363 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0563046  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3243  hypothetical protein  27.01 
 
 		 356 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.340258  normal  0.654322 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1267  protein of unknown function UPF0118  25.32 
 
 		 371 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0792338  normal  0.0741439 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>