More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1563 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1563  hypothetical protein  100 
 
 
398 aa  768    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.78708  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0491  hypothetical protein  37.93 
 
 
359 aa  241  1e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000229793  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2012  protein of unknown function UPF0118  35.82 
 
 
363 aa  229  8e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.578603 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2238  protein of unknown function UPF0118  35.5 
 
 
379 aa  216  5.9999999999999996e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.605073  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0203  hypothetical protein  34.87 
 
 
362 aa  215  9.999999999999999e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2181  protein of unknown function UPF0118  35.47 
 
 
376 aa  213  5.999999999999999e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00612132  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0338  protein of unknown function UPF0118  36.29 
 
 
363 aa  211  2e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0228  hypothetical protein  37.31 
 
 
356 aa  194  3e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2369  hypothetical protein  38.46 
 
 
357 aa  192  6e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00120754  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0549  protein of unknown function UPF0118  34.49 
 
 
384 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0941477  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0826  hypothetical protein  33.79 
 
 
369 aa  180  4e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.981363  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1855  hypothetical protein  33.52 
 
 
354 aa  179  9e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0258165 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2207  hypothetical protein  33.24 
 
 
354 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0488  hypothetical protein  35.61 
 
 
371 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.131577  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3531  hypothetical protein  33.24 
 
 
354 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.43917  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1830  hypothetical protein  32.68 
 
 
354 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0338  hypothetical protein  33.87 
 
 
365 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88474  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3492  hypothetical protein  31.35 
 
 
387 aa  171  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.705437  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2289  hypothetical protein  31.77 
 
 
353 aa  170  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.864507  normal  0.333993 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4411  protein of unknown function UPF0118  31.23 
 
 
389 aa  170  4e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2050  hypothetical protein  32.8 
 
 
373 aa  170  4e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4130  hypothetical protein  31.15 
 
 
406 aa  169  6e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.189132  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3950  protein of unknown function UPF0118  32.97 
 
 
360 aa  169  6e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2868  hypothetical protein  32.66 
 
 
358 aa  169  8e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838475  normal  0.0422213 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0737  hypothetical protein  34.83 
 
 
356 aa  169  1e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.203827  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11000  hypothetical protein  33.81 
 
 
346 aa  168  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2083  hypothetical protein  35.88 
 
 
356 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.251587 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3717  hypothetical protein  30.36 
 
 
353 aa  166  8e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396811  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0529  hypothetical protein  33.44 
 
 
352 aa  164  3e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0987  hypothetical protein  32.15 
 
 
394 aa  164  4.0000000000000004e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.89372 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2642  hypothetical protein  34.02 
 
 
352 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00776691  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1436  hypothetical protein  34.02 
 
 
352 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0289  hypothetical protein  34.02 
 
 
352 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.700262  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1633  hypothetical protein  34.02 
 
 
352 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2503  hypothetical protein  34.02 
 
 
352 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0253  hypothetical protein  34.02 
 
 
352 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.077494  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0937  PerM family permease  33.92 
 
 
374 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4556  hypothetical protein  31.44 
 
 
398 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.173549  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3717  hypothetical protein  31.44 
 
 
350 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0661403  normal  0.22421 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5533  hypothetical protein  31.73 
 
 
355 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3807  hypothetical protein  31.44 
 
 
353 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.911463  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3210  hypothetical protein  30.38 
 
 
354 aa  160  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.212604 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2425  hypothetical protein  32.02 
 
 
363 aa  160  4e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0540  protein of unknown function UPF0118  32.38 
 
 
349 aa  160  4e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3708  hypothetical protein  31.44 
 
 
355 aa  160  5e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.168874 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0020  hypothetical protein  39.57 
 
 
358 aa  160  5e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4988  hypothetical protein  31.05 
 
 
347 aa  160  5e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3378  hypothetical protein  30.38 
 
 
354 aa  159  9e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1653  hypothetical protein  33.88 
 
 
362 aa  158  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.212682  normal  0.81767 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2549  hypothetical protein  33.33 
 
 
352 aa  158  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705186  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29820  hypothetical protein  32.73 
 
 
352 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0125581  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4931  hypothetical protein  31.25 
 
 
353 aa  155  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.850306  normal  0.602485 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4931  hypothetical protein  31.65 
 
 
351 aa  155  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0901  protein of unknown function UPF0118  38.34 
 
 
365 aa  153  5.9999999999999996e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4053  hypothetical protein  31.33 
 
 
361 aa  153  5.9999999999999996e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.920687 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1226  hypothetical protein  38.33 
 
 
352 aa  152  7e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1154  hypothetical protein  29.89 
 
 
358 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000550105  normal  0.0344505 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1821  hypothetical protein  39.66 
 
 
381 aa  152  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.693161 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1907  protein of unknown function UPF0118  39.66 
 
 
352 aa  152  1e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0152  putative lipoprotein  32.54 
 
 
361 aa  149  6e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3427  hypothetical protein  31.55 
 
 
355 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3249  hypothetical protein  45.36 
 
 
350 aa  144  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.691639  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1267  protein of unknown function UPF0118  29.65 
 
 
371 aa  143  4e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0792338  normal  0.0741439 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3980  hypothetical protein  32.77 
 
 
352 aa  144  4e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0869717 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7289  hypothetical protein  33.33 
 
 
353 aa  142  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2998  hypothetical protein  32.76 
 
 
359 aa  135  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0400  hypothetical protein  29.1 
 
 
372 aa  135  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.413713  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0460  hypothetical protein  29.1 
 
 
352 aa  135  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.353952  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0854  membrane protein  31.17 
 
 
363 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0563046  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1102  hypothetical protein  30.59 
 
 
365 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00400546  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2573  membrane protein  27.51 
 
 
361 aa  128  2.0000000000000002e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0560  protein of unknown function UPF0118  28.41 
 
 
339 aa  127  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0747  hypothetical protein  31.82 
 
 
381 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.122791  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11122  hypothetical protein  29.82 
 
 
385 aa  124  3e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2958  protein of unknown function UPF0118  40.12 
 
 
339 aa  123  6e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2413  hypothetical protein  26.93 
 
 
345 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.480547  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0783  hypothetical protein  28.69 
 
 
353 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0794  protein of unknown function UPF0118  32.94 
 
 
364 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0479876  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2610  protein of unknown function UPF0118  29.01 
 
 
370 aa  120  3e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0582  hypothetical protein  32.06 
 
 
367 aa  119  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0275552  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4349  hypothetical protein  28.99 
 
 
400 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.632987  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2229  hypothetical protein  32.16 
 
 
392 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0798  protein of unknown function UPF0118  32.12 
 
 
380 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4118  hypothetical protein  28.99 
 
 
400 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00655828  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002589  predicted permease  33.04 
 
 
361 aa  117  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00334796  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4193  hypothetical protein  28.99 
 
 
400 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.662681  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3734  hypothetical protein  32.34 
 
 
350 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3487  hypothetical protein  31.91 
 
 
354 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03420  hypothetical protein  32.84 
 
 
361 aa  116  7.999999999999999e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1705  hypothetical protein  31.71 
 
 
349 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.873743  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0292  hypothetical protein  22.85 
 
 
391 aa  116  8.999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4162  hypothetical protein  31.71 
 
 
350 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1950  protein of unknown function UPF0118  29.03 
 
 
346 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.863146  normal  0.537489 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3082  protein of unknown function UPF0118  26.78 
 
 
397 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2676  hypothetical protein  30.63 
 
 
388 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0940  protein of unknown function UPF0118  29.82 
 
 
345 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.726387  normal  0.96935 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2709  hypothetical protein  28.85 
 
 
362 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4731  hypothetical protein  32.06 
 
 
359 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.226742  hitchhiker  0.00240822 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4200  hypothetical protein  30.7 
 
 
346 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4026  hypothetical protein  29.81 
 
 
360 aa  109  8.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>