More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4026 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4026  hypothetical protein  100 
 
 
360 aa  710    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1154  hypothetical protein  32.76 
 
 
358 aa  168  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000550105  normal  0.0344505 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0152  putative lipoprotein  31.95 
 
 
361 aa  160  2e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2573  membrane protein  30.35 
 
 
361 aa  160  3e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0916  protein of unknown function UPF0118  27.22 
 
 
355 aa  156  6e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.116301  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1102  hypothetical protein  31.52 
 
 
365 aa  155  8e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00400546  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0292  hypothetical protein  29.86 
 
 
391 aa  155  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0268  protein of unknown function UPF0118  34.43 
 
 
363 aa  150  3e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0854  membrane protein  33.15 
 
 
363 aa  150  5e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0563046  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1578  protein of unknown function UPF0118  33.64 
 
 
373 aa  146  6e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.373133  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2083  hypothetical protein  27.91 
 
 
356 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.251587 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0783  hypothetical protein  29.67 
 
 
353 aa  143  5e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7289  hypothetical protein  28.49 
 
 
353 aa  142  7e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3492  hypothetical protein  27.93 
 
 
387 aa  140  3.9999999999999997e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.705437  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0901  protein of unknown function UPF0118  25.9 
 
 
365 aa  139  8.999999999999999e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2012  protein of unknown function UPF0118  30.23 
 
 
363 aa  138  1e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.578603 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002589  predicted permease  31.58 
 
 
361 aa  139  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00334796  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0338  hypothetical protein  28.57 
 
 
365 aa  136  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88474  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0661  hypothetical protein  32.46 
 
 
351 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11000  hypothetical protein  25.62 
 
 
346 aa  135  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0810  protein of unknown function UPF0118  32.46 
 
 
351 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3950  protein of unknown function UPF0118  26.63 
 
 
360 aa  133  5e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03420  hypothetical protein  31.08 
 
 
361 aa  132  6e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3189  protein of unknown function UPF0118  28.96 
 
 
361 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000846761  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0488  hypothetical protein  29.6 
 
 
371 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.131577  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1732  protein of unknown function UPF0118  30.03 
 
 
355 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000390095  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4731  hypothetical protein  28.48 
 
 
359 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.226742  hitchhiker  0.00240822 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0737  hypothetical protein  28.48 
 
 
356 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.203827  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2098  hypothetical protein  33.83 
 
 
368 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0987  hypothetical protein  26.84 
 
 
394 aa  130  4.0000000000000003e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.89372 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2448  hypothetical protein  29.7 
 
 
415 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0466557  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2868  hypothetical protein  29.11 
 
 
358 aa  127  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838475  normal  0.0422213 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0549  protein of unknown function UPF0118  27.17 
 
 
384 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0941477  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4931  hypothetical protein  26.9 
 
 
351 aa  126  5e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2425  hypothetical protein  27.59 
 
 
363 aa  125  8.000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4988  hypothetical protein  28.15 
 
 
347 aa  125  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3980  hypothetical protein  26.28 
 
 
352 aa  123  5e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0869717 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0020  hypothetical protein  28.49 
 
 
358 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0338  protein of unknown function UPF0118  28.06 
 
 
363 aa  121  9.999999999999999e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2549  hypothetical protein  28.11 
 
 
352 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705186  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0276  protein of unknown function UPF0118  25.14 
 
 
423 aa  121  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.133789  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4130  hypothetical protein  25.14 
 
 
406 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.189132  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0529  hypothetical protein  28.3 
 
 
352 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2709  hypothetical protein  33.33 
 
 
362 aa  120  3e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1653  hypothetical protein  30.46 
 
 
362 aa  120  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.212682  normal  0.81767 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1633  hypothetical protein  27.97 
 
 
352 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1436  hypothetical protein  27.97 
 
 
352 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0253  hypothetical protein  27.97 
 
 
352 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.077494  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0289  hypothetical protein  27.97 
 
 
352 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.700262  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0937  PerM family permease  27.97 
 
 
374 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2642  hypothetical protein  27.97 
 
 
352 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00776691  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2503  hypothetical protein  27.97 
 
 
352 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29820  hypothetical protein  27.51 
 
 
352 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0125581  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2998  hypothetical protein  29.03 
 
 
359 aa  119  9e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4411  protein of unknown function UPF0118  24.23 
 
 
389 aa  119  9e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2212  protein of unknown function UPF0118  27.6 
 
 
355 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000181482  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2416  protein of unknown function UPF0118  24.59 
 
 
378 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.25064  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0491  hypothetical protein  26.16 
 
 
359 aa  117  3e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000229793  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1226  hypothetical protein  27.92 
 
 
352 aa  117  3e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2209  hypothetical protein  27.01 
 
 
409 aa  117  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3734  hypothetical protein  32.43 
 
 
350 aa  116  5e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0297  hypothetical protein  29.88 
 
 
379 aa  116  6e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0271  hypothetical protein  27.78 
 
 
379 aa  115  7.999999999999999e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3378  hypothetical protein  24.92 
 
 
354 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3082  protein of unknown function UPF0118  27.57 
 
 
397 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2207  hypothetical protein  26.99 
 
 
354 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2311  protein of unknown function UPF0118  27.84 
 
 
393 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2238  protein of unknown function UPF0118  28.31 
 
 
379 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.605073  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3531  hypothetical protein  27.58 
 
 
354 aa  113  5e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.43917  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2050  hypothetical protein  25.36 
 
 
373 aa  113  6e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2015  protein of unknown function UPF0118  29.82 
 
 
354 aa  113  6e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000281213 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2679  hypothetical protein  28.62 
 
 
352 aa  113  6e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0689913  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0540  protein of unknown function UPF0118  27.73 
 
 
349 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0560  protein of unknown function UPF0118  25.44 
 
 
339 aa  112  9e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3717  hypothetical protein  26.05 
 
 
353 aa  112  9e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396811  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0826  hypothetical protein  26.59 
 
 
369 aa  112  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.981363  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2601  hypothetical protein  31.4 
 
 
352 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.99204  normal  0.455316 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0203  hypothetical protein  27.51 
 
 
362 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0013  hypothetical protein  39.07 
 
 
363 aa  111  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00247664 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2289  hypothetical protein  26.43 
 
 
353 aa  110  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.864507  normal  0.333993 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1855  hypothetical protein  25.45 
 
 
354 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0258165 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3210  hypothetical protein  24.36 
 
 
354 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.212604 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3249  hypothetical protein  28.96 
 
 
350 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.691639  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0192  protein of unknown function UPF0118  30.22 
 
 
358 aa  109  9.000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.146754  normal  0.226796 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2294  hypothetical protein  29.57 
 
 
360 aa  108  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0460  hypothetical protein  26.9 
 
 
352 aa  107  3e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.353952  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2147  hypothetical protein  30.15 
 
 
357 aa  107  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0400  hypothetical protein  26.9 
 
 
372 aa  107  4e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.413713  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4556  hypothetical protein  26.46 
 
 
398 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.173549  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3807  hypothetical protein  26.46 
 
 
353 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.911463  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0940  protein of unknown function UPF0118  29.56 
 
 
345 aa  107  4e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.726387  normal  0.96935 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3717  hypothetical protein  26.46 
 
 
350 aa  106  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0661403  normal  0.22421 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1830  hypothetical protein  26.38 
 
 
354 aa  106  5e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1868  hypothetical protein  29.64 
 
 
399 aa  106  6e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0467497  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1275  hypothetical protein  28.61 
 
 
354 aa  106  7e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3427  hypothetical protein  25.14 
 
 
355 aa  106  8e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1042  protein of unknown function UPF0118  31.4 
 
 
368 aa  105  9e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.840746  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0336  hypothetical protein  23.24 
 
 
372 aa  105  1e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000639163  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1300  protein of unknown function UPF0118  28.49 
 
 
345 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.316018  normal  0.608638 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4064  permease  26.98 
 
 
349 aa  104  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>