More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1300 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1300  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 		 345 aa  696    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.316018  normal  0.608638 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0792  protein of unknown function UPF0118  39.22 
 
 		 344 aa  255  9e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.101192 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13258  putative transmembrane protein  35.31 
 
 		 339 aa  199  5e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4237  protein of unknown function UPF0118  29.12 
 
 		 350 aa  143  4e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2741  protein of unknown function UPF0118  28.89 
 
 		 355 aa  132  6.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000351921  hitchhiker  0.0000000742293 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2413  hypothetical protein  27.49 
 
 		 345 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.480547  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0560  protein of unknown function UPF0118  26.74 
 
 		 339 aa  115  7.999999999999999e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1154  hypothetical protein  31 
 
 		 358 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000550105  normal  0.0344505 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0292  hypothetical protein  24.44 
 
 		 391 aa  110  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2764  hypothetical protein  24.63 
 
 		 346 aa  109  6e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.327799  normal  0.0566584 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0152  putative lipoprotein  30.04 
 
 		 361 aa  106  5e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4026  hypothetical protein  28.49 
 
 		 360 aa  105  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4988  hypothetical protein  24.53 
 
 		 347 aa  104  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3492  hypothetical protein  25.3 
 
 		 387 aa  104  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.705437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29820  hypothetical protein  25.72 
 
 		 352 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0125581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0901  protein of unknown function UPF0118  28.29 
 
 		 365 aa  103  5e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2012  protein of unknown function UPF0118  30.73 
 
 		 363 aa  102  6e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.578603 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2549  hypothetical protein  24.68 
 
 		 352 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705186  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2573  membrane protein  28.03 
 
 		 361 aa  101  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0987  hypothetical protein  24.32 
 
 		 394 aa  100  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.89372 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0854  membrane protein  31.84 
 
 		 363 aa  100  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0563046  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3708  hypothetical protein  29.89 
 
 		 355 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.168874 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5533  hypothetical protein  29.89 
 
 		 355 aa  99.8  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2448  hypothetical protein  25.45 
 
 		 415 aa  99.4  8e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0466557  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4556  hypothetical protein  29.35 
 
 		 398 aa  99.4  9e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.173549  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0020  hypothetical protein  28.27 
 
 		 358 aa  98.6  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1821  hypothetical protein  27.96 
 
 		 381 aa  98.2  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.693161 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2289  hypothetical protein  25.62 
 
 		 353 aa  98.2  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.864507  normal  0.333993 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3717  hypothetical protein  29.35 
 
 		 350 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0661403  normal  0.22421 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1907  protein of unknown function UPF0118  27.96 
 
 		 352 aa  98.2  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2083  hypothetical protein  22.82 
 
 		 356 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.251587 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1950  protein of unknown function UPF0118  23.96 
 
 		 346 aa  98.2  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.863146  normal  0.537489 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3807  hypothetical protein  29.35 
 
 		 353 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.911463  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4931  hypothetical protein  29.38 
 
 		 353 aa  98.2  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.850306  normal  0.602485 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2425  hypothetical protein  28.85 
 
 		 363 aa  98.2  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0488  hypothetical protein  29.08 
 
 		 371 aa  97.4  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.131577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0549  protein of unknown function UPF0118  22.12 
 
 		 384 aa  96.7  6e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0941477  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1102  hypothetical protein  25.98 
 
 		 365 aa  95.5  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00400546  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0338  protein of unknown function UPF0118  28.25 
 
 		 363 aa  94.4  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3249  hypothetical protein  27.78 
 
 		 350 aa  94.7  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.691639  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0276  protein of unknown function UPF0118  28.49 
 
 		 423 aa  94.4  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.133789  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2958  protein of unknown function UPF0118  26.42 
 
 		 339 aa  94.4  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4411  protein of unknown function UPF0118  22.29 
 
 		 389 aa  93.6  4e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1226  hypothetical protein  25.29 
 
 		 352 aa  93.2  5e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3181  hypothetical protein  25.08 
 
 		 419 aa  93.6  5e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.423402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0540  protein of unknown function UPF0118  28.07 
 
 		 349 aa  93.6  5e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4731  hypothetical protein  28.14 
 
 		 359 aa  93.6  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.226742  hitchhiker  0.00240822 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2229  hypothetical protein  27.69 
 
 		 392 aa  92.8  7e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0338  hypothetical protein  22.96 
 
 		 365 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88474  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0826  hypothetical protein  20.45 
 
 		 369 aa  91.3  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.981363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0916  protein of unknown function UPF0118  22.99 
 
 		 355 aa  90.9  3e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.116301  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3950  protein of unknown function UPF0118  21.49 
 
 		 360 aa  90.9  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0529  hypothetical protein  28.65 
 
 		 352 aa  90.1  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1633  hypothetical protein  28.65 
 
 		 352 aa  89.7  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2642  hypothetical protein  28.65 
 
 		 352 aa  89.7  6e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00776691  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3980  hypothetical protein  24.32 
 
 		 352 aa  89.7  6e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0869717 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1436  hypothetical protein  28.65 
 
 		 352 aa  89.7  6e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0253  hypothetical protein  28.65 
 
 		 352 aa  89.7  6e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.077494  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2503  hypothetical protein  28.65 
 
 		 352 aa  89.7  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0937  PerM family permease  28.65 
 
 		 374 aa  89.7  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0289  hypothetical protein  28.65 
 
 		 352 aa  89.7  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.700262  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2238  protein of unknown function UPF0118  28.07 
 
 		 379 aa  89.7  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.605073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3189  protein of unknown function UPF0118  28.57 
 
 		 361 aa  89.4  9e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000846761  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3210  hypothetical protein  24.03 
 
 		 354 aa  89  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.212604 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4130  hypothetical protein  23.31 
 
 		 406 aa  88.6  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.189132  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2868  hypothetical protein  26.58 
 
 		 358 aa  88.6  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838475  normal  0.0422213 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3427  hypothetical protein  23.23 
 
 		 355 aa  87.8  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3082  protein of unknown function UPF0118  29.24 
 
 		 397 aa  88.2  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0783  hypothetical protein  27.32 
 
 		 353 aa  88.2  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3717  hypothetical protein  22.92 
 
 		 353 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396811  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0262  hypothetical protein  23.23 
 
 		 334 aa  87.4  3e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00766044 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11000  hypothetical protein  22.82 
 
 		 346 aa  87.4  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2709  hypothetical protein  24.68 
 
 		 362 aa  87  4e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0491  hypothetical protein  25.26 
 
 		 359 aa  86.7  5e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000229793  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1639  hypothetical protein  22.58 
 
 		 334 aa  86.7  5e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0203  hypothetical protein  27.93 
 
 		 362 aa  86.7  6e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002589  predicted permease  31.3 
 
 		 361 aa  85.5  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00334796  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03420  hypothetical protein  28.33 
 
 		 361 aa  85.9  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1707  protein of unknown function UPF0118  28.65 
 
 		 504 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2679  hypothetical protein  31.68 
 
 		 352 aa  85.9  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0689913  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2610  protein of unknown function UPF0118  25.2 
 
 		 370 aa  84.7  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3378  hypothetical protein  24.35 
 
 		 354 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0574  hypothetical protein  23.68 
 
 		 321 aa  83.6  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.877456  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1732  protein of unknown function UPF0118  28.57 
 
 		 355 aa  83.2  0.000000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000390095  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4053  hypothetical protein  28.92 
 
 		 361 aa  83.2  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.920687 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0268  protein of unknown function UPF0118  28.12 
 
 		 363 aa  82.8  0.000000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2050  hypothetical protein  22.08 
 
 		 373 aa  82.8  0.000000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0399  protein of unknown function UPF0118  25.64 
 
 		 346 aa  81.6  0.00000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0737  hypothetical protein  25.13 
 
 		 356 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.203827  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1578  protein of unknown function UPF0118  26.07 
 
 		 373 aa  81.6  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.373133  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2212  protein of unknown function UPF0118  26.81 
 
 		 355 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000181482  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7289  hypothetical protein  26.94 
 
 		 353 aa  79.7  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1042  protein of unknown function UPF0118  36.17 
 
 		 368 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.840746  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1563  hypothetical protein  25.87 
 
 		 398 aa  79.3  0.00000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.78708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4931  hypothetical protein  26.56 
 
 		 351 aa  79  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0810  protein of unknown function UPF0118  29.89 
 
 		 351 aa  78.6  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2676  hypothetical protein  26.9 
 
 		 388 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0661  hypothetical protein  29.89 
 
 		 351 aa  78.6  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4645  hypothetical protein  24.47 
 
 		 396 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2029  hypothetical protein  25.83 
 
 		 348 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.850073 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>