More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1042 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1042  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 		 368 aa  733    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.840746  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2836  hypothetical protein  38.05 
 
 		 352 aa  176  6e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.93454  normal  0.972453 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0783  hypothetical protein  27.99 
 
 		 353 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1154  hypothetical protein  28.36 
 
 		 358 aa  120  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000550105  normal  0.0344505 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2709  hypothetical protein  34.67 
 
 		 362 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0854  membrane protein  27.22 
 
 		 363 aa  109  8.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0563046  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4026  hypothetical protein  31.4 
 
 		 360 aa  106  7e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3082  protein of unknown function UPF0118  29.45 
 
 		 397 aa  105  9e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3189  protein of unknown function UPF0118  32.03 
 
 		 361 aa  105  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000846761  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4411  protein of unknown function UPF0118  27.37 
 
 		 389 aa  102  8e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1868  hypothetical protein  40.71 
 
 		 399 aa  102  9e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0467497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0268  protein of unknown function UPF0118  28.37 
 
 		 363 aa  102  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0338  hypothetical protein  26.8 
 
 		 365 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88474  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4130  hypothetical protein  26.37 
 
 		 406 aa  101  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.189132  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2012  protein of unknown function UPF0118  27.78 
 
 		 363 aa  101  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.578603 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0549  protein of unknown function UPF0118  27.97 
 
 		 384 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0941477  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0987  hypothetical protein  27.21 
 
 		 394 aa  99.8  8e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.89372 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4731  hypothetical protein  29.68 
 
 		 359 aa  99  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.226742  hitchhiker  0.00240822 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2601  hypothetical protein  44.83 
 
 		 352 aa  96.7  6e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.99204  normal  0.455316 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3249  hypothetical protein  27.24 
 
 		 350 aa  96.7  6e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.691639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0192  protein of unknown function UPF0118  28.79 
 
 		 358 aa  95.9  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.146754  normal  0.226796 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1578  protein of unknown function UPF0118  36.08 
 
 		 373 aa  95.1  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.373133  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0488  hypothetical protein  31.01 
 
 		 371 aa  94.4  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.131577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0338  protein of unknown function UPF0118  33.99 
 
 		 363 aa  94  4e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2448  hypothetical protein  26.82 
 
 		 415 aa  94  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0466557  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0152  putative lipoprotein  34.57 
 
 		 361 aa  92.8  8e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0292  hypothetical protein  26.22 
 
 		 391 aa  92.8  8e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2238  protein of unknown function UPF0118  33.99 
 
 		 379 aa  92.4  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.605073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0020  hypothetical protein  30.58 
 
 		 358 aa  91.7  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0491  hypothetical protein  35.34 
 
 		 359 aa  91.3  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000229793  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1102  hypothetical protein  44.03 
 
 		 365 aa  90.9  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00400546  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2209  hypothetical protein  35.2 
 
 		 409 aa  90.5  4e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3210  hypothetical protein  26.76 
 
 		 354 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.212604 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3717  hypothetical protein  25.56 
 
 		 353 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396811  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2573  membrane protein  35.22 
 
 		 361 aa  89.7  7e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2098  hypothetical protein  27.62 
 
 		 368 aa  89.7  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2868  hypothetical protein  38.1 
 
 		 358 aa  89.4  9e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838475  normal  0.0422213 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2083  hypothetical protein  28.29 
 
 		 356 aa  89.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.251587 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3181  hypothetical protein  35.57 
 
 		 419 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.423402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3980  hypothetical protein  34.23 
 
 		 352 aa  88.2  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0869717 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29820  hypothetical protein  27.15 
 
 		 352 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0125581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0560  protein of unknown function UPF0118  36.09 
 
 		 339 aa  87.4  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4053  hypothetical protein  32.05 
 
 		 361 aa  87.8  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.920687 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0810  protein of unknown function UPF0118  36.3 
 
 		 351 aa  87.4  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0271  hypothetical protein  35.4 
 
 		 379 aa  87  4e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0661  hypothetical protein  36.3 
 
 		 351 aa  87.4  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2207  hypothetical protein  24.72 
 
 		 354 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3378  hypothetical protein  26.62 
 
 		 354 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3492  hypothetical protein  29.27 
 
 		 387 aa  85.9  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.705437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0988  hypothetical protein  30.7 
 
 		 346 aa  85.9  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.500729  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1102  protein of unknown function UPF0118  30.7 
 
 		 346 aa  85.9  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3734  hypothetical protein  26.72 
 
 		 350 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0297  hypothetical protein  34.78 
 
 		 379 aa  84.7  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0582  hypothetical protein  26.45 
 
 		 367 aa  84.7  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0275552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3531  hypothetical protein  24.72 
 
 		 354 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.43917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2549  hypothetical protein  25.33 
 
 		 352 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705186  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0737  hypothetical protein  35.21 
 
 		 356 aa  84  0.000000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.203827  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1821  hypothetical protein  27.04 
 
 		 381 aa  84  0.000000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.693161 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1907  protein of unknown function UPF0118  27.04 
 
 		 352 aa  83.6  0.000000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1563  hypothetical protein  30.31 
 
 		 398 aa  83.2  0.000000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.78708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1732  protein of unknown function UPF0118  32.83 
 
 		 355 aa  82.8  0.000000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000390095  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2998  hypothetical protein  34.75 
 
 		 359 aa  82.8  0.000000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2050  hypothetical protein  26.73 
 
 		 373 aa  82.8  0.000000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2029  hypothetical protein  31.55 
 
 		 348 aa  82.8  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.850073 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0826  hypothetical protein  33.57 
 
 		 369 aa  82.4  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.981363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4200  hypothetical protein  29.47 
 
 		 346 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1707  protein of unknown function UPF0118  33.53 
 
 		 504 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2369  hypothetical protein  25.91 
 
 		 357 aa  82  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00120754  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1830  hypothetical protein  24.5 
 
 		 354 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4931  hypothetical protein  26.15 
 
 		 351 aa  80.9  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03420  hypothetical protein  37.6 
 
 		 361 aa  81.3  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1855  hypothetical protein  23.86 
 
 		 354 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0258165 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2679  hypothetical protein  27.86 
 
 		 352 aa  80.5  0.00000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0689913  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1300  protein of unknown function UPF0118  36.17 
 
 		 345 aa  80.1  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.316018  normal  0.608638 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0203  hypothetical protein  25.23 
 
 		 362 aa  79.7  0.00000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11000  hypothetical protein  25.21 
 
 		 346 aa  79.7  0.00000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2221  lipoprotein, putative  25.26 
 
 		 349 aa  79.7  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0102435  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1381  protein of unknown function UPF0118  37.78 
 
 		 371 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.0000000171014  decreased coverage  0.00070323 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2425  hypothetical protein  24.7 
 
 		 363 aa  79.3  0.00000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2229  hypothetical protein  34.06 
 
 		 392 aa  79  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2212  protein of unknown function UPF0118  27.2 
 
 		 355 aa  79  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000181482  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2958  protein of unknown function UPF0118  29.71 
 
 		 339 aa  78.6  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0540  protein of unknown function UPF0118  25.1 
 
 		 349 aa  77.8  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002589  predicted permease  37.6 
 
 		 361 aa  77.8  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00334796  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11122  hypothetical protein  24.87 
 
 		 385 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2147  hypothetical protein  35.09 
 
 		 357 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1226  hypothetical protein  29.37 
 
 		 352 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0228  hypothetical protein  26.09 
 
 		 356 aa  77  0.0000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0901  protein of unknown function UPF0118  22.7 
 
 		 365 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2633  hypothetical protein  32.82 
 
 		 365 aa  76.6  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1219  protein of unknown function UPF0118  29.51 
 
 		 355 aa  76.6  0.0000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000032504  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2413  hypothetical protein  30.52 
 
 		 345 aa  76.3  0.0000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.480547  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4556  hypothetical protein  25.49 
 
 		 398 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.173549  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3950  protein of unknown function UPF0118  31.97 
 
 		 360 aa  76.3  0.0000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4162  hypothetical protein  26.17 
 
 		 350 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0916  protein of unknown function UPF0118  32.31 
 
 		 355 aa  75.5  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.116301  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1705  hypothetical protein  26.17 
 
 		 349 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.873743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0013  hypothetical protein  39.26 
 
 		 363 aa  74.7  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00247664 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2294  hypothetical protein  38.89 
 
 		 360 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13258  putative transmembrane protein  31.47 
 
 		 339 aa  75.1  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>