289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0192 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0192  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 		 358 aa  687    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.146754  normal  0.226796 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0582  hypothetical protein  35.91 
 
 		 367 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0275552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1381  protein of unknown function UPF0118  36.65 
 
 		 371 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.0000000171014  decreased coverage  0.00070323 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2676  hypothetical protein  36.62 
 
 		 388 aa  195  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2029  hypothetical protein  35.15 
 
 		 348 aa  191  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.850073 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3734  hypothetical protein  36.36 
 
 		 350 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4162  hypothetical protein  35.58 
 
 		 350 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3174  hypothetical protein  36.34 
 
 		 371 aa  181  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169461  normal  0.752301 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1705  hypothetical protein  35.8 
 
 		 349 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.873743  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2221  lipoprotein, putative  33.94 
 
 		 349 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0102435  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1973  hypothetical protein  35.42 
 
 		 382 aa  178  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000012652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3487  hypothetical protein  35.24 
 
 		 354 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4200  hypothetical protein  34.26 
 
 		 346 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10160  hypothetical protein  36.75 
 
 		 364 aa  174  2.9999999999999996e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.406243  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0661  hypothetical protein  37.24 
 
 		 351 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0810  protein of unknown function UPF0118  37.24 
 
 		 351 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2457  hypothetical protein  35.88 
 
 		 362 aa  160  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3648  hypothetical protein  36.65 
 
 		 354 aa  157  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.505772  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43510  hypothetical protein  36.02 
 
 		 355 aa  156  4e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4061  hypothetical protein  34.15 
 
 		 351 aa  156  6e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2098  hypothetical protein  32.08 
 
 		 368 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2633  hypothetical protein  30.79 
 
 		 365 aa  150  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0268  protein of unknown function UPF0118  32.6 
 
 		 363 aa  150  4e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0405  hypothetical protein  32.38 
 
 		 374 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3486  hypothetical protein  34.15 
 
 		 375 aa  147  3e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.12464 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2709  hypothetical protein  30.29 
 
 		 362 aa  144  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1578  protein of unknown function UPF0118  33.23 
 
 		 373 aa  144  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.373133  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1658  putative inner membrane protein  30.79 
 
 		 364 aa  137  4e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4321  hypothetical protein  30.91 
 
 		 380 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0949244  normal  0.333615 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0297  hypothetical protein  30.49 
 
 		 379 aa  135  9.999999999999999e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0013  hypothetical protein  34.27 
 
 		 363 aa  135  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00247664 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3243  hypothetical protein  30.58 
 
 		 356 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.340258  normal  0.654322 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0271  hypothetical protein  30.49 
 
 		 379 aa  133  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2601  hypothetical protein  34.47 
 
 		 352 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.99204  normal  0.455316 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1746  putative inner membrane protein  31.69 
 
 		 371 aa  131  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00422506 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4274  hypothetical protein  30.28 
 
 		 356 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.444788  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1690  putative inner membrane protein  30.23 
 
 		 370 aa  130  3e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.534784  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1154  hypothetical protein  32.81 
 
 		 358 aa  130  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000550105  normal  0.0344505 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2209  hypothetical protein  29.82 
 
 		 409 aa  130  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1844  putative inner membrane protein  26.61 
 
 		 367 aa  130  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1738  putative inner membrane protein  26.61 
 
 		 367 aa  130  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2741  hypothetical protein  28.14 
 
 		 369 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0984  hypothetical protein  32.32 
 
 		 356 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1484  hypothetical protein  32.62 
 
 		 356 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1401  hypothetical protein  32.62 
 
 		 356 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0130  hypothetical protein  32.62 
 
 		 356 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2299  hypothetical protein  32.32 
 
 		 356 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0518  hypothetical protein  32.62 
 
 		 356 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1735  hypothetical protein  31.4 
 
 		 356 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.661691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1067  hypothetical protein  32.32 
 
 		 356 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2910  hypothetical protein  28.14 
 
 		 369 aa  127  3e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2819  hypothetical protein  27.54 
 
 		 369 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2403  putative inner membrane protein  30.77 
 
 		 370 aa  125  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0340493 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2597  putative inner membrane protein  26.61 
 
 		 365 aa  125  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5665  hypothetical protein  29.79 
 
 		 362 aa  125  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0783  hypothetical protein  31.68 
 
 		 353 aa  125  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01657  predicted inner membrane protein  30.77 
 
 		 370 aa  125  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1954  protein of unknown function UPF0118  30.77 
 
 		 370 aa  125  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.133227  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1889  putative inner membrane protein  30.77 
 
 		 370 aa  125  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1769  putative inner membrane protein  30.77 
 
 		 370 aa  125  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1904  putative inner membrane protein  30.77 
 
 		 370 aa  125  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1508  putative inner membrane protein  30.77 
 
 		 370 aa  124  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188442 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1943  putative inner membrane protein  30.77 
 
 		 370 aa  125  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000987664 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3044  hypothetical protein  29.32 
 
 		 398 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4551  hypothetical protein  33.54 
 
 		 359 aa  120  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0235388 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1564  putative transmembrane transport protein  28.82 
 
 		 406 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0215  hypothetical protein  28.82 
 
 		 406 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.776259 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3398  hypothetical protein  29.45 
 
 		 360 aa  119  6e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0854  membrane protein  30.17 
 
 		 363 aa  119  9e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0563046  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0767  hypothetical protein  31.38 
 
 		 350 aa  118  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1696  hypothetical protein  32.01 
 
 		 391 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.551892  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2756  putative inner membrane protein  30.25 
 
 		 369 aa  118  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3702  hypothetical protein  30.58 
 
 		 356 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5011  protein of unknown function UPF0118  32.93 
 
 		 359 aa  117  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.022243  normal  0.128908 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0862  hypothetical protein  26.73 
 
 		 360 aa  117  3e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4026  hypothetical protein  30.53 
 
 		 360 aa  117  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0120  hypothetical protein  27.53 
 
 		 370 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2175  hypothetical protein  28.57 
 
 		 366 aa  117  3.9999999999999997e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0131226 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4180  hypothetical protein  30.28 
 
 		 356 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.664917 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1686  hypothetical protein  31.61 
 
 		 390 aa  116  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2454  putative inner membrane protein  30.25 
 
 		 395 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.272244  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0560  protein of unknown function UPF0118  27.86 
 
 		 339 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1275  hypothetical protein  30.12 
 
 		 354 aa  113  5e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1808  putative inner membrane protein  27.79 
 
 		 372 aa  113  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1476  putative inner membrane protein  27.79 
 
 		 372 aa  113  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.655079  hitchhiker  0.000276 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1460  putative inner membrane protein  27.79 
 
 		 372 aa  113  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.539422  normal  0.149027 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5064  protein of unknown function UPF0118  32.7 
 
 		 359 aa  113  6e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.949113 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1979  putative inner membrane protein  27.79 
 
 		 372 aa  113  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.591827  hitchhiker  0.00000561887 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1495  putative inner membrane protein  27.79 
 
 		 372 aa  113  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138717 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2900  hypothetical protein  27.56 
 
 		 379 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3492  hypothetical protein  31.75 
 
 		 387 aa  112  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.705437  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4608  hypothetical protein  23.84 
 
 		 370 aa  111  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.991825  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0796  hypothetical protein  31.88 
 
 		 350 aa  109  8.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4064  permease  30.09 
 
 		 349 aa  109  8.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1709  hypothetical protein  31.19 
 
 		 388 aa  109  8.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.615575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4411  protein of unknown function UPF0118  26.65 
 
 		 389 aa  108  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06643  hypothetical protein  31.13 
 
 		 365 aa  108  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0593  hypothetical protein  27.5 
 
 		 376 aa  108  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.356961  normal  0.748294 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6456  hypothetical protein  27.61 
 
 		 367 aa  108  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.267604 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2169  hypothetical protein  29.39 
 
 		 354 aa  108  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.344347  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>