More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2221 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2221  lipoprotein, putative  100 
 
 		 349 aa  673    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0102435  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2029  hypothetical protein  96.54 
 
 		 348 aa  634    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.850073 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4200  hypothetical protein  86.88 
 
 		 346 aa  568  1e-161  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1705  hypothetical protein  79.6 
 
 		 349 aa  517  1e-146  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.873743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3734  hypothetical protein  78.51 
 
 		 350 aa  518  1e-146  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4162  hypothetical protein  78.51 
 
 		 350 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3487  hypothetical protein  80.17 
 
 		 354 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2457  hypothetical protein  78.43 
 
 		 362 aa  457  1e-127  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3648  hypothetical protein  72.81 
 
 		 354 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.505772  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43510  hypothetical protein  70.69 
 
 		 355 aa  432  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10160  hypothetical protein  73.84 
 
 		 364 aa  426  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.406243  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0582  hypothetical protein  45.32 
 
 		 367 aa  290  2e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0275552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2676  hypothetical protein  44.71 
 
 		 388 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1381  protein of unknown function UPF0118  43.73 
 
 		 371 aa  263  3e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.0000000171014  decreased coverage  0.00070323 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3174  hypothetical protein  44.02 
 
 		 371 aa  249  4e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169461  normal  0.752301 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1973  hypothetical protein  45.06 
 
 		 382 aa  249  4e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000012652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4061  hypothetical protein  38.84 
 
 		 351 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5665  hypothetical protein  36.69 
 
 		 362 aa  204  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3486  hypothetical protein  34.9 
 
 		 375 aa  202  7e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.12464 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1690  putative inner membrane protein  36.47 
 
 		 370 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.534784  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1746  putative inner membrane protein  35.92 
 
 		 371 aa  196  4.0000000000000005e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00422506 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1508  putative inner membrane protein  36.81 
 
 		 370 aa  194  2e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188442 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01657  predicted inner membrane protein  36.81 
 
 		 370 aa  192  6e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1954  protein of unknown function UPF0118  36.81 
 
 		 370 aa  192  6e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.133227  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2633  hypothetical protein  33.33 
 
 		 365 aa  192  6e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1889  putative inner membrane protein  36.81 
 
 		 370 aa  192  6e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1904  putative inner membrane protein  36.81 
 
 		 370 aa  192  6e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1943  putative inner membrane protein  36.81 
 
 		 370 aa  192  6e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000987664 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1769  putative inner membrane protein  36.81 
 
 		 370 aa  192  6e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2403  putative inner membrane protein  36.81 
 
 		 370 aa  192  6e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0340493 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2756  putative inner membrane protein  38.46 
 
 		 369 aa  192  8e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1738  putative inner membrane protein  33.93 
 
 		 367 aa  190  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1844  putative inner membrane protein  33.93 
 
 		 367 aa  190  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2454  putative inner membrane protein  36.92 
 
 		 395 aa  187  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.272244  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2597  putative inner membrane protein  33.93 
 
 		 365 aa  185  9e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2175  hypothetical protein  35.86 
 
 		 366 aa  185  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0131226 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2209  hypothetical protein  34.67 
 
 		 409 aa  182  7e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0192  protein of unknown function UPF0118  32.66 
 
 		 358 aa  181  2e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.146754  normal  0.226796 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2709  hypothetical protein  32.72 
 
 		 362 aa  178  1e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0862  hypothetical protein  34.06 
 
 		 360 aa  176  6e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1658  putative inner membrane protein  35.19 
 
 		 364 aa  176  7e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1686  hypothetical protein  34.8 
 
 		 390 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5187  hypothetical protein  33.73 
 
 		 381 aa  175  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.503723 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1808  putative inner membrane protein  36.6 
 
 		 372 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1476  putative inner membrane protein  36.31 
 
 		 372 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.655079  hitchhiker  0.000276 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1979  putative inner membrane protein  36.31 
 
 		 372 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.591827  hitchhiker  0.00000561887 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1460  putative inner membrane protein  36.31 
 
 		 372 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.539422  normal  0.149027 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1495  putative inner membrane protein  36.31 
 
 		 372 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138717 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0661  hypothetical protein  35.69 
 
 		 351 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0810  protein of unknown function UPF0118  35.69 
 
 		 351 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2169  hypothetical protein  34.22 
 
 		 354 aa  173  3.9999999999999995e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.344347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0405  hypothetical protein  31.88 
 
 		 374 aa  171  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0271  hypothetical protein  33.24 
 
 		 379 aa  171  3e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2601  hypothetical protein  35.17 
 
 		 352 aa  170  3e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.99204  normal  0.455316 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0268  protein of unknown function UPF0118  33.33 
 
 		 363 aa  169  5e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0297  hypothetical protein  33.91 
 
 		 379 aa  167  2e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4043  protein of unknown function UPF0118  35.31 
 
 		 385 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3398  hypothetical protein  32.35 
 
 		 360 aa  163  5.0000000000000005e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1578  protein of unknown function UPF0118  31.75 
 
 		 373 aa  159  5e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.373133  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0593  hypothetical protein  32.56 
 
 		 376 aa  159  9e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.356961  normal  0.748294 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4608  hypothetical protein  30.12 
 
 		 370 aa  145  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.991825  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1843  hypothetical protein  29.81 
 
 		 383 aa  143  5e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2819  hypothetical protein  28.53 
 
 		 369 aa  142  8e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2741  hypothetical protein  28.1 
 
 		 369 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06643  hypothetical protein  29.09 
 
 		 365 aa  141  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6456  hypothetical protein  31.34 
 
 		 367 aa  139  7e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.267604 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2098  hypothetical protein  32 
 
 		 368 aa  138  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1154  hypothetical protein  30.46 
 
 		 358 aa  137  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000550105  normal  0.0344505 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0691  hypothetical protein  29.45 
 
 		 377 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.627447 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3036  protein of unknown function UPF0118  29.97 
 
 		 363 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3084  protein of unknown function UPF0118  29.97 
 
 		 363 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2910  hypothetical protein  26.89 
 
 		 369 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0120  hypothetical protein  30.03 
 
 		 370 aa  134  3e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1709  hypothetical protein  30.68 
 
 		 388 aa  133  5e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.615575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001141  hypothetical protein  30.06 
 
 		 382 aa  131  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1702  hypothetical protein  30.3 
 
 		 360 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.221894  normal  0.568838 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1906  membrane protein  27.16 
 
 		 353 aa  129  5.0000000000000004e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0890459  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2900  hypothetical protein  30.7 
 
 		 379 aa  129  6e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44170  hypothetical protein  29.29 
 
 		 368 aa  127  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.392978  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0013  hypothetical protein  35.69 
 
 		 363 aa  125  8.000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00247664 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0338  hypothetical protein  29.82 
 
 		 365 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88474  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0130  hypothetical protein  28.92 
 
 		 356 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1401  hypothetical protein  28.92 
 
 		 356 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0518  hypothetical protein  28.92 
 
 		 356 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1484  hypothetical protein  28.92 
 
 		 356 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0783  hypothetical protein  29.62 
 
 		 353 aa  124  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2299  hypothetical protein  28.26 
 
 		 356 aa  122  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0984  hypothetical protein  28.26 
 
 		 356 aa  122  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4945  protein of unknown function UPF0118  29.68 
 
 		 360 aa  122  6e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0255148  normal  0.175503 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0854  membrane protein  32.39 
 
 		 363 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0563046  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3280  hypothetical protein  27.92 
 
 		 361 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.300759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1067  hypothetical protein  28.26 
 
 		 356 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0111  hypothetical protein  29.03 
 
 		 391 aa  120  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.239724 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2147  hypothetical protein  31.52 
 
 		 357 aa  120  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4321  hypothetical protein  28.09 
 
 		 380 aa  120  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0949244  normal  0.333615 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4931  hypothetical protein  32.53 
 
 		 351 aa  119  7.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4064  permease  28.36 
 
 		 349 aa  118  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1020  membrane protein  24.32 
 
 		 355 aa  118  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0549  protein of unknown function UPF0118  30.79 
 
 		 384 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0941477  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0748  hypothetical protein  29.28 
 
 		 365 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>