More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_1705 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_1705  hypothetical protein  100 
 
 		 349 aa  665    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.873743  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4162  hypothetical protein  99.43 
 
 		 350 aa  624  1e-178  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3734  hypothetical protein  95.71 
 
 		 350 aa  607  1e-173  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3487  hypothetical protein  92.55 
 
 		 354 aa  591  1e-168  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4200  hypothetical protein  82.9 
 
 		 346 aa  548  1e-155  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2029  hypothetical protein  79.94 
 
 		 348 aa  526  1e-148  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.850073 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2221  lipoprotein, putative  79.6 
 
 		 349 aa  514  1e-144  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0102435  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2457  hypothetical protein  74.79 
 
 		 362 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3648  hypothetical protein  68.48 
 
 		 354 aa  422  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.505772  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43510  hypothetical protein  68.88 
 
 		 355 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10160  hypothetical protein  71.72 
 
 		 364 aa  413  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.406243  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0582  hypothetical protein  45.92 
 
 		 367 aa  288  1e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0275552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2676  hypothetical protein  45.54 
 
 		 388 aa  271  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1381  protein of unknown function UPF0118  44.25 
 
 		 371 aa  263  4e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.0000000171014  decreased coverage  0.00070323 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3174  hypothetical protein  44.54 
 
 		 371 aa  249  5e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169461  normal  0.752301 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1973  hypothetical protein  44.44 
 
 		 382 aa  247  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000012652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4061  hypothetical protein  41.4 
 
 		 351 aa  219  5e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2756  putative inner membrane protein  37.76 
 
 		 369 aa  205  8e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3486  hypothetical protein  35.61 
 
 		 375 aa  205  1e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.12464 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1746  putative inner membrane protein  37.08 
 
 		 371 aa  204  3e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00422506 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5665  hypothetical protein  37.69 
 
 		 362 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2454  putative inner membrane protein  36.86 
 
 		 395 aa  200  3e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.272244  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1738  putative inner membrane protein  32.06 
 
 		 367 aa  195  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2403  putative inner membrane protein  35.03 
 
 		 370 aa  194  1e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0340493 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1844  putative inner membrane protein  32.06 
 
 		 367 aa  195  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01657  predicted inner membrane protein  35.03 
 
 		 370 aa  194  2e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1954  protein of unknown function UPF0118  35.03 
 
 		 370 aa  194  2e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.133227  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1769  putative inner membrane protein  35.03 
 
 		 370 aa  194  2e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1904  putative inner membrane protein  35.03 
 
 		 370 aa  194  2e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1889  putative inner membrane protein  35.03 
 
 		 370 aa  194  2e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1943  putative inner membrane protein  35.03 
 
 		 370 aa  194  2e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000987664 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1508  putative inner membrane protein  35.03 
 
 		 370 aa  194  3e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188442 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2175  hypothetical protein  36.73 
 
 		 366 aa  194  3e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0131226 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1690  putative inner membrane protein  34.69 
 
 		 370 aa  191  1e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.534784  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2597  putative inner membrane protein  32.06 
 
 		 365 aa  191  2e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0405  hypothetical protein  34.52 
 
 		 374 aa  186  8e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2633  hypothetical protein  31.55 
 
 		 365 aa  183  3e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1808  putative inner membrane protein  36.13 
 
 		 372 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1460  putative inner membrane protein  35.85 
 
 		 372 aa  183  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.539422  normal  0.149027 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1495  putative inner membrane protein  35.85 
 
 		 372 aa  183  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138717 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1476  putative inner membrane protein  35.85 
 
 		 372 aa  183  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.655079  hitchhiker  0.000276 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1979  putative inner membrane protein  35.85 
 
 		 372 aa  183  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.591827  hitchhiker  0.00000561887 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0810  protein of unknown function UPF0118  36.92 
 
 		 351 aa  182  6e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0661  hypothetical protein  36.92 
 
 		 351 aa  182  6e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0192  protein of unknown function UPF0118  33.14 
 
 		 358 aa  181  1e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.146754  normal  0.226796 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2709  hypothetical protein  33.44 
 
 		 362 aa  181  2e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0268  protein of unknown function UPF0118  36.14 
 
 		 363 aa  179  4e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1658  putative inner membrane protein  34.5 
 
 		 364 aa  178  1e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2601  hypothetical protein  37.31 
 
 		 352 aa  177  3e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.99204  normal  0.455316 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2209  hypothetical protein  34.3 
 
 		 409 aa  176  4e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0862  hypothetical protein  34.58 
 
 		 360 aa  172  6.999999999999999e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3398  hypothetical protein  31.36 
 
 		 360 aa  170  4e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5187  hypothetical protein  34.47 
 
 		 381 aa  169  8e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.503723 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4043  protein of unknown function UPF0118  35.67 
 
 		 385 aa  168  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2169  hypothetical protein  34.31 
 
 		 354 aa  168  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.344347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1578  protein of unknown function UPF0118  33.64 
 
 		 373 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.373133  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0297  hypothetical protein  33.63 
 
 		 379 aa  165  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1686  hypothetical protein  33.05 
 
 		 390 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0271  hypothetical protein  33.14 
 
 		 379 aa  163  4.0000000000000004e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0593  hypothetical protein  32.33 
 
 		 376 aa  150  3e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.356961  normal  0.748294 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4608  hypothetical protein  29.43 
 
 		 370 aa  147  3e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.991825  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1154  hypothetical protein  30.81 
 
 		 358 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000550105  normal  0.0344505 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2741  hypothetical protein  28.11 
 
 		 369 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2819  hypothetical protein  28.11 
 
 		 369 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6456  hypothetical protein  31.44 
 
 		 367 aa  140  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.267604 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0120  hypothetical protein  31.87 
 
 		 370 aa  137  4e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2098  hypothetical protein  32.09 
 
 		 368 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1709  hypothetical protein  32.34 
 
 		 388 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.615575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0111  hypothetical protein  29.17 
 
 		 391 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.239724 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0691  hypothetical protein  30.89 
 
 		 377 aa  134  3e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.627447 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2299  hypothetical protein  30.22 
 
 		 356 aa  133  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06643  hypothetical protein  30.36 
 
 		 365 aa  133  6e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0984  hypothetical protein  30.22 
 
 		 356 aa  133  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2910  hypothetical protein  27.88 
 
 		 369 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4321  hypothetical protein  30.56 
 
 		 380 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0949244  normal  0.333615 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44170  hypothetical protein  33.24 
 
 		 368 aa  132  9e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.392978  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1067  hypothetical protein  30.22 
 
 		 356 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3812  protein of unknown function UPF0118  30.18 
 
 		 356 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0447  hypothetical protein  30.18 
 
 		 360 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3886  hypothetical protein  30.18 
 
 		 359 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4064  permease  29.79 
 
 		 349 aa  130  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4008  hypothetical protein  30.18 
 
 		 360 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0338  hypothetical protein  33.14 
 
 		 365 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88474  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0472  hypothetical protein  30.27 
 
 		 373 aa  129  6e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1401  hypothetical protein  29.6 
 
 		 356 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1735  hypothetical protein  31.34 
 
 		 356 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.661691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1484  hypothetical protein  29.6 
 
 		 356 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0518  hypothetical protein  29.6 
 
 		 356 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0130  hypothetical protein  29.6 
 
 		 356 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0479  hypothetical protein  29.67 
 
 		 372 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1843  hypothetical protein  29.41 
 
 		 383 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0013  hypothetical protein  35.62 
 
 		 363 aa  127  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00247664 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1564  putative transmembrane transport protein  28.66 
 
 		 406 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0215  hypothetical protein  28.66 
 
 		 406 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.776259 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1702  hypothetical protein  30.94 
 
 		 360 aa  127  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.221894  normal  0.568838 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0477  hypothetical protein  30 
 
 		 368 aa  127  3e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0854  membrane protein  31.85 
 
 		 363 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0563046  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3280  hypothetical protein  29.11 
 
 		 361 aa  126  5e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.300759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3551  hypothetical protein  29.71 
 
 		 364 aa  126  5e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001141  hypothetical protein  32.2 
 
 		 382 aa  126  6e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>