249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0988 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_1102  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 		 346 aa  663    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0988  hypothetical protein  100 
 
 		 346 aa  663    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.500729  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1564  putative transmembrane transport protein  28.57 
 
 		 406 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0215  hypothetical protein  28.57 
 
 		 406 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.776259 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0268  protein of unknown function UPF0118  33.33 
 
 		 363 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3044  hypothetical protein  28.36 
 
 		 398 aa  116  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0661  hypothetical protein  31.01 
 
 		 351 aa  116  6.9999999999999995e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0810  protein of unknown function UPF0118  31.01 
 
 		 351 aa  116  6.9999999999999995e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2709  hypothetical protein  28.34 
 
 		 362 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2147  hypothetical protein  34.8 
 
 		 357 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4321  hypothetical protein  31.86 
 
 		 380 aa  107  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0949244  normal  0.333615 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4945  protein of unknown function UPF0118  39.44 
 
 		 360 aa  105  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0255148  normal  0.175503 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1275  hypothetical protein  28.92 
 
 		 354 aa  103  4e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3243  hypothetical protein  30.57 
 
 		 356 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.340258  normal  0.654322 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4274  hypothetical protein  30.94 
 
 		 356 aa  102  8e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.444788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1484  hypothetical protein  40.56 
 
 		 356 aa  100  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1401  hypothetical protein  40.56 
 
 		 356 aa  100  5e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2299  hypothetical protein  40.56 
 
 		 356 aa  100  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0984  hypothetical protein  40.56 
 
 		 356 aa  100  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0518  hypothetical protein  40.56 
 
 		 356 aa  100  5e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0130  hypothetical protein  40.56 
 
 		 356 aa  100  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1578  protein of unknown function UPF0118  31.63 
 
 		 373 aa  99  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.373133  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1067  hypothetical protein  40 
 
 		 356 aa  98.6  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1696  hypothetical protein  40.56 
 
 		 391 aa  97.8  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.551892  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2676  hypothetical protein  29.15 
 
 		 388 aa  97.1  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0297  hypothetical protein  27.78 
 
 		 379 aa  95.9  8e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3886  hypothetical protein  27.32 
 
 		 359 aa  95.1  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3551  hypothetical protein  26.51 
 
 		 364 aa  94.7  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0477  hypothetical protein  26.72 
 
 		 368 aa  94.7  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0447  hypothetical protein  27.32 
 
 		 360 aa  95.1  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0271  hypothetical protein  27.5 
 
 		 379 aa  94  3e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4180  hypothetical protein  30.87 
 
 		 356 aa  94  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.664917 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0582  hypothetical protein  28.28 
 
 		 367 aa  94.4  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0275552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3702  hypothetical protein  31.19 
 
 		 356 aa  94  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4064  permease  25.66 
 
 		 349 aa  94  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0479  hypothetical protein  26.65 
 
 		 372 aa  94  4e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3812  protein of unknown function UPF0118  27.04 
 
 		 356 aa  94  4e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4008  hypothetical protein  27.04 
 
 		 360 aa  93.6  4e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0472  hypothetical protein  27.01 
 
 		 373 aa  93.2  5e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1702  hypothetical protein  40 
 
 		 360 aa  93.2  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.221894  normal  0.568838 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2098  hypothetical protein  29.11 
 
 		 368 aa  93.2  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3672  hypothetical protein  25.51 
 
 		 396 aa  92.8  9e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00326083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1735  hypothetical protein  30.72 
 
 		 356 aa  92  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.661691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0013  hypothetical protein  34.6 
 
 		 363 aa  92.4  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00247664 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01657  predicted inner membrane protein  29.47 
 
 		 370 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1954  protein of unknown function UPF0118  29.47 
 
 		 370 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.133227  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0111  hypothetical protein  27.63 
 
 		 391 aa  91.3  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.239724 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1508  putative inner membrane protein  29.47 
 
 		 370 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188442 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2403  putative inner membrane protein  29.47 
 
 		 370 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0340493 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1943  putative inner membrane protein  29.47 
 
 		 370 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000987664 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1889  putative inner membrane protein  29.47 
 
 		 370 aa  91.7  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1769  putative inner membrane protein  29.47 
 
 		 370 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1904  putative inner membrane protein  29.47 
 
 		 370 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2601  hypothetical protein  28.61 
 
 		 352 aa  90.5  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.99204  normal  0.455316 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3370  hypothetical protein  26.76 
 
 		 360 aa  90.5  4e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1381  protein of unknown function UPF0118  28.86 
 
 		 371 aa  90.1  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.0000000171014  decreased coverage  0.00070323 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2209  hypothetical protein  27.87 
 
 		 409 aa  88.6  1e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1042  protein of unknown function UPF0118  27.48 
 
 		 368 aa  89  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.840746  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0549  protein of unknown function UPF0118  26.69 
 
 		 384 aa  88.6  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0941477  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2597  putative inner membrane protein  26.73 
 
 		 365 aa  88.2  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0292  hypothetical protein  27.1 
 
 		 391 aa  87.8  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1738  putative inner membrane protein  26.22 
 
 		 367 aa  87.4  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1844  putative inner membrane protein  26.22 
 
 		 367 aa  87.4  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0488  hypothetical protein  29.15 
 
 		 371 aa  87  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.131577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2083  hypothetical protein  27.33 
 
 		 356 aa  86.7  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.251587 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29820  hypothetical protein  26.05 
 
 		 352 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0125581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4551  hypothetical protein  30.06 
 
 		 359 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0235388 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3296  protein of unknown function UPF0118  38.17 
 
 		 381 aa  85.5  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.854034  normal  0.185219 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2029  hypothetical protein  27.71 
 
 		 348 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.850073 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1658  putative inner membrane protein  26.21 
 
 		 364 aa  84.7  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2741  hypothetical protein  24 
 
 		 369 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5011  protein of unknown function UPF0118  29.75 
 
 		 359 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.022243  normal  0.128908 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1690  putative inner membrane protein  26.7 
 
 		 370 aa  83.6  0.000000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.534784  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2012  protein of unknown function UPF0118  27.85 
 
 		 363 aa  83.2  0.000000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.578603 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3280  hypothetical protein  35.48 
 
 		 361 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.300759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2549  hypothetical protein  24.78 
 
 		 352 aa  82.8  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705186  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1746  putative inner membrane protein  25 
 
 		 371 aa  82.8  0.000000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00422506 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3082  protein of unknown function UPF0118  25.48 
 
 		 397 aa  82  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4026  hypothetical protein  27.64 
 
 		 360 aa  82.4  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4411  protein of unknown function UPF0118  25.34 
 
 		 389 aa  82.4  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2221  lipoprotein, putative  27.09 
 
 		 349 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0102435  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4130  hypothetical protein  25.07 
 
 		 406 aa  81.6  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.189132  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3487  hypothetical protein  28.44 
 
 		 354 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2910  hypothetical protein  24.57 
 
 		 369 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3734  hypothetical protein  26.45 
 
 		 350 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0338  protein of unknown function UPF0118  34.93 
 
 		 363 aa  79.7  0.00000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5064  protein of unknown function UPF0118  29.32 
 
 		 359 aa  79.7  0.00000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.949113 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2289  hypothetical protein  24.44 
 
 		 353 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.864507  normal  0.333993 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0901  protein of unknown function UPF0118  27.08 
 
 		 365 aa  79  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3378  hypothetical protein  26.42 
 
 		 354 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4061  hypothetical protein  29.44 
 
 		 351 aa  79  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0767  hypothetical protein  26.53 
 
 		 350 aa  78.2  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3492  hypothetical protein  27.35 
 
 		 387 aa  78.6  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.705437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2633  hypothetical protein  23.01 
 
 		 365 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2819  hypothetical protein  23.14 
 
 		 369 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1838  protein of unknown function UPF0118  30.13 
 
 		 398 aa  77.8  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00200619  normal  0.0419691 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4200  hypothetical protein  26.22 
 
 		 346 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3174  hypothetical protein  28.86 
 
 		 371 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169461  normal  0.752301 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0152  putative lipoprotein  25.85 
 
 		 361 aa  77.4  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1868  hypothetical protein  34.53 
 
 		 399 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0467497  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>