More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1702 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1702  hypothetical protein  100 
 
 		 360 aa  696    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.221894  normal  0.568838 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4945  protein of unknown function UPF0118  88.6 
 
 		 360 aa  570  1e-161  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0255148  normal  0.175503 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3280  hypothetical protein  71.19 
 
 		 361 aa  485  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.300759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1067  hypothetical protein  66.48 
 
 		 356 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1484  hypothetical protein  65.9 
 
 		 356 aa  428  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0984  hypothetical protein  65.9 
 
 		 356 aa  430  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0518  hypothetical protein  65.9 
 
 		 356 aa  428  1e-119  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1401  hypothetical protein  65.9 
 
 		 356 aa  428  1e-119  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2299  hypothetical protein  65.9 
 
 		 356 aa  430  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0130  hypothetical protein  65.9 
 
 		 356 aa  428  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1735  hypothetical protein  61.71 
 
 		 356 aa  411  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.661691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1696  hypothetical protein  67.05 
 
 		 391 aa  412  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.551892  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3243  hypothetical protein  61.71 
 
 		 356 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.340258  normal  0.654322 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4274  hypothetical protein  62.29 
 
 		 356 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.444788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4321  hypothetical protein  62.79 
 
 		 380 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0949244  normal  0.333615 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4180  hypothetical protein  60.62 
 
 		 356 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.664917 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3702  hypothetical protein  60.62 
 
 		 356 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4092  permease-like  59.93 
 
 		 385 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.322579  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4853  hypothetical protein  47.28 
 
 		 361 aa  258  1e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.197887 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5018  hypothetical protein  43.37 
 
 		 372 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.454575  normal  0.302548 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5011  protein of unknown function UPF0118  44.8 
 
 		 359 aa  252  5.000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.022243  normal  0.128908 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5064  protein of unknown function UPF0118  44.03 
 
 		 359 aa  250  2e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.949113 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4551  hypothetical protein  43.93 
 
 		 359 aa  247  3e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0235388 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3296  protein of unknown function UPF0118  39.18 
 
 		 381 aa  231  2e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.854034  normal  0.185219 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1869  protein of unknown function UPF0118  44.83 
 
 		 363 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0767  hypothetical protein  35.47 
 
 		 350 aa  191  2e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1275  hypothetical protein  35.51 
 
 		 354 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0796  hypothetical protein  36.05 
 
 		 350 aa  176  4e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3044  hypothetical protein  30.79 
 
 		 398 aa  162  7e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1564  putative transmembrane transport protein  29.8 
 
 		 406 aa  159  7e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0215  hypothetical protein  29.8 
 
 		 406 aa  159  7e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.776259 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3672  hypothetical protein  31.67 
 
 		 396 aa  158  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00326083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0268  protein of unknown function UPF0118  32.34 
 
 		 363 aa  156  4e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4064  permease  28.98 
 
 		 349 aa  155  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1578  protein of unknown function UPF0118  32.31 
 
 		 373 aa  150  4e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.373133  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0810  protein of unknown function UPF0118  31.42 
 
 		 351 aa  146  5e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0661  hypothetical protein  31.42 
 
 		 351 aa  146  5e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2709  hypothetical protein  30.7 
 
 		 362 aa  145  9e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2037  protein of unknown function UPF0118  30.23 
 
 		 405 aa  143  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0579571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0111  hypothetical protein  29.32 
 
 		 391 aa  142  8e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.239724 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1838  protein of unknown function UPF0118  29.26 
 
 		 398 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00200619  normal  0.0419691 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3734  hypothetical protein  31.03 
 
 		 350 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0447  hypothetical protein  27.41 
 
 		 360 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3886  hypothetical protein  27.41 
 
 		 359 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0472  hypothetical protein  27.73 
 
 		 373 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4008  hypothetical protein  27.41 
 
 		 360 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0582  hypothetical protein  30.59 
 
 		 367 aa  138  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0275552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3812  protein of unknown function UPF0118  27.41 
 
 		 356 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0479  hypothetical protein  28.04 
 
 		 372 aa  138  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3370  hypothetical protein  27.73 
 
 		 360 aa  138  1e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0477  hypothetical protein  27.73 
 
 		 368 aa  138  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2601  hypothetical protein  30.37 
 
 		 352 aa  137  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.99204  normal  0.455316 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2029  hypothetical protein  29.7 
 
 		 348 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.850073 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3551  hypothetical protein  27.41 
 
 		 364 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2221  lipoprotein, putative  30.51 
 
 		 349 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0102435  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3487  hypothetical protein  30.53 
 
 		 354 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1705  hypothetical protein  30.72 
 
 		 349 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.873743  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4162  hypothetical protein  30.72 
 
 		 350 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0297  hypothetical protein  27.51 
 
 		 379 aa  129  8.000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2209  hypothetical protein  26.09 
 
 		 409 aa  128  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4200  hypothetical protein  28.27 
 
 		 346 aa  126  5e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2098  hypothetical protein  29.48 
 
 		 368 aa  126  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2676  hypothetical protein  29.71 
 
 		 388 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4061  hypothetical protein  30.64 
 
 		 351 aa  124  3e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0271  hypothetical protein  26.33 
 
 		 379 aa  122  7e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1381  protein of unknown function UPF0118  30.35 
 
 		 371 aa  116  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.0000000171014  decreased coverage  0.00070323 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0549  protein of unknown function UPF0118  31.21 
 
 		 384 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0941477  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1973  hypothetical protein  32.56 
 
 		 382 aa  114  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000012652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3174  hypothetical protein  31.21 
 
 		 371 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169461  normal  0.752301 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1844  putative inner membrane protein  25.46 
 
 		 367 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1738  putative inner membrane protein  25.46 
 
 		 367 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2147  hypothetical protein  30.65 
 
 		 357 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2597  putative inner membrane protein  25.3 
 
 		 365 aa  109  7.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3648  hypothetical protein  29.39 
 
 		 354 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.505772  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0338  hypothetical protein  29.27 
 
 		 365 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88474  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2012  protein of unknown function UPF0118  27.1 
 
 		 363 aa  107  3e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.578603 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43510  hypothetical protein  28.48 
 
 		 355 aa  106  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2633  hypothetical protein  25.15 
 
 		 365 aa  105  9e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1658  putative inner membrane protein  27.67 
 
 		 364 aa  105  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1690  putative inner membrane protein  30.93 
 
 		 370 aa  103  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.534784  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0405  hypothetical protein  28.02 
 
 		 374 aa  103  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1830  hypothetical protein  27.75 
 
 		 354 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2454  putative inner membrane protein  28.57 
 
 		 395 aa  103  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.272244  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0988  hypothetical protein  40 
 
 		 346 aa  103  7e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.500729  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1102  protein of unknown function UPF0118  40 
 
 		 346 aa  103  7e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3210  hypothetical protein  28.05 
 
 		 354 aa  102  8e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.212604 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10160  hypothetical protein  28.88 
 
 		 364 aa  102  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.406243  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1855  hypothetical protein  29.75 
 
 		 354 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0258165 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2238  protein of unknown function UPF0118  25.23 
 
 		 379 aa  100  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.605073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0488  hypothetical protein  32.33 
 
 		 371 aa  101  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.131577  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3378  hypothetical protein  28.44 
 
 		 354 aa  100  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2457  hypothetical protein  28.35 
 
 		 362 aa  100  5e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2289  hypothetical protein  29.14 
 
 		 353 aa  100  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.864507  normal  0.333993 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1508  putative inner membrane protein  27.38 
 
 		 370 aa  99.4  9e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188442 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0192  protein of unknown function UPF0118  29.34 
 
 		 358 aa  98.6  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.146754  normal  0.226796 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3717  hypothetical protein  27.71 
 
 		 353 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396811  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2083  hypothetical protein  26.81 
 
 		 356 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.251587 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1746  putative inner membrane protein  26.22 
 
 		 371 aa  98.6  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00422506 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2756  putative inner membrane protein  26.74 
 
 		 369 aa  98.6  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1954  protein of unknown function UPF0118  27.38 
 
 		 370 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.133227  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>