280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1658 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_1658  putative inner membrane protein  100 
 
 
364 aa  714    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1690  putative inner membrane protein  85.15 
 
 
370 aa  597  1e-170  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.534784  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2756  putative inner membrane protein  74.18 
 
 
369 aa  530  1e-149  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2454  putative inner membrane protein  76.64 
 
 
395 aa  527  1e-148  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.272244  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1844  putative inner membrane protein  67.33 
 
 
367 aa  491  1e-137  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1738  putative inner membrane protein  67.33 
 
 
367 aa  491  1e-137  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2597  putative inner membrane protein  67.33 
 
 
365 aa  486  1e-136  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2175  hypothetical protein  72.17 
 
 
366 aa  480  1e-134  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0131226 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01657  predicted inner membrane protein  65.62 
 
 
370 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1954  protein of unknown function UPF0118  65.62 
 
 
370 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.133227  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1508  putative inner membrane protein  65.81 
 
 
370 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000188442 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1746  putative inner membrane protein  63.82 
 
 
371 aa  459  9.999999999999999e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00422506 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1904  putative inner membrane protein  65.62 
 
 
370 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1769  putative inner membrane protein  65.62 
 
 
370 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1889  putative inner membrane protein  65.62 
 
 
370 aa  460  9.999999999999999e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1943  putative inner membrane protein  65.62 
 
 
370 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000987664 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2403  putative inner membrane protein  65.62 
 
 
370 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0340493 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1460  putative inner membrane protein  65.63 
 
 
372 aa  441  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.539422  normal  0.149027 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1808  putative inner membrane protein  65.92 
 
 
372 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1979  putative inner membrane protein  65.63 
 
 
372 aa  441  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.591827  hitchhiker  0.00000561887 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1495  putative inner membrane protein  65.63 
 
 
372 aa  441  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138717 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1476  putative inner membrane protein  65.63 
 
 
372 aa  441  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.655079  hitchhiker  0.000276 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0405  hypothetical protein  50.28 
 
 
374 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2633  hypothetical protein  49.56 
 
 
365 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3486  hypothetical protein  45.38 
 
 
375 aa  310  2.9999999999999997e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.12464 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3398  hypothetical protein  40.06 
 
 
360 aa  271  1e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1686  hypothetical protein  41.43 
 
 
390 aa  247  3e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3734  hypothetical protein  34.97 
 
 
350 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2029  hypothetical protein  35.6 
 
 
348 aa  186  7e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.850073 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4200  hypothetical protein  35.08 
 
 
346 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4162  hypothetical protein  34.97 
 
 
350 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1705  hypothetical protein  35.08 
 
 
349 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.873743  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3487  hypothetical protein  34.83 
 
 
354 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2221  lipoprotein, putative  35.91 
 
 
349 aa  178  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0102435  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0862  hypothetical protein  32.07 
 
 
360 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4608  hypothetical protein  29.02 
 
 
370 aa  162  7e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.991825  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2676  hypothetical protein  32.74 
 
 
388 aa  162  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1843  hypothetical protein  31.93 
 
 
383 aa  162  1e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0582  hypothetical protein  32.94 
 
 
367 aa  161  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0275552  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5187  hypothetical protein  30.05 
 
 
381 aa  160  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.503723 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43510  hypothetical protein  34.35 
 
 
355 aa  159  9e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3648  hypothetical protein  34.15 
 
 
354 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.505772  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2741  hypothetical protein  28.7 
 
 
369 aa  153  5e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4043  protein of unknown function UPF0118  29.73 
 
 
385 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0691  hypothetical protein  31.37 
 
 
377 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.627447 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5665  hypothetical protein  30.92 
 
 
362 aa  152  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2169  hypothetical protein  28.45 
 
 
354 aa  150  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.344347  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2819  hypothetical protein  28.4 
 
 
369 aa  151  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10160  hypothetical protein  31.87 
 
 
364 aa  151  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.406243  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2457  hypothetical protein  35.08 
 
 
362 aa  150  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2910  hypothetical protein  28.4 
 
 
369 aa  150  3e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3036  protein of unknown function UPF0118  29.97 
 
 
363 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001141  hypothetical protein  30.17 
 
 
382 aa  148  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3084  protein of unknown function UPF0118  29.97 
 
 
363 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1381  protein of unknown function UPF0118  29.62 
 
 
371 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.0000000171014  decreased coverage  0.00070323 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1973  hypothetical protein  29.82 
 
 
382 aa  146  6e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000012652  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0120  hypothetical protein  29.85 
 
 
370 aa  144  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06643  hypothetical protein  27.83 
 
 
365 aa  144  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44170  hypothetical protein  29.34 
 
 
368 aa  144  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.392978  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1709  hypothetical protein  30.97 
 
 
388 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.615575  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4061  hypothetical protein  32.34 
 
 
351 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0593  hypothetical protein  26.93 
 
 
376 aa  139  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.356961  normal  0.748294 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0268  protein of unknown function UPF0118  32.72 
 
 
363 aa  137  4e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0661  hypothetical protein  31.79 
 
 
351 aa  136  7.000000000000001e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0810  protein of unknown function UPF0118  31.79 
 
 
351 aa  136  7.000000000000001e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3174  hypothetical protein  29.33 
 
 
371 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169461  normal  0.752301 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6456  hypothetical protein  30.24 
 
 
367 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.267604 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2900  hypothetical protein  29.03 
 
 
379 aa  134  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0752  hypothetical protein  30.56 
 
 
365 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0379564  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1906  membrane protein  28.61 
 
 
353 aa  130  4.0000000000000003e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0890459  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0192  protein of unknown function UPF0118  30.79 
 
 
358 aa  129  8.000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.146754  normal  0.226796 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1020  membrane protein  25.75 
 
 
355 aa  128  1.0000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0748  hypothetical protein  29.34 
 
 
365 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0714  permease  30.27 
 
 
365 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0333328  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4469  hypothetical protein  29.71 
 
 
365 aa  123  5e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0580151  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1578  protein of unknown function UPF0118  29.61 
 
 
373 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.373133  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4349  hypothetical protein  29.1 
 
 
368 aa  113  4.0000000000000004e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.287718  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0152  putative lipoprotein  26.19 
 
 
361 aa  113  4.0000000000000004e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2709  hypothetical protein  29.71 
 
 
362 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0130  hypothetical protein  27.58 
 
 
356 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1484  hypothetical protein  27.58 
 
 
356 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1401  hypothetical protein  27.58 
 
 
356 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2299  hypothetical protein  26.69 
 
 
356 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1067  hypothetical protein  26.69 
 
 
356 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0984  hypothetical protein  26.69 
 
 
356 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0518  hypothetical protein  27.58 
 
 
356 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2601  hypothetical protein  30.48 
 
 
352 aa  109  6e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.99204  normal  0.455316 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4321  hypothetical protein  26.99 
 
 
380 aa  104  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0949244  normal  0.333615 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1696  hypothetical protein  26.38 
 
 
391 aa  103  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.551892  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2098  hypothetical protein  29.49 
 
 
368 aa  102  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3243  hypothetical protein  25.77 
 
 
356 aa  102  8e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.340258  normal  0.654322 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0783  hypothetical protein  28.53 
 
 
353 aa  102  8e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3280  hypothetical protein  24.58 
 
 
361 aa  101  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.300759  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1735  hypothetical protein  25.66 
 
 
356 aa  102  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.661691  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1702  hypothetical protein  27.71 
 
 
360 aa  100  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.221894  normal  0.568838 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1154  hypothetical protein  27.62 
 
 
358 aa  99.8  6e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000550105  normal  0.0344505 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4274  hypothetical protein  25.15 
 
 
356 aa  99.8  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.444788  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0854  membrane protein  27.98 
 
 
363 aa  99.4  9e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0563046  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3702  hypothetical protein  28.57 
 
 
356 aa  98.6  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4180  hypothetical protein  29 
 
 
356 aa  98.6  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.664917 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>