More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3174 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3174  hypothetical protein  100 
 
 
371 aa  704    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169461  normal  0.752301 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1381  protein of unknown function UPF0118  95.96 
 
 
371 aa  656    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.0000000171014  decreased coverage  0.00070323 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1973  hypothetical protein  86.25 
 
 
382 aa  548  1e-155  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000012652  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2676  hypothetical protein  65.9 
 
 
388 aa  443  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0582  hypothetical protein  62.57 
 
 
367 aa  436  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0275552  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2029  hypothetical protein  45.32 
 
 
348 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.850073 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3734  hypothetical protein  45.17 
 
 
350 aa  262  8e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4200  hypothetical protein  42.86 
 
 
346 aa  260  3e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3487  hypothetical protein  45.72 
 
 
354 aa  260  3e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2221  lipoprotein, putative  44.02 
 
 
349 aa  256  5e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0102435  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4162  hypothetical protein  45.17 
 
 
350 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1705  hypothetical protein  45.17 
 
 
349 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.873743  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2457  hypothetical protein  43.7 
 
 
362 aa  231  1e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4061  hypothetical protein  39.76 
 
 
351 aa  228  2e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10160  hypothetical protein  43.24 
 
 
364 aa  219  5e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.406243  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3648  hypothetical protein  40.9 
 
 
354 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.505772  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43510  hypothetical protein  39.88 
 
 
355 aa  208  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5665  hypothetical protein  37.75 
 
 
362 aa  205  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0192  protein of unknown function UPF0118  34.8 
 
 
358 aa  198  1.0000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.146754  normal  0.226796 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3486  hypothetical protein  36.14 
 
 
375 aa  193  5e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.12464 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2633  hypothetical protein  35.24 
 
 
365 aa  191  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0405  hypothetical protein  35.82 
 
 
374 aa  179  4.999999999999999e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3398  hypothetical protein  32.85 
 
 
360 aa  175  9.999999999999999e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0268  protein of unknown function UPF0118  33.82 
 
 
363 aa  172  6.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1738  putative inner membrane protein  30.64 
 
 
367 aa  170  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1844  putative inner membrane protein  30.64 
 
 
367 aa  170  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0661  hypothetical protein  36.26 
 
 
351 aa  168  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0810  protein of unknown function UPF0118  36.26 
 
 
351 aa  168  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1746  putative inner membrane protein  32.86 
 
 
371 aa  168  2e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00422506 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2597  putative inner membrane protein  30.64 
 
 
365 aa  166  8e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2709  hypothetical protein  32.49 
 
 
362 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1578  protein of unknown function UPF0118  33.33 
 
 
373 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.373133  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2175  hypothetical protein  31.76 
 
 
366 aa  158  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0131226 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2403  putative inner membrane protein  31.52 
 
 
370 aa  158  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0340493 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01657  predicted inner membrane protein  31.52 
 
 
370 aa  157  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1954  protein of unknown function UPF0118  31.52 
 
 
370 aa  157  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.133227  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1889  putative inner membrane protein  31.52 
 
 
370 aa  157  2e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1690  putative inner membrane protein  30.51 
 
 
370 aa  158  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.534784  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1769  putative inner membrane protein  31.52 
 
 
370 aa  157  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1508  putative inner membrane protein  31.52 
 
 
370 aa  157  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000188442 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1943  putative inner membrane protein  31.52 
 
 
370 aa  157  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000987664 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1904  putative inner membrane protein  31.52 
 
 
370 aa  157  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0271  hypothetical protein  30.59 
 
 
379 aa  155  9e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0297  hypothetical protein  30.27 
 
 
379 aa  154  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2209  hypothetical protein  33.14 
 
 
409 aa  154  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2601  hypothetical protein  35.16 
 
 
352 aa  153  4e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.99204  normal  0.455316 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1808  putative inner membrane protein  30.63 
 
 
372 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1979  putative inner membrane protein  30.63 
 
 
372 aa  152  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.591827  hitchhiker  0.00000561887 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2454  putative inner membrane protein  31.56 
 
 
395 aa  152  8.999999999999999e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.272244  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1460  putative inner membrane protein  30.63 
 
 
372 aa  152  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.539422  normal  0.149027 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1495  putative inner membrane protein  30.63 
 
 
372 aa  152  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138717 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1476  putative inner membrane protein  30.63 
 
 
372 aa  152  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.655079  hitchhiker  0.000276 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2756  putative inner membrane protein  30.51 
 
 
369 aa  151  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1686  hypothetical protein  30.26 
 
 
390 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2169  hypothetical protein  32.51 
 
 
354 aa  142  7e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.344347  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1658  putative inner membrane protein  31.1 
 
 
364 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0862  hypothetical protein  28.97 
 
 
360 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0593  hypothetical protein  30.66 
 
 
376 aa  141  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.356961  normal  0.748294 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5187  hypothetical protein  29.82 
 
 
381 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.503723 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3189  protein of unknown function UPF0118  32 
 
 
361 aa  136  5e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000846761  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2098  hypothetical protein  32.74 
 
 
368 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2910  hypothetical protein  28.21 
 
 
369 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0013  hypothetical protein  34.06 
 
 
363 aa  133  5e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00247664 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3551  hypothetical protein  26.8 
 
 
364 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4043  protein of unknown function UPF0118  27.81 
 
 
385 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0691  hypothetical protein  30 
 
 
377 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.627447 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4321  hypothetical protein  30.65 
 
 
380 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0949244  normal  0.333615 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2741  hypothetical protein  27.65 
 
 
369 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44170  hypothetical protein  31.91 
 
 
368 aa  130  5.0000000000000004e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.392978  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0479  hypothetical protein  25.92 
 
 
372 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1843  hypothetical protein  27.62 
 
 
383 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0477  hypothetical protein  26.33 
 
 
368 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2819  hypothetical protein  27.73 
 
 
369 aa  127  3e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4469  hypothetical protein  31.56 
 
 
365 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0580151  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4608  hypothetical protein  25.14 
 
 
370 aa  125  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.991825  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3370  hypothetical protein  27.65 
 
 
360 aa  125  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2299  hypothetical protein  29.57 
 
 
356 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4064  permease  27.64 
 
 
349 aa  125  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0984  hypothetical protein  29.57 
 
 
356 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3243  hypothetical protein  29.81 
 
 
356 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.340258  normal  0.654322 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1067  hypothetical protein  29.27 
 
 
356 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3084  protein of unknown function UPF0118  30.53 
 
 
363 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3036  protein of unknown function UPF0118  30.53 
 
 
363 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0748  hypothetical protein  30 
 
 
365 aa  123  4e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4274  hypothetical protein  30.12 
 
 
356 aa  123  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.444788  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0130  hypothetical protein  29.05 
 
 
356 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1401  hypothetical protein  29.05 
 
 
356 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0518  hypothetical protein  29.05 
 
 
356 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1484  hypothetical protein  29.05 
 
 
356 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3886  hypothetical protein  27.27 
 
 
359 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2147  hypothetical protein  33.43 
 
 
357 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0447  hypothetical protein  27.35 
 
 
360 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1154  hypothetical protein  30.46 
 
 
358 aa  120  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000550105  normal  0.0344505 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0752  hypothetical protein  31.37 
 
 
365 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0379564  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0714  permease  30 
 
 
365 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0333328  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0472  hypothetical protein  26.21 
 
 
373 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001141  hypothetical protein  30.45 
 
 
382 aa  120  3.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3812  protein of unknown function UPF0118  27.06 
 
 
356 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4008  hypothetical protein  27.06 
 
 
360 aa  119  6e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06643  hypothetical protein  30.43 
 
 
365 aa  119  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>