More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_5064 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_5064  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 		 359 aa  681    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.949113 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5011  protein of unknown function UPF0118  92.48 
 
 		 359 aa  554  1e-157  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.022243  normal  0.128908 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4551  hypothetical protein  92.2 
 
 		 359 aa  549  1e-155  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0235388 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5018  hypothetical protein  66.29 
 
 		 372 aa  394  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.454575  normal  0.302548 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1869  protein of unknown function UPF0118  63.03 
 
 		 363 aa  334  1e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4853  hypothetical protein  63.35 
 
 		 361 aa  334  2e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.197887 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3296  protein of unknown function UPF0118  47.67 
 
 		 381 aa  301  9e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.854034  normal  0.185219 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3243  hypothetical protein  47.41 
 
 		 356 aa  288  7e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.340258  normal  0.654322 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4274  hypothetical protein  47.7 
 
 		 356 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.444788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1735  hypothetical protein  47.7 
 
 		 356 aa  278  8e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.661691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3280  hypothetical protein  45.61 
 
 		 361 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.300759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4321  hypothetical protein  47.66 
 
 		 380 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0949244  normal  0.333615 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1702  hypothetical protein  44.74 
 
 		 360 aa  261  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.221894  normal  0.568838 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4945  protein of unknown function UPF0118  44.44 
 
 		 360 aa  258  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0255148  normal  0.175503 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1067  hypothetical protein  45.3 
 
 		 356 aa  256  3e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3702  hypothetical protein  48.41 
 
 		 356 aa  256  6e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4180  hypothetical protein  48.13 
 
 		 356 aa  255  9e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.664917 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0984  hypothetical protein  45.01 
 
 		 356 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1401  hypothetical protein  45.3 
 
 		 356 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2299  hypothetical protein  45.01 
 
 		 356 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0518  hypothetical protein  45.3 
 
 		 356 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1484  hypothetical protein  45.3 
 
 		 356 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0130  hypothetical protein  45.3 
 
 		 356 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1696  hypothetical protein  46.91 
 
 		 391 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.551892  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1275  hypothetical protein  40.43 
 
 		 354 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0767  hypothetical protein  38.24 
 
 		 350 aa  221  1.9999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0796  hypothetical protein  37.94 
 
 		 350 aa  203  4e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3672  hypothetical protein  36.93 
 
 		 396 aa  202  8e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00326083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4064  permease  35.71 
 
 		 349 aa  200  3.9999999999999996e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2037  protein of unknown function UPF0118  37.46 
 
 		 405 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0579571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4092  permease-like  42.6 
 
 		 385 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.322579  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1838  protein of unknown function UPF0118  37.17 
 
 		 398 aa  192  6e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00200619  normal  0.0419691 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0111  hypothetical protein  35.03 
 
 		 391 aa  191  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.239724 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3044  hypothetical protein  32.23 
 
 		 398 aa  190  4e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0215  hypothetical protein  33.72 
 
 		 406 aa  187  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.776259 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1564  putative transmembrane transport protein  33.72 
 
 		 406 aa  187  3e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0472  hypothetical protein  34.08 
 
 		 373 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3886  hypothetical protein  33.53 
 
 		 359 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1578  protein of unknown function UPF0118  35.47 
 
 		 373 aa  161  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.373133  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0479  hypothetical protein  32.96 
 
 		 372 aa  161  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0447  hypothetical protein  33.33 
 
 		 360 aa  159  6e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0477  hypothetical protein  33.33 
 
 		 368 aa  159  6e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4008  hypothetical protein  33.33 
 
 		 360 aa  159  9e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3551  hypothetical protein  32.77 
 
 		 364 aa  159  9e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3812  protein of unknown function UPF0118  33.33 
 
 		 356 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0268  protein of unknown function UPF0118  32.13 
 
 		 363 aa  159  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3370  hypothetical protein  34.08 
 
 		 360 aa  157  3e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2601  hypothetical protein  34.08 
 
 		 352 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.99204  normal  0.455316 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2709  hypothetical protein  31.68 
 
 		 362 aa  145  1e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0810  protein of unknown function UPF0118  31.86 
 
 		 351 aa  142  6e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0661  hypothetical protein  31.86 
 
 		 351 aa  142  6e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2098  hypothetical protein  33.06 
 
 		 368 aa  129  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0271  hypothetical protein  29.28 
 
 		 379 aa  126  5e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0013  hypothetical protein  38.21 
 
 		 363 aa  126  6e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00247664 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0297  hypothetical protein  28.15 
 
 		 379 aa  122  8e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0192  protein of unknown function UPF0118  32.34 
 
 		 358 aa  118  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.146754  normal  0.226796 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2209  hypothetical protein  27.17 
 
 		 409 aa  119  9.999999999999999e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3734  hypothetical protein  28.36 
 
 		 350 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3492  hypothetical protein  31.21 
 
 		 387 aa  115  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.705437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3487  hypothetical protein  28.87 
 
 		 354 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1705  hypothetical protein  30.32 
 
 		 349 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.873743  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4162  hypothetical protein  30.23 
 
 		 350 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2868  hypothetical protein  29.16 
 
 		 358 aa  110  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838475  normal  0.0422213 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0582  hypothetical protein  27.71 
 
 		 367 aa  108  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0275552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0338  hypothetical protein  27.4 
 
 		 365 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88474  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2029  hypothetical protein  28.66 
 
 		 348 aa  107  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.850073 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2676  hypothetical protein  27.51 
 
 		 388 aa  106  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2221  lipoprotein, putative  28.88 
 
 		 349 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0102435  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3980  hypothetical protein  28.9 
 
 		 352 aa  104  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0869717 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11000  hypothetical protein  30.18 
 
 		 346 aa  103  4e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4931  hypothetical protein  28.74 
 
 		 351 aa  103  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1154  hypothetical protein  31.2 
 
 		 358 aa  103  6e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000550105  normal  0.0344505 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1907  protein of unknown function UPF0118  31.74 
 
 		 352 aa  102  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1821  hypothetical protein  31.74 
 
 		 381 aa  102  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.693161 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3174  hypothetical protein  28.61 
 
 		 371 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169461  normal  0.752301 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1381  protein of unknown function UPF0118  28.42 
 
 		 371 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.0000000171014  decreased coverage  0.00070323 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3950  protein of unknown function UPF0118  27.12 
 
 		 360 aa  100  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4200  hypothetical protein  27.94 
 
 		 346 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0826  hypothetical protein  27.01 
 
 		 369 aa  99.8  7e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.981363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2147  hypothetical protein  40.68 
 
 		 357 aa  99.8  8e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4061  hypothetical protein  28.1 
 
 		 351 aa  98.2  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4026  hypothetical protein  27.66 
 
 		 360 aa  98.2  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7289  hypothetical protein  28.77 
 
 		 353 aa  97.1  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0488  hypothetical protein  27.81 
 
 		 371 aa  96.7  6e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.131577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1830  hypothetical protein  28.35 
 
 		 354 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1973  hypothetical protein  27.58 
 
 		 382 aa  95.9  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000012652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3249  hypothetical protein  28.9 
 
 		 350 aa  95.5  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.691639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0549  protein of unknown function UPF0118  28.19 
 
 		 384 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0941477  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3398  hypothetical protein  26.76 
 
 		 360 aa  94.7  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0405  hypothetical protein  25.76 
 
 		 374 aa  94.7  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1855  hypothetical protein  29.26 
 
 		 354 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0258165 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2212  protein of unknown function UPF0118  28.09 
 
 		 355 aa  94.4  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000181482  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0540  protein of unknown function UPF0118  30.17 
 
 		 349 aa  94  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1690  putative inner membrane protein  26.32 
 
 		 370 aa  94.4  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.534784  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2289  hypothetical protein  28.07 
 
 		 353 aa  94  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.864507  normal  0.333993 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6456  hypothetical protein  26.51 
 
 		 367 aa  93.6  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.267604 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4411  protein of unknown function UPF0118  27.38 
 
 		 389 aa  92  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0987  hypothetical protein  24.85 
 
 		 394 aa  92  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.89372 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2083  hypothetical protein  24.7 
 
 		 356 aa  91.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.251587 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4130  hypothetical protein  26.69 
 
 		 406 aa  91.7  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.189132  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>