285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_0130 on replicon NC_008835
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A1067  hypothetical protein  98.88 
 
 
356 aa  669    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1401  hypothetical protein  100 
 
 
356 aa  675    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2299  hypothetical protein  99.44 
 
 
356 aa  672    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0984  hypothetical protein  99.44 
 
 
356 aa  672    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0518  hypothetical protein  100 
 
 
356 aa  675    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0130  hypothetical protein  100 
 
 
356 aa  675    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1484  hypothetical protein  100 
 
 
356 aa  675    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1696  hypothetical protein  91.85 
 
 
391 aa  569  1e-161  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.551892  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3243  hypothetical protein  67.42 
 
 
356 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.340258  normal  0.654322 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4274  hypothetical protein  67.99 
 
 
356 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.444788  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1735  hypothetical protein  66.86 
 
 
356 aa  449  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.661691  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4321  hypothetical protein  68.08 
 
 
380 aa  444  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0949244  normal  0.333615 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3280  hypothetical protein  66.11 
 
 
361 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.300759  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1702  hypothetical protein  66.47 
 
 
360 aa  424  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.221894  normal  0.568838 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4945  protein of unknown function UPF0118  66.47 
 
 
360 aa  419  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0255148  normal  0.175503 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3702  hypothetical protein  65.92 
 
 
356 aa  421  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4180  hypothetical protein  65.63 
 
 
356 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.664917 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4092  permease-like  64.64 
 
 
385 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.322579  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5018  hypothetical protein  43.94 
 
 
372 aa  252  6e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.454575  normal  0.302548 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4853  hypothetical protein  46.48 
 
 
361 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.197887 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5011  protein of unknown function UPF0118  47.06 
 
 
359 aa  236  6e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.022243  normal  0.128908 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4551  hypothetical protein  47.06 
 
 
359 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0235388 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5064  protein of unknown function UPF0118  46.27 
 
 
359 aa  232  9e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.949113 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3296  protein of unknown function UPF0118  39.02 
 
 
381 aa  228  1e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.854034  normal  0.185219 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1869  protein of unknown function UPF0118  44.79 
 
 
363 aa  218  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0767  hypothetical protein  33.53 
 
 
350 aa  180  4e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1275  hypothetical protein  34.98 
 
 
354 aa  177  3e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4064  permease  33.83 
 
 
349 aa  167  4e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0796  hypothetical protein  33.82 
 
 
350 aa  166  8e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0215  hypothetical protein  31.73 
 
 
406 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.776259 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1564  putative transmembrane transport protein  31.73 
 
 
406 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3044  hypothetical protein  33.03 
 
 
398 aa  162  9e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0111  hypothetical protein  33.33 
 
 
391 aa  155  9e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.239724 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3672  hypothetical protein  32.43 
 
 
396 aa  154  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00326083  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0268  protein of unknown function UPF0118  30.7 
 
 
363 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0661  hypothetical protein  33.9 
 
 
351 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0810  protein of unknown function UPF0118  33.9 
 
 
351 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2037  protein of unknown function UPF0118  29.09 
 
 
405 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0579571  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3886  hypothetical protein  30.22 
 
 
359 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0447  hypothetical protein  30.22 
 
 
360 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4008  hypothetical protein  30.22 
 
 
360 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3812  protein of unknown function UPF0118  30.22 
 
 
356 aa  139  6e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3370  hypothetical protein  30.84 
 
 
360 aa  138  1e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3734  hypothetical protein  31.17 
 
 
350 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1578  protein of unknown function UPF0118  30.3 
 
 
373 aa  137  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.373133  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2709  hypothetical protein  29.38 
 
 
362 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1838  protein of unknown function UPF0118  28.7 
 
 
398 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00200619  normal  0.0419691 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0479  hypothetical protein  30.22 
 
 
372 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0582  hypothetical protein  32.33 
 
 
367 aa  132  9e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0275552  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0472  hypothetical protein  29.6 
 
 
373 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0477  hypothetical protein  30.22 
 
 
368 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0297  hypothetical protein  27.25 
 
 
379 aa  131  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3551  hypothetical protein  29.91 
 
 
364 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2029  hypothetical protein  29.64 
 
 
348 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.850073 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4061  hypothetical protein  30.55 
 
 
351 aa  129  9.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2209  hypothetical protein  26.76 
 
 
409 aa  129  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3487  hypothetical protein  30.37 
 
 
354 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4162  hypothetical protein  29.91 
 
 
350 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2601  hypothetical protein  32.07 
 
 
352 aa  127  3e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.99204  normal  0.455316 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0271  hypothetical protein  26.09 
 
 
379 aa  125  8.000000000000001e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1705  hypothetical protein  29.6 
 
 
349 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.873743  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2676  hypothetical protein  31.95 
 
 
388 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2221  lipoprotein, putative  29.04 
 
 
349 aa  122  7e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0102435  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0192  protein of unknown function UPF0118  31.99 
 
 
358 aa  122  8e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.146754  normal  0.226796 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4200  hypothetical protein  28.53 
 
 
346 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2098  hypothetical protein  32.44 
 
 
368 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1738  putative inner membrane protein  30.03 
 
 
367 aa  119  7e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1844  putative inner membrane protein  30.03 
 
 
367 aa  119  7e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2633  hypothetical protein  26.21 
 
 
365 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2597  putative inner membrane protein  29.54 
 
 
365 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1381  protein of unknown function UPF0118  29.34 
 
 
371 aa  117  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.0000000171014  decreased coverage  0.00070323 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1690  putative inner membrane protein  30.5 
 
 
370 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.534784  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2756  putative inner membrane protein  31.25 
 
 
369 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1746  putative inner membrane protein  30.55 
 
 
371 aa  114  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00422506 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0405  hypothetical protein  28.61 
 
 
374 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3174  hypothetical protein  29.33 
 
 
371 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169461  normal  0.752301 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01657  predicted inner membrane protein  30 
 
 
370 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1954  protein of unknown function UPF0118  30 
 
 
370 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.133227  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1904  putative inner membrane protein  30 
 
 
370 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1658  putative inner membrane protein  27.07 
 
 
364 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1943  putative inner membrane protein  30 
 
 
370 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000987664 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1769  putative inner membrane protein  30 
 
 
370 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1889  putative inner membrane protein  30 
 
 
370 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2454  putative inner membrane protein  30.09 
 
 
395 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.272244  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2403  putative inner membrane protein  30 
 
 
370 aa  110  5e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0340493 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1508  putative inner membrane protein  30 
 
 
370 aa  109  6e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000188442 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3648  hypothetical protein  29.79 
 
 
354 aa  106  7e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.505772  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10160  hypothetical protein  31.75 
 
 
364 aa  105  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.406243  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43510  hypothetical protein  28.78 
 
 
355 aa  103  6e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4026  hypothetical protein  29.41 
 
 
360 aa  102  7e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0013  hypothetical protein  32.21 
 
 
363 aa  102  9e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00247664 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1973  hypothetical protein  27.44 
 
 
382 aa  102  9e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000012652  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2457  hypothetical protein  29.5 
 
 
362 aa  101  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0988  hypothetical protein  40.56 
 
 
346 aa  100  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.500729  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3486  hypothetical protein  30.18 
 
 
375 aa  100  6e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.12464 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1102  protein of unknown function UPF0118  40.56 
 
 
346 aa  100  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2147  hypothetical protein  28.75 
 
 
357 aa  97.4  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1808  putative inner membrane protein  29.89 
 
 
372 aa  97.1  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1460  putative inner membrane protein  29.89 
 
 
372 aa  96.7  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.539422  normal  0.149027 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3398  hypothetical protein  24.48 
 
 
360 aa  96.7  5e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>