More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3296 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_3296  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 		 381 aa  754    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.854034  normal  0.185219 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5018  hypothetical protein  47.24 
 
 		 372 aa  293  3e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.454575  normal  0.302548 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4551  hypothetical protein  48.92 
 
 		 359 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0235388 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5011  protein of unknown function UPF0118  48.61 
 
 		 359 aa  281  1e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.022243  normal  0.128908 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5064  protein of unknown function UPF0118  47.67 
 
 		 359 aa  276  4e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.949113 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4853  hypothetical protein  50 
 
 		 361 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.197887 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3243  hypothetical protein  42.86 
 
 		 356 aa  268  8e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.340258  normal  0.654322 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4274  hypothetical protein  42.57 
 
 		 356 aa  267  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.444788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3280  hypothetical protein  40.73 
 
 		 361 aa  259  6e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.300759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1735  hypothetical protein  40.82 
 
 		 356 aa  252  7e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.661691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1869  protein of unknown function UPF0118  48.84 
 
 		 363 aa  249  5e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4321  hypothetical protein  40.4 
 
 		 380 aa  249  8e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0949244  normal  0.333615 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4180  hypothetical protein  42.05 
 
 		 356 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.664917 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3702  hypothetical protein  42.05 
 
 		 356 aa  239  5e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1067  hypothetical protein  39.6 
 
 		 356 aa  236  3e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2299  hypothetical protein  39.6 
 
 		 356 aa  236  6e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0984  hypothetical protein  39.6 
 
 		 356 aa  236  6e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1696  hypothetical protein  41.04 
 
 		 391 aa  234  3e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.551892  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1401  hypothetical protein  39.02 
 
 		 356 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0130  hypothetical protein  39.02 
 
 		 356 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1484  hypothetical protein  39.02 
 
 		 356 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0518  hypothetical protein  39.02 
 
 		 356 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4945  protein of unknown function UPF0118  38.89 
 
 		 360 aa  230  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0255148  normal  0.175503 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1702  hypothetical protein  39.3 
 
 		 360 aa  230  3e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.221894  normal  0.568838 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1275  hypothetical protein  33.23 
 
 		 354 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0767  hypothetical protein  34.27 
 
 		 350 aa  193  4e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4064  permease  33.04 
 
 		 349 aa  185  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3672  hypothetical protein  31.12 
 
 		 396 aa  184  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00326083  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0796  hypothetical protein  34.27 
 
 		 350 aa  183  3e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4092  permease-like  37.27 
 
 		 385 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.322579  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0111  hypothetical protein  32.56 
 
 		 391 aa  178  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.239724 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2037  protein of unknown function UPF0118  31.83 
 
 		 405 aa  177  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0579571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3044  hypothetical protein  32.43 
 
 		 398 aa  176  5e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1838  protein of unknown function UPF0118  32.55 
 
 		 398 aa  176  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00200619  normal  0.0419691 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0215  hypothetical protein  31.55 
 
 		 406 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.776259 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1564  putative transmembrane transport protein  31.55 
 
 		 406 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0477  hypothetical protein  31.36 
 
 		 368 aa  155  8e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3370  hypothetical protein  30.72 
 
 		 360 aa  153  5e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0479  hypothetical protein  31.69 
 
 		 372 aa  153  5e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3551  hypothetical protein  31.4 
 
 		 364 aa  152  8e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3886  hypothetical protein  29.49 
 
 		 359 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0472  hypothetical protein  31.69 
 
 		 373 aa  150  3e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0447  hypothetical protein  30.14 
 
 		 360 aa  149  7e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4008  hypothetical protein  29.86 
 
 		 360 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3812  protein of unknown function UPF0118  29.86 
 
 		 356 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0268  protein of unknown function UPF0118  31.35 
 
 		 363 aa  145  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2709  hypothetical protein  29.48 
 
 		 362 aa  138  2e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1578  protein of unknown function UPF0118  30.22 
 
 		 373 aa  133  6e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.373133  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2601  hypothetical protein  30.38 
 
 		 352 aa  129  8.000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.99204  normal  0.455316 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0661  hypothetical protein  28.45 
 
 		 351 aa  127  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0810  protein of unknown function UPF0118  28.45 
 
 		 351 aa  127  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0271  hypothetical protein  27.09 
 
 		 379 aa  125  9e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2209  hypothetical protein  27.75 
 
 		 409 aa  121  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0297  hypothetical protein  27.42 
 
 		 379 aa  121  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2098  hypothetical protein  30.03 
 
 		 368 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0013  hypothetical protein  28.38 
 
 		 363 aa  108  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00247664 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2147  hypothetical protein  35.87 
 
 		 357 aa  107  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2633  hypothetical protein  24.37 
 
 		 365 aa  105  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3734  hypothetical protein  25.91 
 
 		 350 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3492  hypothetical protein  28.78 
 
 		 387 aa  104  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.705437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1381  protein of unknown function UPF0118  26.29 
 
 		 371 aa  100  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.0000000171014  decreased coverage  0.00070323 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3174  hypothetical protein  24.51 
 
 		 371 aa  98.2  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169461  normal  0.752301 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0988  hypothetical protein  38.17 
 
 		 346 aa  97.8  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.500729  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1102  protein of unknown function UPF0118  38.17 
 
 		 346 aa  97.8  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3487  hypothetical protein  25.23 
 
 		 354 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2597  putative inner membrane protein  23.89 
 
 		 365 aa  96.7  6e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1973  hypothetical protein  27.24 
 
 		 382 aa  96.7  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000012652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0582  hypothetical protein  24.44 
 
 		 367 aa  94.7  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0275552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0549  protein of unknown function UPF0118  27.2 
 
 		 384 aa  94.4  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0941477  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1844  putative inner membrane protein  23.32 
 
 		 367 aa  94  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1738  putative inner membrane protein  23.32 
 
 		 367 aa  94  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4162  hypothetical protein  25 
 
 		 350 aa  93.2  7e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2676  hypothetical protein  24.65 
 
 		 388 aa  92.8  9e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1705  hypothetical protein  25.08 
 
 		 349 aa  92.8  9e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.873743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0338  hypothetical protein  26.85 
 
 		 365 aa  90.9  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88474  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0192  protein of unknown function UPF0118  26.32 
 
 		 358 aa  90.5  4e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.146754  normal  0.226796 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1154  hypothetical protein  25.07 
 
 		 358 aa  89  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000550105  normal  0.0344505 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1686  hypothetical protein  24.78 
 
 		 390 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4061  hypothetical protein  23.9 
 
 		 351 aa  88.6  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4411  protein of unknown function UPF0118  27.17 
 
 		 389 aa  87.8  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0987  hypothetical protein  26.98 
 
 		 394 aa  87  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.89372 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4200  hypothetical protein  22.59 
 
 		 346 aa  87  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4130  hypothetical protein  27.17 
 
 		 406 aa  87  5e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.189132  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3980  hypothetical protein  26.36 
 
 		 352 aa  85.9  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0869717 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0405  hypothetical protein  22.51 
 
 		 374 aa  85.9  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0826  hypothetical protein  27.95 
 
 		 369 aa  85.1  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.981363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2029  hypothetical protein  22.32 
 
 		 348 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.850073 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2050  hypothetical protein  25 
 
 		 373 aa  83.2  0.000000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2221  lipoprotein, putative  23.4 
 
 		 349 aa  83.2  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0102435  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2083  hypothetical protein  27.05 
 
 		 356 aa  83.2  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.251587 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0020  hypothetical protein  30.96 
 
 		 358 aa  82  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0783  hypothetical protein  23.82 
 
 		 353 aa  82.4  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3249  hypothetical protein  32.34 
 
 		 350 aa  81.6  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.691639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0488  hypothetical protein  28.87 
 
 		 371 aa  82  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.131577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2549  hypothetical protein  26.47 
 
 		 352 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705186  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1746  putative inner membrane protein  23.03 
 
 		 371 aa  80.5  0.00000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00422506 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4053  hypothetical protein  28.45 
 
 		 361 aa  79.7  0.00000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.920687 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3950  protein of unknown function UPF0118  24.38 
 
 		 360 aa  79.3  0.00000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1226  hypothetical protein  29.35 
 
 		 352 aa  79.7  0.00000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29820  hypothetical protein  25.66 
 
 		 352 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0125581  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>