More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl0767 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp0796  hypothetical protein  98.86 
 
 
350 aa  689    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0767  hypothetical protein  100 
 
 
350 aa  692    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3672  hypothetical protein  36.14 
 
 
396 aa  217  2e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00326083  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4321  hypothetical protein  36.65 
 
 
380 aa  211  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0949244  normal  0.333615 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5064  protein of unknown function UPF0118  38.79 
 
 
359 aa  210  2e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.949113 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3243  hypothetical protein  36.42 
 
 
356 aa  209  5e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.340258  normal  0.654322 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3280  hypothetical protein  36.44 
 
 
361 aa  208  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.300759  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4551  hypothetical protein  38.82 
 
 
359 aa  207  2e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0235388 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5011  protein of unknown function UPF0118  38.82 
 
 
359 aa  206  5e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.022243  normal  0.128908 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4274  hypothetical protein  36.14 
 
 
356 aa  206  7e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.444788  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4064  permease  33.84 
 
 
349 aa  201  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1735  hypothetical protein  37.05 
 
 
356 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.661691  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3044  hypothetical protein  33.43 
 
 
398 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0268  protein of unknown function UPF0118  36.34 
 
 
363 aa  197  3e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0215  hypothetical protein  34.04 
 
 
406 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.776259 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1564  putative transmembrane transport protein  34.04 
 
 
406 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5018  hypothetical protein  38.08 
 
 
372 aa  196  6e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.454575  normal  0.302548 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1067  hypothetical protein  34.89 
 
 
356 aa  196  6e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3702  hypothetical protein  36.97 
 
 
356 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4180  hypothetical protein  36.67 
 
 
356 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.664917 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2299  hypothetical protein  34.58 
 
 
356 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0111  hypothetical protein  33.96 
 
 
391 aa  195  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.239724 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0984  hypothetical protein  34.58 
 
 
356 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3296  protein of unknown function UPF0118  34.27 
 
 
381 aa  195  1e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.854034  normal  0.185219 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1702  hypothetical protein  35.47 
 
 
360 aa  193  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.221894  normal  0.568838 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0472  hypothetical protein  32.44 
 
 
373 aa  193  4e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4853  hypothetical protein  39.76 
 
 
361 aa  193  5e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.197887 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3370  hypothetical protein  33.33 
 
 
360 aa  192  8e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0130  hypothetical protein  34.27 
 
 
356 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1401  hypothetical protein  34.27 
 
 
356 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4945  protein of unknown function UPF0118  34.69 
 
 
360 aa  191  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0255148  normal  0.175503 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0518  hypothetical protein  34.27 
 
 
356 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1484  hypothetical protein  34.27 
 
 
356 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0477  hypothetical protein  31.56 
 
 
368 aa  189  9e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0479  hypothetical protein  31.87 
 
 
372 aa  188  1e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3551  hypothetical protein  31.56 
 
 
364 aa  188  1e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2037  protein of unknown function UPF0118  33.33 
 
 
405 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0579571  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1838  protein of unknown function UPF0118  33.64 
 
 
398 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00200619  normal  0.0419691 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0447  hypothetical protein  31.56 
 
 
360 aa  186  4e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3886  hypothetical protein  31.56 
 
 
359 aa  186  4e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4008  hypothetical protein  31.56 
 
 
360 aa  186  6e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3812  protein of unknown function UPF0118  31.56 
 
 
356 aa  186  7e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1696  hypothetical protein  35.08 
 
 
391 aa  185  9e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.551892  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1275  hypothetical protein  34.78 
 
 
354 aa  182  1e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1578  protein of unknown function UPF0118  35.56 
 
 
373 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.373133  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1869  protein of unknown function UPF0118  38.55 
 
 
363 aa  171  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2098  hypothetical protein  32.68 
 
 
368 aa  170  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0297  hypothetical protein  31.41 
 
 
379 aa  160  4e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0271  hypothetical protein  31.41 
 
 
379 aa  160  5e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2209  hypothetical protein  29.5 
 
 
409 aa  157  2e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2709  hypothetical protein  28.66 
 
 
362 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2601  hypothetical protein  28.41 
 
 
352 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.99204  normal  0.455316 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0810  protein of unknown function UPF0118  31.01 
 
 
351 aa  143  5e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0661  hypothetical protein  31.01 
 
 
351 aa  143  5e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4200  hypothetical protein  29.46 
 
 
346 aa  137  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3734  hypothetical protein  29.01 
 
 
350 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1154  hypothetical protein  29.91 
 
 
358 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000550105  normal  0.0344505 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4162  hypothetical protein  29.19 
 
 
350 aa  126  5e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1705  hypothetical protein  29.19 
 
 
349 aa  126  5e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.873743  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4092  permease-like  30.4 
 
 
385 aa  126  7e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.322579  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3487  hypothetical protein  27.98 
 
 
354 aa  126  7e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2029  hypothetical protein  27 
 
 
348 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.850073 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2221  lipoprotein, putative  27.6 
 
 
349 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0102435  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0013  hypothetical protein  33.23 
 
 
363 aa  122  8e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00247664 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0192  protein of unknown function UPF0118  31.59 
 
 
358 aa  122  8e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.146754  normal  0.226796 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0549  protein of unknown function UPF0118  25.81 
 
 
384 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0941477  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1844  putative inner membrane protein  25.96 
 
 
367 aa  120  4.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1738  putative inner membrane protein  25.96 
 
 
367 aa  120  4.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2597  putative inner membrane protein  26.03 
 
 
365 aa  119  9e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2147  hypothetical protein  29.56 
 
 
357 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3648  hypothetical protein  29.75 
 
 
354 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.505772  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43510  hypothetical protein  29.14 
 
 
355 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0582  hypothetical protein  24.22 
 
 
367 aa  112  9e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0275552  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2676  hypothetical protein  25.16 
 
 
388 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0338  hypothetical protein  22.58 
 
 
365 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88474  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0783  hypothetical protein  27.6 
 
 
353 aa  107  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3492  hypothetical protein  24.63 
 
 
387 aa  107  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.705437  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0488  hypothetical protein  26.19 
 
 
371 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.131577  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1381  protein of unknown function UPF0118  25.47 
 
 
371 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.0000000171014  decreased coverage  0.00070323 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3189  protein of unknown function UPF0118  28.65 
 
 
361 aa  105  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000846761  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1746  putative inner membrane protein  25.8 
 
 
371 aa  103  6e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00422506 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0854  membrane protein  26.36 
 
 
363 aa  102  8e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0563046  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1690  putative inner membrane protein  29.54 
 
 
370 aa  102  8e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.534784  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0987  hypothetical protein  25.08 
 
 
394 aa  102  9e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.89372 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11000  hypothetical protein  25.43 
 
 
346 aa  102  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0901  protein of unknown function UPF0118  28.13 
 
 
365 aa  101  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4988  hypothetical protein  24.29 
 
 
347 aa  100  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3398  hypothetical protein  26.19 
 
 
360 aa  100  5e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0826  hypothetical protein  24.63 
 
 
369 aa  99.8  6e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.981363  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2012  protein of unknown function UPF0118  26.13 
 
 
363 aa  99.4  8e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.578603 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0737  hypothetical protein  24.05 
 
 
356 aa  99.4  8e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.203827  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2756  putative inner membrane protein  27.6 
 
 
369 aa  99.4  9e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1658  putative inner membrane protein  27.33 
 
 
364 aa  99  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2454  putative inner membrane protein  27.3 
 
 
395 aa  97.8  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.272244  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4061  hypothetical protein  26.59 
 
 
351 aa  98.2  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2633  hypothetical protein  27.71 
 
 
365 aa  97.8  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1954  protein of unknown function UPF0118  25.82 
 
 
370 aa  96.7  6e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.133227  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1769  putative inner membrane protein  25.82 
 
 
370 aa  96.7  6e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1889  putative inner membrane protein  25.82 
 
 
370 aa  96.7  6e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2212  protein of unknown function UPF0118  25.28 
 
 
355 aa  96.7  6e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000181482  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>