More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5018 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5018  hypothetical protein  100 
 
 		 372 aa  721    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.454575  normal  0.302548 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5011  protein of unknown function UPF0118  69.14 
 
 		 359 aa  409  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.022243  normal  0.128908 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4551  hypothetical protein  68.86 
 
 		 359 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0235388 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5064  protein of unknown function UPF0118  66.29 
 
 		 359 aa  390  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.949113 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1869  protein of unknown function UPF0118  65.46 
 
 		 363 aa  373  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4853  hypothetical protein  64.9 
 
 		 361 aa  362  6e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.197887 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3296  protein of unknown function UPF0118  48.13 
 
 		 381 aa  315  9.999999999999999e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.854034  normal  0.185219 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3243  hypothetical protein  48.54 
 
 		 356 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.340258  normal  0.654322 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4274  hypothetical protein  48.09 
 
 		 356 aa  295  9e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.444788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3280  hypothetical protein  46.52 
 
 		 361 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.300759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1735  hypothetical protein  46.8 
 
 		 356 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.661691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4321  hypothetical protein  48.12 
 
 		 380 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0949244  normal  0.333615 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4945  protein of unknown function UPF0118  44.74 
 
 		 360 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0255148  normal  0.175503 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0984  hypothetical protein  44.23 
 
 		 356 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2299  hypothetical protein  44.23 
 
 		 356 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1067  hypothetical protein  44.23 
 
 		 356 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1484  hypothetical protein  43.94 
 
 		 356 aa  268  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1401  hypothetical protein  43.94 
 
 		 356 aa  268  1e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0518  hypothetical protein  43.94 
 
 		 356 aa  268  1e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1702  hypothetical protein  43.9 
 
 		 360 aa  268  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.221894  normal  0.568838 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0130  hypothetical protein  43.94 
 
 		 356 aa  268  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4180  hypothetical protein  46.42 
 
 		 356 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.664917 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3702  hypothetical protein  46.42 
 
 		 356 aa  266  5e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1696  hypothetical protein  45.87 
 
 		 391 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.551892  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1275  hypothetical protein  37.96 
 
 		 354 aa  226  6e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0767  hypothetical protein  37.54 
 
 		 350 aa  204  1e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4092  permease-like  43.49 
 
 		 385 aa  202  7e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.322579  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0796  hypothetical protein  37.54 
 
 		 350 aa  192  1e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4064  permease  36.09 
 
 		 349 aa  189  5.999999999999999e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3044  hypothetical protein  36.52 
 
 		 398 aa  186  4e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1564  putative transmembrane transport protein  34.16 
 
 		 406 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0215  hypothetical protein  34.16 
 
 		 406 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.776259 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0111  hypothetical protein  34.77 
 
 		 391 aa  184  3e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.239724 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2037  protein of unknown function UPF0118  34.34 
 
 		 405 aa  177  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0579571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0479  hypothetical protein  34.2 
 
 		 372 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3672  hypothetical protein  33.88 
 
 		 396 aa  174  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00326083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1838  protein of unknown function UPF0118  34.67 
 
 		 398 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00200619  normal  0.0419691 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0472  hypothetical protein  34.2 
 
 		 373 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0477  hypothetical protein  33.92 
 
 		 368 aa  172  1e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3551  hypothetical protein  34.02 
 
 		 364 aa  171  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3886  hypothetical protein  33.62 
 
 		 359 aa  169  5e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3812  protein of unknown function UPF0118  34.02 
 
 		 356 aa  169  7e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4008  hypothetical protein  34.02 
 
 		 360 aa  169  7e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0447  hypothetical protein  34.02 
 
 		 360 aa  169  9e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0268  protein of unknown function UPF0118  33.23 
 
 		 363 aa  167  4e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3370  hypothetical protein  33.91 
 
 		 360 aa  164  3e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1578  protein of unknown function UPF0118  33.83 
 
 		 373 aa  160  4e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.373133  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2601  hypothetical protein  36.09 
 
 		 352 aa  144  2e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.99204  normal  0.455316 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3734  hypothetical protein  31.61 
 
 		 350 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0661  hypothetical protein  30.25 
 
 		 351 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0810  protein of unknown function UPF0118  30.25 
 
 		 351 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2709  hypothetical protein  29.88 
 
 		 362 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4162  hypothetical protein  30.7 
 
 		 350 aa  126  5e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1705  hypothetical protein  30.7 
 
 		 349 aa  126  7e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.873743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3487  hypothetical protein  30.3 
 
 		 354 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2209  hypothetical protein  26.5 
 
 		 409 aa  124  3e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0271  hypothetical protein  28.14 
 
 		 379 aa  124  3e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0582  hypothetical protein  28.03 
 
 		 367 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0275552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3492  hypothetical protein  30.09 
 
 		 387 aa  119  6e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.705437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2098  hypothetical protein  31.37 
 
 		 368 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0338  hypothetical protein  28.65 
 
 		 365 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88474  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0297  hypothetical protein  27.54 
 
 		 379 aa  117  3e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0192  protein of unknown function UPF0118  29.34 
 
 		 358 aa  116  5e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.146754  normal  0.226796 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2029  hypothetical protein  27.9 
 
 		 348 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.850073 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3980  hypothetical protein  29.86 
 
 		 352 aa  112  8.000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0869717 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4200  hypothetical protein  27.41 
 
 		 346 aa  112  9e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2221  lipoprotein, putative  27.53 
 
 		 349 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0102435  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2676  hypothetical protein  27.95 
 
 		 388 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0013  hypothetical protein  39.78 
 
 		 363 aa  108  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00247664 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4988  hypothetical protein  28.21 
 
 		 347 aa  107  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3950  protein of unknown function UPF0118  27.64 
 
 		 360 aa  107  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1154  hypothetical protein  31.27 
 
 		 358 aa  106  5e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000550105  normal  0.0344505 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2083  hypothetical protein  27.04 
 
 		 356 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.251587 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2050  hypothetical protein  26.84 
 
 		 373 aa  103  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0549  protein of unknown function UPF0118  25.77 
 
 		 384 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0941477  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1381  protein of unknown function UPF0118  26.82 
 
 		 371 aa  102  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.0000000171014  decreased coverage  0.00070323 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3174  hypothetical protein  27.41 
 
 		 371 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169461  normal  0.752301 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0987  hypothetical protein  26.76 
 
 		 394 aa  100  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.89372 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2147  hypothetical protein  31.48 
 
 		 357 aa  100  5e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0826  hypothetical protein  26.48 
 
 		 369 aa  100  5e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.981363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2868  hypothetical protein  26.89 
 
 		 358 aa  99.8  7e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838475  normal  0.0422213 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2633  hypothetical protein  27.41 
 
 		 365 aa  99.4  8e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1746  putative inner membrane protein  27.76 
 
 		 371 aa  99.4  9e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00422506 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0737  hypothetical protein  26.78 
 
 		 356 aa  99  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.203827  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4411  protein of unknown function UPF0118  26.59 
 
 		 389 aa  98.6  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0488  hypothetical protein  27.14 
 
 		 371 aa  98.6  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.131577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7289  hypothetical protein  28.45 
 
 		 353 aa  97.8  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2549  hypothetical protein  26.51 
 
 		 352 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705186  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2212  protein of unknown function UPF0118  29.65 
 
 		 355 aa  97.8  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000181482  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29820  hypothetical protein  25.98 
 
 		 352 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0125581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3717  hypothetical protein  25.07 
 
 		 353 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396811  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1508  putative inner membrane protein  26.7 
 
 		 370 aa  96.7  6e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188442 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11000  hypothetical protein  27.49 
 
 		 346 aa  96.3  8e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4061  hypothetical protein  28.4 
 
 		 351 aa  96.3  8e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4026  hypothetical protein  29.41 
 
 		 360 aa  95.9  9e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4130  hypothetical protein  25.99 
 
 		 406 aa  95.5  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.189132  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1821  hypothetical protein  28.81 
 
 		 381 aa  95.5  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.693161 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1907  protein of unknown function UPF0118  28.81 
 
 		 352 aa  95.5  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1954  protein of unknown function UPF0118  26.14 
 
 		 370 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.133227  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1973  hypothetical protein  26.63 
 
 		 382 aa  95.1  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000012652  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>