165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_4092 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_4092  permease-like  100 
 
 		 385 aa  751    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.322579  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4274  hypothetical protein  100 
 
 		 356 aa  557  1e-157  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.444788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3243  hypothetical protein  98.23 
 
 		 356 aa  551  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.340258  normal  0.654322 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1735  hypothetical protein  90.43 
 
 		 356 aa  513  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.661691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4180  hypothetical protein  85.11 
 
 		 356 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.664917 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3702  hypothetical protein  85.46 
 
 		 356 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4321  hypothetical protein  81.21 
 
 		 380 aa  441  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0949244  normal  0.333615 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3280  hypothetical protein  64.16 
 
 		 361 aa  358  9e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.300759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2299  hypothetical protein  64.64 
 
 		 356 aa  340  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1067  hypothetical protein  64.64 
 
 		 356 aa  340  2e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0984  hypothetical protein  64.64 
 
 		 356 aa  340  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1401  hypothetical protein  64.64 
 
 		 356 aa  339  5e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0518  hypothetical protein  64.64 
 
 		 356 aa  339  5e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0130  hypothetical protein  64.64 
 
 		 356 aa  339  5e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1484  hypothetical protein  64.64 
 
 		 356 aa  339  5e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1702  hypothetical protein  60.97 
 
 		 360 aa  327  3e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.221894  normal  0.568838 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1696  hypothetical protein  63.05 
 
 		 391 aa  311  9e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.551892  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4945  protein of unknown function UPF0118  59.25 
 
 		 360 aa  295  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0255148  normal  0.175503 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5018  hypothetical protein  43.65 
 
 		 372 aa  194  3e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.454575  normal  0.302548 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4853  hypothetical protein  45.24 
 
 		 361 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.197887 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3296  protein of unknown function UPF0118  37.04 
 
 		 381 aa  183  5.0000000000000004e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.854034  normal  0.185219 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4551  hypothetical protein  44.22 
 
 		 359 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0235388 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5011  protein of unknown function UPF0118  44.22 
 
 		 359 aa  173  5e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.022243  normal  0.128908 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5064  protein of unknown function UPF0118  42.6 
 
 		 359 aa  170  3e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.949113 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1869  protein of unknown function UPF0118  41.98 
 
 		 363 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0767  hypothetical protein  29.21 
 
 		 350 aa  131  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1275  hypothetical protein  32 
 
 		 354 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0796  hypothetical protein  28.74 
 
 		 350 aa  119  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3672  hypothetical protein  32.67 
 
 		 396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00326083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0111  hypothetical protein  30.89 
 
 		 391 aa  106  8e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.239724 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4064  permease  29.78 
 
 		 349 aa  100  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3044  hypothetical protein  29.07 
 
 		 398 aa  99.8  8e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1564  putative transmembrane transport protein  28.46 
 
 		 406 aa  96.3  8e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0215  hypothetical protein  28.46 
 
 		 406 aa  96.3  8e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.776259 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3734  hypothetical protein  29.37 
 
 		 350 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3812  protein of unknown function UPF0118  28.78 
 
 		 356 aa  88.2  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3886  hypothetical protein  28.78 
 
 		 359 aa  88.2  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4008  hypothetical protein  28.78 
 
 		 360 aa  88.2  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0447  hypothetical protein  28.78 
 
 		 360 aa  87.8  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2037  protein of unknown function UPF0118  29.49 
 
 		 405 aa  87  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0579571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0479  hypothetical protein  29.18 
 
 		 372 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3487  hypothetical protein  29.53 
 
 		 354 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0472  hypothetical protein  28.83 
 
 		 373 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0477  hypothetical protein  28.83 
 
 		 368 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3370  hypothetical protein  30.08 
 
 		 360 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4061  hypothetical protein  28.21 
 
 		 351 aa  83.2  0.000000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2709  hypothetical protein  28.46 
 
 		 362 aa  83.2  0.000000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3551  hypothetical protein  28.47 
 
 		 364 aa  83.2  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2209  hypothetical protein  26.98 
 
 		 409 aa  82.8  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0268  protein of unknown function UPF0118  29.89 
 
 		 363 aa  82.4  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1838  protein of unknown function UPF0118  29.15 
 
 		 398 aa  82  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00200619  normal  0.0419691 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3648  hypothetical protein  27.84 
 
 		 354 aa  79.7  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.505772  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4162  hypothetical protein  28.57 
 
 		 350 aa  79.3  0.00000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1705  hypothetical protein  28.57 
 
 		 349 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.873743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1578  protein of unknown function UPF0118  28 
 
 		 373 aa  77.8  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.373133  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0661  hypothetical protein  29.43 
 
 		 351 aa  77.4  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0810  protein of unknown function UPF0118  29.43 
 
 		 351 aa  77.4  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0297  hypothetical protein  27.3 
 
 		 379 aa  77.4  0.0000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43510  hypothetical protein  26.77 
 
 		 355 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2676  hypothetical protein  30.14 
 
 		 388 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2601  hypothetical protein  30.18 
 
 		 352 aa  74.7  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.99204  normal  0.455316 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2098  hypothetical protein  26.15 
 
 		 368 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2029  hypothetical protein  25.98 
 
 		 348 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.850073 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1844  putative inner membrane protein  24.72 
 
 		 367 aa  72.8  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0271  hypothetical protein  25.81 
 
 		 379 aa  72.4  0.00000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1738  putative inner membrane protein  24.72 
 
 		 367 aa  72.8  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0582  hypothetical protein  26.86 
 
 		 367 aa  72  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0275552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2597  putative inner membrane protein  24.54 
 
 		 365 aa  72  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10160  hypothetical protein  28.97 
 
 		 364 aa  68.2  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.406243  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4200  hypothetical protein  25.59 
 
 		 346 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0192  protein of unknown function UPF0118  25.94 
 
 		 358 aa  67  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.146754  normal  0.226796 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2221  lipoprotein, putative  25.2 
 
 		 349 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0102435  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2633  hypothetical protein  21.53 
 
 		 365 aa  66.6  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1746  putative inner membrane protein  24.11 
 
 		 371 aa  65.1  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00422506 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01657  predicted inner membrane protein  24.47 
 
 		 370 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1954  protein of unknown function UPF0118  24.47 
 
 		 370 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.133227  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2403  putative inner membrane protein  24.47 
 
 		 370 aa  64.3  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0340493 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1889  putative inner membrane protein  24.47 
 
 		 370 aa  63.9  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1943  putative inner membrane protein  24.47 
 
 		 370 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000987664 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1769  putative inner membrane protein  24.47 
 
 		 370 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1904  putative inner membrane protein  24.47 
 
 		 370 aa  63.9  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1508  putative inner membrane protein  24.47 
 
 		 370 aa  63.5  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188442 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3398  hypothetical protein  24.64 
 
 		 360 aa  63.5  0.000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2457  hypothetical protein  26.54 
 
 		 362 aa  63.2  0.000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3980  hypothetical protein  28.33 
 
 		 352 aa  62.4  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0869717 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11000  hypothetical protein  26.77 
 
 		 346 aa  62  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2756  putative inner membrane protein  24.71 
 
 		 369 aa  62  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2454  putative inner membrane protein  23.26 
 
 		 395 aa  60.8  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.272244  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3174  hypothetical protein  27.99 
 
 		 371 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169461  normal  0.752301 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1690  putative inner membrane protein  26.84 
 
 		 370 aa  60.1  0.00000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.534784  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1973  hypothetical protein  26.91 
 
 		 382 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000012652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2012  protein of unknown function UPF0118  23.35 
 
 		 363 aa  58.9  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.578603 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0405  hypothetical protein  27.31 
 
 		 374 aa  58.2  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  21.86 
 
 		 405 aa  57.4  0.0000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1381  protein of unknown function UPF0118  27.61 
 
 		 371 aa  57  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.0000000171014  decreased coverage  0.00070323 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0338  hypothetical protein  25.97 
 
 		 365 aa  56.6  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88474  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1653  hypothetical protein  26.24 
 
 		 362 aa  56.2  0.0000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.212682  normal  0.81767 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2289  hypothetical protein  27.08 
 
 		 353 aa  55.8  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.864507  normal  0.333993 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0691  hypothetical protein  27.16 
 
 		 377 aa  55.8  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.627447 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1686  hypothetical protein  23.24 
 
 		 390 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>