More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0271 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0271  hypothetical protein  100 
 
 		 379 aa  752    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0297  hypothetical protein  95.25 
 
 		 379 aa  700    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2209  hypothetical protein  76.69 
 
 		 409 aa  563  1.0000000000000001e-159  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0268  protein of unknown function UPF0118  43.59 
 
 		 363 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1578  protein of unknown function UPF0118  40.75 
 
 		 373 aa  276  4e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.373133  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2098  hypothetical protein  42.07 
 
 		 368 aa  251  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2709  hypothetical protein  40.98 
 
 		 362 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2601  hypothetical protein  39.36 
 
 		 352 aa  221  9.999999999999999e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.99204  normal  0.455316 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0661  hypothetical protein  40.18 
 
 		 351 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0810  protein of unknown function UPF0118  40.18 
 
 		 351 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0013  hypothetical protein  42.86 
 
 		 363 aa  200  3.9999999999999996e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00247664 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2147  hypothetical protein  38.89 
 
 		 357 aa  184  3e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0582  hypothetical protein  32.18 
 
 		 367 aa  177  4e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0275552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2029  hypothetical protein  32.35 
 
 		 348 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.850073 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2221  lipoprotein, putative  32.65 
 
 		 349 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0102435  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2676  hypothetical protein  32.76 
 
 		 388 aa  164  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4200  hypothetical protein  30.72 
 
 		 346 aa  164  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3734  hypothetical protein  31.44 
 
 		 350 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1381  protein of unknown function UPF0118  30.59 
 
 		 371 aa  162  7e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.0000000171014  decreased coverage  0.00070323 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1275  hypothetical protein  30.82 
 
 		 354 aa  161  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1154  hypothetical protein  33.33 
 
 		 358 aa  161  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000550105  normal  0.0344505 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4162  hypothetical protein  32.63 
 
 		 350 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1705  hypothetical protein  32.92 
 
 		 349 aa  159  8e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.873743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0111  hypothetical protein  29.08 
 
 		 391 aa  157  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.239724 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3886  hypothetical protein  29.86 
 
 		 359 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3551  hypothetical protein  32.11 
 
 		 364 aa  156  7e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0477  hypothetical protein  31.22 
 
 		 368 aa  155  9e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3487  hypothetical protein  32.33 
 
 		 354 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0479  hypothetical protein  32.11 
 
 		 372 aa  155  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1973  hypothetical protein  31.31 
 
 		 382 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000012652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3370  hypothetical protein  30.39 
 
 		 360 aa  153  4e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2037  protein of unknown function UPF0118  31.64 
 
 		 405 aa  153  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0579571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0783  hypothetical protein  30.56 
 
 		 353 aa  153  5e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3672  hypothetical protein  29.82 
 
 		 396 aa  152  8.999999999999999e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00326083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0447  hypothetical protein  29.4 
 
 		 360 aa  151  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1838  protein of unknown function UPF0118  31.49 
 
 		 398 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00200619  normal  0.0419691 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4008  hypothetical protein  29.4 
 
 		 360 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3812  protein of unknown function UPF0118  29.97 
 
 		 356 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0767  hypothetical protein  31.41 
 
 		 350 aa  150  4e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4064  permease  30.67 
 
 		 349 aa  149  6e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0472  hypothetical protein  31.51 
 
 		 373 aa  149  9e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3174  hypothetical protein  30.59 
 
 		 371 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169461  normal  0.752301 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1564  putative transmembrane transport protein  29.49 
 
 		 406 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3044  hypothetical protein  29.18 
 
 		 398 aa  145  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0215  hypothetical protein  29.49 
 
 		 406 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.776259 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3648  hypothetical protein  33.44 
 
 		 354 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.505772  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2457  hypothetical protein  32.5 
 
 		 362 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10160  hypothetical protein  32.71 
 
 		 364 aa  140  4.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.406243  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43510  hypothetical protein  32.81 
 
 		 355 aa  139  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4061  hypothetical protein  28.74 
 
 		 351 aa  136  6.0000000000000005e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3243  hypothetical protein  27.66 
 
 		 356 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.340258  normal  0.654322 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0796  hypothetical protein  31.12 
 
 		 350 aa  135  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0192  protein of unknown function UPF0118  30.34 
 
 		 358 aa  134  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.146754  normal  0.226796 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0854  membrane protein  32.52 
 
 		 363 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0563046  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4274  hypothetical protein  27.61 
 
 		 356 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.444788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2299  hypothetical protein  26.13 
 
 		 356 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0984  hypothetical protein  26.13 
 
 		 356 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1067  hypothetical protein  26.13 
 
 		 356 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3398  hypothetical protein  26.14 
 
 		 360 aa  129  8.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0518  hypothetical protein  26.13 
 
 		 356 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1401  hypothetical protein  26.13 
 
 		 356 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0130  hypothetical protein  26.13 
 
 		 356 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1484  hypothetical protein  26.13 
 
 		 356 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4945  protein of unknown function UPF0118  27.51 
 
 		 360 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0255148  normal  0.175503 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1735  hypothetical protein  26.74 
 
 		 356 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.661691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4321  hypothetical protein  26.17 
 
 		 380 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0949244  normal  0.333615 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3280  hypothetical protein  25.58 
 
 		 361 aa  124  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.300759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3249  hypothetical protein  29.89 
 
 		 350 aa  123  6e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.691639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0549  protein of unknown function UPF0118  27.64 
 
 		 384 aa  123  7e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0941477  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1696  hypothetical protein  25.52 
 
 		 391 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.551892  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1702  hypothetical protein  26.33 
 
 		 360 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.221894  normal  0.568838 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3296  protein of unknown function UPF0118  27.47 
 
 		 381 aa  120  3e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.854034  normal  0.185219 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4026  hypothetical protein  28.57 
 
 		 360 aa  120  3.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2083  hypothetical protein  29.39 
 
 		 356 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.251587 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1746  putative inner membrane protein  25.4 
 
 		 371 aa  117  3e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00422506 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3210  hypothetical protein  29.34 
 
 		 354 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.212604 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4180  hypothetical protein  26.36 
 
 		 356 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.664917 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1690  putative inner membrane protein  29.2 
 
 		 370 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.534784  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1950  protein of unknown function UPF0118  31.58 
 
 		 346 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.863146  normal  0.537489 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5018  hypothetical protein  29.25 
 
 		 372 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.454575  normal  0.302548 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3717  hypothetical protein  29.7 
 
 		 353 aa  114  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396811  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3378  hypothetical protein  27.76 
 
 		 354 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3702  hypothetical protein  26.06 
 
 		 356 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01657  predicted inner membrane protein  28.45 
 
 		 370 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1954  protein of unknown function UPF0118  28.45 
 
 		 370 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.133227  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1889  putative inner membrane protein  28.45 
 
 		 370 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1508  putative inner membrane protein  28.45 
 
 		 370 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188442 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1943  putative inner membrane protein  28.45 
 
 		 370 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000987664 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2403  putative inner membrane protein  28.45 
 
 		 370 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0340493 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1904  putative inner membrane protein  28.45 
 
 		 370 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4853  hypothetical protein  31.65 
 
 		 361 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.197887 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1769  putative inner membrane protein  28.45 
 
 		 370 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3531  hypothetical protein  29.52 
 
 		 354 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.43917  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2207  hypothetical protein  29.52 
 
 		 354 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5011  protein of unknown function UPF0118  27.47 
 
 		 359 aa  110  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.022243  normal  0.128908 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4551  hypothetical protein  27.78 
 
 		 359 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0235388 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0338  hypothetical protein  27.65 
 
 		 365 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88474  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1843  hypothetical protein  24.73 
 
 		 383 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1830  hypothetical protein  29.15 
 
 		 354 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5064  protein of unknown function UPF0118  28.75 
 
 		 359 aa  110  5e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.949113 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>