220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1843 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_1843  hypothetical protein  100 
 
 		 383 aa  749    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0691  hypothetical protein  65.86 
 
 		 377 aa  496  1e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.627447 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06643  hypothetical protein  59.67 
 
 		 365 aa  421  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001141  hypothetical protein  59.36 
 
 		 382 aa  420  1e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4608  hypothetical protein  41.08 
 
 		 370 aa  275  1.0000000000000001e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.991825  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0120  hypothetical protein  39.01 
 
 		 370 aa  248  1e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6456  hypothetical protein  39.23 
 
 		 367 aa  247  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.267604 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2741  hypothetical protein  37.4 
 
 		 369 aa  246  6e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2819  hypothetical protein  37.4 
 
 		 369 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1906  membrane protein  41.95 
 
 		 353 aa  244  9.999999999999999e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0890459  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2910  hypothetical protein  36.86 
 
 		 369 aa  243  5e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2900  hypothetical protein  40.11 
 
 		 379 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1709  hypothetical protein  37.83 
 
 		 388 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.615575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1020  membrane protein  39.26 
 
 		 355 aa  238  2e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0593  hypothetical protein  37.05 
 
 		 376 aa  234  1.0000000000000001e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.356961  normal  0.748294 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0748  hypothetical protein  39.65 
 
 		 365 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4469  hypothetical protein  39.65 
 
 		 365 aa  229  7e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0580151  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44170  hypothetical protein  37.46 
 
 		 368 aa  227  3e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.392978  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0752  hypothetical protein  39.94 
 
 		 365 aa  225  8e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0379564  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0714  permease  39.65 
 
 		 365 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0333328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4043  protein of unknown function UPF0118  35.19 
 
 		 385 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0862  hypothetical protein  36.59 
 
 		 360 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3036  protein of unknown function UPF0118  34.96 
 
 		 363 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3084  protein of unknown function UPF0118  34.96 
 
 		 363 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2169  hypothetical protein  38.35 
 
 		 354 aa  204  2e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.344347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5187  hypothetical protein  32.13 
 
 		 381 aa  191  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.503723 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2633  hypothetical protein  34.98 
 
 		 365 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1229  permease  32.16 
 
 		 366 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.632798 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1738  putative inner membrane protein  33.62 
 
 		 367 aa  172  5.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1844  putative inner membrane protein  33.62 
 
 		 367 aa  172  5.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2597  putative inner membrane protein  33.82 
 
 		 365 aa  171  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4349  hypothetical protein  37.57 
 
 		 368 aa  169  9e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.287718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0405  hypothetical protein  32.76 
 
 		 374 aa  169  9e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2756  putative inner membrane protein  32.27 
 
 		 369 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2454  putative inner membrane protein  32.27 
 
 		 395 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.272244  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1746  putative inner membrane protein  29.86 
 
 		 371 aa  162  8.000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00422506 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1690  putative inner membrane protein  31.09 
 
 		 370 aa  162  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.534784  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2175  hypothetical protein  33.99 
 
 		 366 aa  161  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0131226 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1658  putative inner membrane protein  31.93 
 
 		 364 aa  158  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2403  putative inner membrane protein  29.43 
 
 		 370 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0340493 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1686  hypothetical protein  31.91 
 
 		 390 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01657  predicted inner membrane protein  29.43 
 
 		 370 aa  153  4e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1954  protein of unknown function UPF0118  29.43 
 
 		 370 aa  153  4e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.133227  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1943  putative inner membrane protein  29.43 
 
 		 370 aa  153  4e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000987664 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1769  putative inner membrane protein  29.43 
 
 		 370 aa  153  4e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1904  putative inner membrane protein  29.43 
 
 		 370 aa  153  4e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1889  putative inner membrane protein  29.43 
 
 		 370 aa  153  4e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1508  putative inner membrane protein  29.43 
 
 		 370 aa  153  5e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188442 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3398  hypothetical protein  32.24 
 
 		 360 aa  152  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3486  hypothetical protein  33.33 
 
 		 375 aa  150  3e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.12464 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1495  putative inner membrane protein  31.3 
 
 		 372 aa  149  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138717 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1460  putative inner membrane protein  31.3 
 
 		 372 aa  149  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.539422  normal  0.149027 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1979  putative inner membrane protein  31.3 
 
 		 372 aa  149  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.591827  hitchhiker  0.00000561887 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1476  putative inner membrane protein  31.3 
 
 		 372 aa  149  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.655079  hitchhiker  0.000276 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1808  putative inner membrane protein  31.3 
 
 		 372 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2029  hypothetical protein  30.24 
 
 		 348 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.850073 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2221  lipoprotein, putative  30.24 
 
 		 349 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0102435  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0582  hypothetical protein  28.57 
 
 		 367 aa  133  5e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0275552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2676  hypothetical protein  28.44 
 
 		 388 aa  127  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4200  hypothetical protein  28.53 
 
 		 346 aa  126  7e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4162  hypothetical protein  29.09 
 
 		 350 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1705  hypothetical protein  29.41 
 
 		 349 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.873743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3734  hypothetical protein  28.48 
 
 		 350 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3487  hypothetical protein  30.65 
 
 		 354 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1381  protein of unknown function UPF0118  27.33 
 
 		 371 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.0000000171014  decreased coverage  0.00070323 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5665  hypothetical protein  26.8 
 
 		 362 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3648  hypothetical protein  28.19 
 
 		 354 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.505772  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43510  hypothetical protein  29.1 
 
 		 355 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1973  hypothetical protein  27.14 
 
 		 382 aa  110  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000012652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3174  hypothetical protein  26.96 
 
 		 371 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169461  normal  0.752301 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10160  hypothetical protein  28.29 
 
 		 364 aa  105  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.406243  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0271  hypothetical protein  24.73 
 
 		 379 aa  103  5e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0297  hypothetical protein  22.75 
 
 		 379 aa  94.7  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2457  hypothetical protein  27.61 
 
 		 362 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0192  protein of unknown function UPF0118  28.25 
 
 		 358 aa  88.6  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.146754  normal  0.226796 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2209  hypothetical protein  20.73 
 
 		 409 aa  85.1  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0810  protein of unknown function UPF0118  25.8 
 
 		 351 aa  84  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0661  hypothetical protein  25.8 
 
 		 351 aa  84  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4411  protein of unknown function UPF0118  25.07 
 
 		 389 aa  79.7  0.00000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2311  protein of unknown function UPF0118  26.25 
 
 		 393 aa  79.3  0.00000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0447  hypothetical protein  28.53 
 
 		 360 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3886  hypothetical protein  28.45 
 
 		 359 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3044  hypothetical protein  25.92 
 
 		 398 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4008  hypothetical protein  28.25 
 
 		 360 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3370  hypothetical protein  27.15 
 
 		 360 aa  77  0.0000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0479  hypothetical protein  25.95 
 
 		 372 aa  76.3  0.0000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4061  hypothetical protein  24.93 
 
 		 351 aa  75.1  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4130  hypothetical protein  24.54 
 
 		 406 aa  74.7  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.189132  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3812  protein of unknown function UPF0118  28.13 
 
 		 356 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0268  protein of unknown function UPF0118  19.82 
 
 		 363 aa  73.9  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0477  hypothetical protein  25.81 
 
 		 368 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3551  hypothetical protein  26.27 
 
 		 364 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1564  putative transmembrane transport protein  25.21 
 
 		 406 aa  73.2  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0215  hypothetical protein  25.21 
 
 		 406 aa  73.2  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.776259 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0826  hypothetical protein  24.19 
 
 		 369 aa  72.8  0.000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.981363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3181  hypothetical protein  25.07 
 
 		 419 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.423402  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2709  hypothetical protein  22.97 
 
 		 362 aa  70.5  0.00000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4274  hypothetical protein  24.4 
 
 		 356 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.444788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1578  protein of unknown function UPF0118  22.28 
 
 		 373 aa  70.5  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.373133  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2050  hypothetical protein  24.62 
 
 		 373 aa  69.7  0.00000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>