More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_10160 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_10160  hypothetical protein  100 
 
 		 364 aa  694    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.406243  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2029  hypothetical protein  74.13 
 
 		 348 aa  490  1e-137  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.850073 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4200  hypothetical protein  72.75 
 
 		 346 aa  476  1e-133  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2221  lipoprotein, putative  73.84 
 
 		 349 aa  473  1e-132  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0102435  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3487  hypothetical protein  70.51 
 
 		 354 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3734  hypothetical protein  72.01 
 
 		 350 aa  461  1e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2457  hypothetical protein  76.94 
 
 		 362 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4162  hypothetical protein  71.43 
 
 		 350 aa  455  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1705  hypothetical protein  71.72 
 
 		 349 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.873743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3648  hypothetical protein  71.07 
 
 		 354 aa  435  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.505772  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43510  hypothetical protein  69.89 
 
 		 355 aa  434  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0582  hypothetical protein  44.44 
 
 		 367 aa  281  1e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0275552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1381  protein of unknown function UPF0118  43.44 
 
 		 371 aa  258  8e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.0000000171014  decreased coverage  0.00070323 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2676  hypothetical protein  42.39 
 
 		 388 aa  258  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3174  hypothetical protein  42.74 
 
 		 371 aa  245  8e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169461  normal  0.752301 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1973  hypothetical protein  42.69 
 
 		 382 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000012652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4061  hypothetical protein  40.41 
 
 		 351 aa  223  4.9999999999999996e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3486  hypothetical protein  34.52 
 
 		 375 aa  210  2e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.12464 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0192  protein of unknown function UPF0118  34.96 
 
 		 358 aa  204  2e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.146754  normal  0.226796 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5665  hypothetical protein  37.39 
 
 		 362 aa  203  5e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2756  putative inner membrane protein  34.92 
 
 		 369 aa  194  2e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2633  hypothetical protein  32.95 
 
 		 365 aa  191  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2209  hypothetical protein  33.43 
 
 		 409 aa  190  2.9999999999999997e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1690  putative inner membrane protein  34.44 
 
 		 370 aa  189  5.999999999999999e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.534784  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1746  putative inner membrane protein  34.53 
 
 		 371 aa  188  1e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00422506 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01657  predicted inner membrane protein  35 
 
 		 370 aa  187  2e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1954  protein of unknown function UPF0118  35 
 
 		 370 aa  187  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.133227  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1889  putative inner membrane protein  35 
 
 		 370 aa  187  2e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1904  putative inner membrane protein  35 
 
 		 370 aa  187  2e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1943  putative inner membrane protein  35 
 
 		 370 aa  187  2e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000987664 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1769  putative inner membrane protein  35 
 
 		 370 aa  187  2e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2403  putative inner membrane protein  35 
 
 		 370 aa  187  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0340493 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1508  putative inner membrane protein  35 
 
 		 370 aa  187  3e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188442 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2454  putative inner membrane protein  35.07 
 
 		 395 aa  187  3e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.272244  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2709  hypothetical protein  34.39 
 
 		 362 aa  186  5e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0405  hypothetical protein  33.33 
 
 		 374 aa  186  5e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1738  putative inner membrane protein  31.62 
 
 		 367 aa  186  7e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1844  putative inner membrane protein  31.62 
 
 		 367 aa  186  7e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2597  putative inner membrane protein  31.62 
 
 		 365 aa  181  2e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2175  hypothetical protein  33.98 
 
 		 366 aa  181  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0131226 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0268  protein of unknown function UPF0118  34.93 
 
 		 363 aa  179  5.999999999999999e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1808  putative inner membrane protein  35.65 
 
 		 372 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1495  putative inner membrane protein  35.38 
 
 		 372 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138717 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1476  putative inner membrane protein  35.38 
 
 		 372 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.655079  hitchhiker  0.000276 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0862  hypothetical protein  36.65 
 
 		 360 aa  177  2e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1460  putative inner membrane protein  35.38 
 
 		 372 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.539422  normal  0.149027 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1979  putative inner membrane protein  35.38 
 
 		 372 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.591827  hitchhiker  0.00000561887 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1578  protein of unknown function UPF0118  34.9 
 
 		 373 aa  177  3e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.373133  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0297  hypothetical protein  32.95 
 
 		 379 aa  177  3e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1658  putative inner membrane protein  31.96 
 
 		 364 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0271  hypothetical protein  32.66 
 
 		 379 aa  172  6.999999999999999e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0810  protein of unknown function UPF0118  36.54 
 
 		 351 aa  171  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0661  hypothetical protein  36.54 
 
 		 351 aa  171  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2169  hypothetical protein  33.92 
 
 		 354 aa  171  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.344347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3398  hypothetical protein  32.17 
 
 		 360 aa  166  4e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2601  hypothetical protein  35.26 
 
 		 352 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.99204  normal  0.455316 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1686  hypothetical protein  33.43 
 
 		 390 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0593  hypothetical protein  31.07 
 
 		 376 aa  158  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.356961  normal  0.748294 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2741  hypothetical protein  29.71 
 
 		 369 aa  153  4e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2819  hypothetical protein  29.71 
 
 		 369 aa  152  8e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5187  hypothetical protein  31.27 
 
 		 381 aa  152  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.503723 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4043  protein of unknown function UPF0118  31.45 
 
 		 385 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4608  hypothetical protein  28.13 
 
 		 370 aa  145  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.991825  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1154  hypothetical protein  30.29 
 
 		 358 aa  145  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000550105  normal  0.0344505 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2098  hypothetical protein  33.33 
 
 		 368 aa  143  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2910  hypothetical protein  28.53 
 
 		 369 aa  143  5e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44170  hypothetical protein  34.23 
 
 		 368 aa  141  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.392978  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2299  hypothetical protein  31.58 
 
 		 356 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0984  hypothetical protein  31.58 
 
 		 356 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1067  hypothetical protein  31.58 
 
 		 356 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3084  protein of unknown function UPF0118  29.48 
 
 		 363 aa  136  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3036  protein of unknown function UPF0118  29.48 
 
 		 363 aa  136  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1401  hypothetical protein  31.48 
 
 		 356 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0518  hypothetical protein  31.48 
 
 		 356 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0130  hypothetical protein  31.48 
 
 		 356 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1484  hypothetical protein  31.48 
 
 		 356 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4321  hypothetical protein  30.25 
 
 		 380 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0949244  normal  0.333615 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6456  hypothetical protein  30.26 
 
 		 367 aa  134  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.267604 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1709  hypothetical protein  30.92 
 
 		 388 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.615575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4064  permease  30.59 
 
 		 349 aa  133  5e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2037  protein of unknown function UPF0118  30.9 
 
 		 405 aa  133  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0579571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2900  hypothetical protein  30.37 
 
 		 379 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1843  hypothetical protein  28.53 
 
 		 383 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1564  putative transmembrane transport protein  31.21 
 
 		 406 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0215  hypothetical protein  31.21 
 
 		 406 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.776259 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0013  hypothetical protein  35.71 
 
 		 363 aa  130  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00247664 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1838  protein of unknown function UPF0118  30.7 
 
 		 398 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00200619  normal  0.0419691 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0111  hypothetical protein  30.09 
 
 		 391 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.239724 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3044  hypothetical protein  30.95 
 
 		 398 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0120  hypothetical protein  29.28 
 
 		 370 aa  126  5e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1696  hypothetical protein  31.27 
 
 		 391 aa  126  5e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.551892  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4008  hypothetical protein  28.96 
 
 		 360 aa  126  6e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3812  protein of unknown function UPF0118  28.96 
 
 		 356 aa  126  6e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0447  hypothetical protein  28.96 
 
 		 360 aa  126  6e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3886  hypothetical protein  28.96 
 
 		 359 aa  126  7e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3370  hypothetical protein  29.38 
 
 		 360 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3551  hypothetical protein  27.64 
 
 		 364 aa  124  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1275  hypothetical protein  28.74 
 
 		 354 aa  124  3e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0472  hypothetical protein  28.73 
 
 		 373 aa  124  3e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0479  hypothetical protein  27.48 
 
 		 372 aa  124  3e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>