233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_2910 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_2741  hypothetical protein  93.5 
 
 		 369 aa  695    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2819  hypothetical protein  93.22 
 
 		 369 aa  691    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2910  hypothetical protein  100 
 
 		 369 aa  734    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0593  hypothetical protein  51.39 
 
 		 376 aa  395  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.356961  normal  0.748294 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0120  hypothetical protein  44.14 
 
 		 370 aa  312  6.999999999999999e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44170  hypothetical protein  45.71 
 
 		 368 aa  310  2e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.392978  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2900  hypothetical protein  43.97 
 
 		 379 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6456  hypothetical protein  42.19 
 
 		 367 aa  299  5e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.267604 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1709  hypothetical protein  41.48 
 
 		 388 aa  293  4e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.615575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0748  hypothetical protein  45.51 
 
 		 365 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0752  hypothetical protein  45.8 
 
 		 365 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0379564  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0714  permease  45.04 
 
 		 365 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0333328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4469  hypothetical protein  44.93 
 
 		 365 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0580151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1843  hypothetical protein  36.86 
 
 		 383 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0691  hypothetical protein  34.32 
 
 		 377 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.627447 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06643  hypothetical protein  35.78 
 
 		 365 aa  226  4e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4608  hypothetical protein  34.69 
 
 		 370 aa  226  5.0000000000000005e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.991825  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001141  hypothetical protein  34.65 
 
 		 382 aa  216  5.9999999999999996e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3084  protein of unknown function UPF0118  33.54 
 
 		 363 aa  199  9e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3036  protein of unknown function UPF0118  33.54 
 
 		 363 aa  199  9e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1020  membrane protein  34.28 
 
 		 355 aa  197  2.0000000000000003e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0862  hypothetical protein  32.94 
 
 		 360 aa  195  9e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5187  hypothetical protein  33.52 
 
 		 381 aa  193  5e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.503723 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1906  membrane protein  34.43 
 
 		 353 aa  187  2e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0890459  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2169  hypothetical protein  29.69 
 
 		 354 aa  183  3e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.344347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4043  protein of unknown function UPF0118  29.31 
 
 		 385 aa  176  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1690  putative inner membrane protein  29.88 
 
 		 370 aa  157  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.534784  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3486  hypothetical protein  29.36 
 
 		 375 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.12464 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2756  putative inner membrane protein  30.18 
 
 		 369 aa  151  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1746  putative inner membrane protein  27.38 
 
 		 371 aa  151  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00422506 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1508  putative inner membrane protein  29.48 
 
 		 370 aa  149  8e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188442 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01657  predicted inner membrane protein  29.48 
 
 		 370 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1954  protein of unknown function UPF0118  29.48 
 
 		 370 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.133227  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1904  putative inner membrane protein  29.48 
 
 		 370 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1943  putative inner membrane protein  29.48 
 
 		 370 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000987664 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1889  putative inner membrane protein  29.48 
 
 		 370 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1769  putative inner membrane protein  29.48 
 
 		 370 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2403  putative inner membrane protein  29.48 
 
 		 370 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0340493 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2454  putative inner membrane protein  29.57 
 
 		 395 aa  147  3e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.272244  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2633  hypothetical protein  27.79 
 
 		 365 aa  147  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1844  putative inner membrane protein  30.09 
 
 		 367 aa  145  8.000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1738  putative inner membrane protein  30.09 
 
 		 367 aa  145  8.000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1658  putative inner membrane protein  28.4 
 
 		 364 aa  144  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1229  permease  29.13 
 
 		 366 aa  144  3e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.632798 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4349  hypothetical protein  34.12 
 
 		 368 aa  142  7e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.287718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2597  putative inner membrane protein  30.79 
 
 		 365 aa  142  9.999999999999999e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2175  hypothetical protein  30.4 
 
 		 366 aa  140  4.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0131226 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1808  putative inner membrane protein  29.19 
 
 		 372 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1979  putative inner membrane protein  28.9 
 
 		 372 aa  136  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.591827  hitchhiker  0.00000561887 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1460  putative inner membrane protein  28.9 
 
 		 372 aa  136  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.539422  normal  0.149027 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3398  hypothetical protein  28.09 
 
 		 360 aa  136  5e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1476  putative inner membrane protein  28.9 
 
 		 372 aa  136  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.655079  hitchhiker  0.000276 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1495  putative inner membrane protein  28.9 
 
 		 372 aa  136  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138717 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0405  hypothetical protein  27.19 
 
 		 374 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2029  hypothetical protein  27.24 
 
 		 348 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.850073 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1686  hypothetical protein  28.78 
 
 		 390 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3734  hypothetical protein  26.69 
 
 		 350 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0582  hypothetical protein  27.47 
 
 		 367 aa  129  7.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0275552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2676  hypothetical protein  28.14 
 
 		 388 aa  127  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4162  hypothetical protein  27.3 
 
 		 350 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1381  protein of unknown function UPF0118  29.05 
 
 		 371 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.0000000171014  decreased coverage  0.00070323 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2221  lipoprotein, putative  26.32 
 
 		 349 aa  124  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0102435  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1705  hypothetical protein  27.9 
 
 		 349 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.873743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5665  hypothetical protein  29.36 
 
 		 362 aa  123  5e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3487  hypothetical protein  28.21 
 
 		 354 aa  123  5e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1973  hypothetical protein  28.12 
 
 		 382 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000012652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4200  hypothetical protein  26.32 
 
 		 346 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3174  hypothetical protein  28.41 
 
 		 371 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169461  normal  0.752301 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0192  protein of unknown function UPF0118  28.14 
 
 		 358 aa  118  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.146754  normal  0.226796 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3648  hypothetical protein  28.12 
 
 		 354 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.505772  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43510  hypothetical protein  28.44 
 
 		 355 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10160  hypothetical protein  28.53 
 
 		 364 aa  114  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.406243  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2549  hypothetical protein  30.55 
 
 		 352 aa  102  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705186  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29820  hypothetical protein  30.23 
 
 		 352 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0125581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2457  hypothetical protein  27.13 
 
 		 362 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4061  hypothetical protein  23.64 
 
 		 351 aa  96.3  7e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2083  hypothetical protein  29.43 
 
 		 356 aa  94  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.251587 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2709  hypothetical protein  23.56 
 
 		 362 aa  91.7  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0297  hypothetical protein  27.13 
 
 		 379 aa  91.3  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0271  hypothetical protein  26.39 
 
 		 379 aa  89.4  1e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2289  hypothetical protein  26.27 
 
 		 353 aa  86.7  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.864507  normal  0.333993 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3492  hypothetical protein  28.18 
 
 		 387 aa  85.9  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.705437  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3950  protein of unknown function UPF0118  25.36 
 
 		 360 aa  85.5  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1830  hypothetical protein  25.99 
 
 		 354 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1855  hypothetical protein  25.45 
 
 		 354 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0258165 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2207  hypothetical protein  25.38 
 
 		 354 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3531  hypothetical protein  25.38 
 
 		 354 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.43917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3980  hypothetical protein  27.44 
 
 		 352 aa  82.4  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0869717 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0826  hypothetical protein  26.2 
 
 		 369 aa  82.4  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.981363  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4130  hypothetical protein  26.4 
 
 		 406 aa  81.3  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.189132  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0529  hypothetical protein  25.82 
 
 		 352 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0540  protein of unknown function UPF0118  27.07 
 
 		 349 aa  80.5  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2209  hypothetical protein  25.8 
 
 		 409 aa  80.5  0.00000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0810  protein of unknown function UPF0118  25.78 
 
 		 351 aa  80.1  0.00000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0661  hypothetical protein  25.78 
 
 		 351 aa  80.1  0.00000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1154  hypothetical protein  25.66 
 
 		 358 aa  79.7  0.00000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000550105  normal  0.0344505 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2015  protein of unknown function UPF0118  24.72 
 
 		 354 aa  79.3  0.00000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000281213 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4411  protein of unknown function UPF0118  25.78 
 
 		 389 aa  79  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0111  hypothetical protein  26.05 
 
 		 391 aa  78.6  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.239724 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2601  hypothetical protein  24.05 
 
 		 352 aa  78.6  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.99204  normal  0.455316 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>