241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2169 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2169  hypothetical protein  100 
 
 
354 aa  689    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.344347  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0862  hypothetical protein  40.18 
 
 
360 aa  248  1e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4608  hypothetical protein  36.99 
 
 
370 aa  244  1.9999999999999999e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.991825  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0593  hypothetical protein  37.18 
 
 
376 aa  238  2e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.356961  normal  0.748294 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3036  protein of unknown function UPF0118  37.05 
 
 
363 aa  228  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3084  protein of unknown function UPF0118  37.05 
 
 
363 aa  228  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6456  hypothetical protein  38.35 
 
 
367 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.267604 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1843  hypothetical protein  38.64 
 
 
383 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0120  hypothetical protein  36.26 
 
 
370 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44170  hypothetical protein  36 
 
 
368 aa  211  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.392978  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1906  membrane protein  38.91 
 
 
353 aa  209  5e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0890459  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1709  hypothetical protein  37.87 
 
 
388 aa  207  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.615575  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1020  membrane protein  37.17 
 
 
355 aa  203  4e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0691  hypothetical protein  36.42 
 
 
377 aa  202  7e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.627447 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2900  hypothetical protein  35.8 
 
 
379 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001141  hypothetical protein  38.51 
 
 
382 aa  200  3.9999999999999996e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2741  hypothetical protein  30.81 
 
 
369 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4349  hypothetical protein  40.3 
 
 
368 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.287718  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06643  hypothetical protein  36.05 
 
 
365 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2819  hypothetical protein  31.09 
 
 
369 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2910  hypothetical protein  29.69 
 
 
369 aa  193  4e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5187  hypothetical protein  34.91 
 
 
381 aa  192  8e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.503723 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0748  hypothetical protein  36.01 
 
 
365 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4043  protein of unknown function UPF0118  33.94 
 
 
385 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0752  hypothetical protein  35.42 
 
 
365 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0379564  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0714  permease  36.01 
 
 
365 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0333328  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4469  hypothetical protein  34.21 
 
 
365 aa  179  7e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0580151  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2029  hypothetical protein  34.27 
 
 
348 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.850073 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3486  hypothetical protein  33.03 
 
 
375 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.12464 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2221  lipoprotein, putative  35.31 
 
 
349 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0102435  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3734  hypothetical protein  34.69 
 
 
350 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1690  putative inner membrane protein  31.12 
 
 
370 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.534784  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4200  hypothetical protein  33.75 
 
 
346 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3487  hypothetical protein  35.94 
 
 
354 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1229  permease  33.24 
 
 
366 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.632798 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1705  hypothetical protein  35.31 
 
 
349 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.873743  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4162  hypothetical protein  35.31 
 
 
350 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2756  putative inner membrane protein  30.95 
 
 
369 aa  164  3e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2454  putative inner membrane protein  30.61 
 
 
395 aa  162  1e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.272244  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2633  hypothetical protein  31.1 
 
 
365 aa  161  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01657  predicted inner membrane protein  31.69 
 
 
370 aa  159  5e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1954  protein of unknown function UPF0118  31.69 
 
 
370 aa  159  5e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.133227  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1889  putative inner membrane protein  31.69 
 
 
370 aa  159  5e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1943  putative inner membrane protein  31.69 
 
 
370 aa  159  5e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000987664 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1769  putative inner membrane protein  31.69 
 
 
370 aa  159  5e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1904  putative inner membrane protein  31.69 
 
 
370 aa  159  5e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2403  putative inner membrane protein  31.69 
 
 
370 aa  159  6e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0340493 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1658  putative inner membrane protein  29.33 
 
 
364 aa  159  7e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1508  putative inner membrane protein  31.69 
 
 
370 aa  159  7e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000188442 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1746  putative inner membrane protein  31.1 
 
 
371 aa  157  3e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00422506 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43510  hypothetical protein  34.7 
 
 
355 aa  156  6e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3648  hypothetical protein  35.02 
 
 
354 aa  156  7e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.505772  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1844  putative inner membrane protein  31.38 
 
 
367 aa  152  5.9999999999999996e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1738  putative inner membrane protein  31.38 
 
 
367 aa  152  5.9999999999999996e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0405  hypothetical protein  32.01 
 
 
374 aa  150  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0582  hypothetical protein  29.76 
 
 
367 aa  150  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0275552  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2597  putative inner membrane protein  31.38 
 
 
365 aa  148  1.0000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2175  hypothetical protein  32.42 
 
 
366 aa  144  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0131226 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2676  hypothetical protein  30.06 
 
 
388 aa  143  6e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5665  hypothetical protein  31.41 
 
 
362 aa  142  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1381  protein of unknown function UPF0118  33.13 
 
 
371 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.0000000171014  decreased coverage  0.00070323 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1808  putative inner membrane protein  31.07 
 
 
372 aa  140  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1979  putative inner membrane protein  31.07 
 
 
372 aa  139  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.591827  hitchhiker  0.00000561887 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1476  putative inner membrane protein  31.07 
 
 
372 aa  139  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.655079  hitchhiker  0.000276 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1495  putative inner membrane protein  31.07 
 
 
372 aa  139  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138717 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1460  putative inner membrane protein  31.07 
 
 
372 aa  139  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.539422  normal  0.149027 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10160  hypothetical protein  34.38 
 
 
364 aa  139  7e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.406243  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3398  hypothetical protein  28.79 
 
 
360 aa  132  6.999999999999999e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2457  hypothetical protein  34.69 
 
 
362 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3174  hypothetical protein  32.51 
 
 
371 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169461  normal  0.752301 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1973  hypothetical protein  32.27 
 
 
382 aa  124  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000012652  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1686  hypothetical protein  29.2 
 
 
390 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0192  protein of unknown function UPF0118  29.39 
 
 
358 aa  112  7.000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.146754  normal  0.226796 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4061  hypothetical protein  28.36 
 
 
351 aa  109  7.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0268  protein of unknown function UPF0118  24.85 
 
 
363 aa  103  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29820  hypothetical protein  28.15 
 
 
352 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0125581  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2601  hypothetical protein  28.09 
 
 
352 aa  97.4  3e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.99204  normal  0.455316 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1578  protein of unknown function UPF0118  24.54 
 
 
373 aa  97.4  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.373133  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2083  hypothetical protein  26.89 
 
 
356 aa  92.8  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.251587 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2549  hypothetical protein  26.82 
 
 
352 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705186  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0338  hypothetical protein  26.45 
 
 
365 aa  90.9  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88474  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0549  protein of unknown function UPF0118  26.73 
 
 
384 aa  89.4  8e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0941477  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2709  hypothetical protein  24.26 
 
 
362 aa  89  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2289  hypothetical protein  27.73 
 
 
353 aa  86.7  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.864507  normal  0.333993 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3492  hypothetical protein  26.42 
 
 
387 aa  85.9  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.705437  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7289  hypothetical protein  27.54 
 
 
353 aa  84.7  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2209  hypothetical protein  23.73 
 
 
409 aa  84.7  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0152  putative lipoprotein  24.64 
 
 
361 aa  85.1  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4931  hypothetical protein  26.06 
 
 
351 aa  84  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0271  hypothetical protein  23.16 
 
 
379 aa  83.6  0.000000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2098  hypothetical protein  25.07 
 
 
368 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4053  hypothetical protein  29.27 
 
 
361 aa  82  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.920687 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0826  hypothetical protein  24.92 
 
 
369 aa  81.6  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.981363  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0783  hypothetical protein  26.61 
 
 
353 aa  81.3  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3427  hypothetical protein  25.3 
 
 
355 aa  80.9  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1830  hypothetical protein  25.77 
 
 
354 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0987  hypothetical protein  25 
 
 
394 aa  79.7  0.00000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.89372 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3531  hypothetical protein  25.77 
 
 
354 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.43917  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3551  hypothetical protein  23.74 
 
 
364 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2425  hypothetical protein  25.68 
 
 
363 aa  79.7  0.00000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>