More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1275 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1275  hypothetical protein  100 
 
 		 354 aa  695    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5011  protein of unknown function UPF0118  39.7 
 
 		 359 aa  212  7e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.022243  normal  0.128908 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2037  protein of unknown function UPF0118  35.45 
 
 		 405 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0579571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4551  hypothetical protein  39.39 
 
 		 359 aa  211  1e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0235388 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3044  hypothetical protein  35.88 
 
 		 398 aa  210  3e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5064  protein of unknown function UPF0118  40.37 
 
 		 359 aa  209  4e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.949113 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1838  protein of unknown function UPF0118  34.87 
 
 		 398 aa  209  7e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00200619  normal  0.0419691 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4064  permease  34.28 
 
 		 349 aa  207  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5018  hypothetical protein  37.89 
 
 		 372 aa  206  3e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.454575  normal  0.302548 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0111  hypothetical protein  34.28 
 
 		 391 aa  207  3e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.239724 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3672  hypothetical protein  33.82 
 
 		 396 aa  202  5e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00326083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4321  hypothetical protein  35.2 
 
 		 380 aa  202  6e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0949244  normal  0.333615 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0215  hypothetical protein  34.38 
 
 		 406 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.776259 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1564  putative transmembrane transport protein  34.38 
 
 		 406 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3243  hypothetical protein  35 
 
 		 356 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.340258  normal  0.654322 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4274  hypothetical protein  35.31 
 
 		 356 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.444788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3296  protein of unknown function UPF0118  32.76 
 
 		 381 aa  194  2e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.854034  normal  0.185219 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3551  hypothetical protein  34.1 
 
 		 364 aa  192  7e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4853  hypothetical protein  39.64 
 
 		 361 aa  192  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.197887 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0477  hypothetical protein  34.52 
 
 		 368 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1735  hypothetical protein  35.28 
 
 		 356 aa  189  5e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.661691  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0472  hypothetical protein  33.93 
 
 		 373 aa  189  8e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0479  hypothetical protein  33.72 
 
 		 372 aa  189  8e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3370  hypothetical protein  34.12 
 
 		 360 aa  187  3e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1067  hypothetical protein  35.09 
 
 		 356 aa  186  5e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4008  hypothetical protein  33.33 
 
 		 360 aa  186  6e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3812  protein of unknown function UPF0118  33.33 
 
 		 356 aa  186  6e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0447  hypothetical protein  33.33 
 
 		 360 aa  186  7e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3886  hypothetical protein  33.33 
 
 		 359 aa  186  8e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2299  hypothetical protein  35.09 
 
 		 356 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0984  hypothetical protein  35.09 
 
 		 356 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0268  protein of unknown function UPF0118  33.23 
 
 		 363 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1484  hypothetical protein  35.09 
 
 		 356 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0518  hypothetical protein  35.09 
 
 		 356 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0130  hypothetical protein  35.09 
 
 		 356 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1401  hypothetical protein  35.09 
 
 		 356 aa  184  3e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1696  hypothetical protein  36.34 
 
 		 391 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.551892  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1702  hypothetical protein  36.5 
 
 		 360 aa  181  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.221894  normal  0.568838 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3280  hypothetical protein  33.72 
 
 		 361 aa  181  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.300759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4180  hypothetical protein  34.98 
 
 		 356 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.664917 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3702  hypothetical protein  34.67 
 
 		 356 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4945  protein of unknown function UPF0118  36.2 
 
 		 360 aa  177  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0255148  normal  0.175503 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0767  hypothetical protein  34.15 
 
 		 350 aa  177  3e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1869  protein of unknown function UPF0118  39.39 
 
 		 363 aa  171  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1578  protein of unknown function UPF0118  32.21 
 
 		 373 aa  170  4e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.373133  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0297  hypothetical protein  31.45 
 
 		 379 aa  166  5.9999999999999996e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.738414 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0796  hypothetical protein  34.78 
 
 		 350 aa  164  3e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0271  hypothetical protein  31.09 
 
 		 379 aa  163  3e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2209  hypothetical protein  32.65 
 
 		 409 aa  162  6e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2601  hypothetical protein  33.03 
 
 		 352 aa  157  3e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.99204  normal  0.455316 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2098  hypothetical protein  33.33 
 
 		 368 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2709  hypothetical protein  28.61 
 
 		 362 aa  150  3e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0013  hypothetical protein  35.29 
 
 		 363 aa  144  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00247664 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0810  protein of unknown function UPF0118  31.78 
 
 		 351 aa  143  4e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0661  hypothetical protein  31.78 
 
 		 351 aa  143  4e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2147  hypothetical protein  34.23 
 
 		 357 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4092  permease-like  32.26 
 
 		 385 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.322579  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2029  hypothetical protein  29.94 
 
 		 348 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.850073 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2221  lipoprotein, putative  29 
 
 		 349 aa  122  8e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0102435  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4200  hypothetical protein  28.79 
 
 		 346 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0582  hypothetical protein  28.29 
 
 		 367 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0275552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1705  hypothetical protein  28.1 
 
 		 349 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.873743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3492  hypothetical protein  29.29 
 
 		 387 aa  116  6e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.705437  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4162  hypothetical protein  28.05 
 
 		 350 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3487  hypothetical protein  28.66 
 
 		 354 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3734  hypothetical protein  28.05 
 
 		 350 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2676  hypothetical protein  27.91 
 
 		 388 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1154  hypothetical protein  27.62 
 
 		 358 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000550105  normal  0.0344505 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0783  hypothetical protein  26.35 
 
 		 353 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4026  hypothetical protein  28.18 
 
 		 360 aa  112  7.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0192  protein of unknown function UPF0118  29.61 
 
 		 358 aa  110  3e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.146754  normal  0.226796 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3189  protein of unknown function UPF0118  26.85 
 
 		 361 aa  108  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000846761  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2212  protein of unknown function UPF0118  28.61 
 
 		 355 aa  107  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000181482  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1973  hypothetical protein  27.13 
 
 		 382 aa  104  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000012652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3398  hypothetical protein  26.82 
 
 		 360 aa  104  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1381  protein of unknown function UPF0118  26.79 
 
 		 371 aa  104  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.0000000171014  decreased coverage  0.00070323 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4988  hypothetical protein  29.3 
 
 		 347 aa  103  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4061  hypothetical protein  27.38 
 
 		 351 aa  102  8e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1102  protein of unknown function UPF0118  28.2 
 
 		 346 aa  102  9e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0988  hypothetical protein  28.2 
 
 		 346 aa  102  9e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.500729  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0987  hypothetical protein  26.22 
 
 		 394 aa  102  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.89372 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2083  hypothetical protein  27.6 
 
 		 356 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.251587 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2633  hypothetical protein  26.67 
 
 		 365 aa  100  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2457  hypothetical protein  30.42 
 
 		 362 aa  100  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3980  hypothetical protein  26.09 
 
 		 352 aa  99.8  7e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0869717 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3648  hypothetical protein  31.95 
 
 		 354 aa  99.8  7e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.505772  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3174  hypothetical protein  27.38 
 
 		 371 aa  99.8  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169461  normal  0.752301 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29820  hypothetical protein  26.76 
 
 		 352 aa  99.4  8e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0125581  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3950  protein of unknown function UPF0118  26.49 
 
 		 360 aa  96.7  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1690  putative inner membrane protein  25.59 
 
 		 370 aa  94  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.534784  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1844  putative inner membrane protein  25.96 
 
 		 367 aa  94  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1738  putative inner membrane protein  25.96 
 
 		 367 aa  94  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2868  hypothetical protein  26.42 
 
 		 358 aa  94  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838475  normal  0.0422213 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2597  putative inner membrane protein  26.69 
 
 		 365 aa  94  4e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3531  hypothetical protein  25.28 
 
 		 354 aa  94  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.43917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7289  hypothetical protein  28 
 
 		 353 aa  93.2  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2015  protein of unknown function UPF0118  28.03 
 
 		 354 aa  93.2  6e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000281213 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1907  protein of unknown function UPF0118  31.22 
 
 		 352 aa  93.2  6e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43510  hypothetical protein  30.12 
 
 		 355 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1821  hypothetical protein  31.22 
 
 		 381 aa  93.2  7e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.693161 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>