253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_1732 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_1732  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 
355 aa  679    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000390095  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4026  hypothetical protein  29.04 
 
 
360 aa  128  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1102  hypothetical protein  31.74 
 
 
365 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00400546  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1154  hypothetical protein  31.29 
 
 
358 aa  124  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000550105  normal  0.0344505 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0783  hypothetical protein  32.28 
 
 
353 aa  119  7e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2573  membrane protein  26.99 
 
 
361 aa  114  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0854  membrane protein  42.17 
 
 
363 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0563046  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2083  hypothetical protein  31.29 
 
 
356 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.251587 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1578  protein of unknown function UPF0118  32.53 
 
 
373 aa  110  5e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.373133  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0810  protein of unknown function UPF0118  32.35 
 
 
351 aa  109  6e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0661  hypothetical protein  32.35 
 
 
351 aa  109  6e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0020  hypothetical protein  28.68 
 
 
358 aa  108  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11000  hypothetical protein  28.96 
 
 
346 aa  107  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3378  hypothetical protein  28.03 
 
 
354 aa  107  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2425  hypothetical protein  31.44 
 
 
363 aa  106  5e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4731  hypothetical protein  33.33 
 
 
359 aa  105  8e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.226742  hitchhiker  0.00240822 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0152  putative lipoprotein  35.48 
 
 
361 aa  103  3e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1830  hypothetical protein  29.47 
 
 
354 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3210  hypothetical protein  27.59 
 
 
354 aa  103  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.212604 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3717  hypothetical protein  28.94 
 
 
353 aa  103  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396811  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2207  hypothetical protein  31.5 
 
 
354 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3531  hypothetical protein  31.96 
 
 
354 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.43917  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0560  protein of unknown function UPF0118  30.21 
 
 
339 aa  102  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1855  hypothetical protein  29.75 
 
 
354 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0258165 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1950  protein of unknown function UPF0118  26.72 
 
 
346 aa  102  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.863146  normal  0.537489 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2229  hypothetical protein  33.33 
 
 
392 aa  100  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0292  hypothetical protein  26.76 
 
 
391 aa  100  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0268  protein of unknown function UPF0118  31.37 
 
 
363 aa  99.4  8e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002589  predicted permease  29.97 
 
 
361 aa  99.4  9e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00334796  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0987  hypothetical protein  27.91 
 
 
394 aa  98.6  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.89372 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03420  hypothetical protein  39.42 
 
 
361 aa  97.4  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0901  protein of unknown function UPF0118  27.44 
 
 
365 aa  97.4  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2998  hypothetical protein  36.36 
 
 
359 aa  97.1  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4411  protein of unknown function UPF0118  26.97 
 
 
389 aa  96.3  6e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3189  protein of unknown function UPF0118  34.83 
 
 
361 aa  96.3  7e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000846761  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3980  hypothetical protein  28.24 
 
 
352 aa  96.3  8e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0869717 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2448  hypothetical protein  29.94 
 
 
415 aa  95.5  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0466557  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2868  hypothetical protein  35.19 
 
 
358 aa  95.5  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838475  normal  0.0422213 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3082  protein of unknown function UPF0118  37.5 
 
 
397 aa  95.1  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1267  protein of unknown function UPF0118  30.91 
 
 
371 aa  95.1  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0792338  normal  0.0741439 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0338  hypothetical protein  27.57 
 
 
365 aa  95.1  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88474  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2311  protein of unknown function UPF0118  28.1 
 
 
393 aa  94  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1226  hypothetical protein  29.35 
 
 
352 aa  93.6  5e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4130  hypothetical protein  26.73 
 
 
406 aa  93.2  6e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.189132  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2549  hypothetical protein  25.74 
 
 
352 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705186  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1653  hypothetical protein  28.66 
 
 
362 aa  92  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.212682  normal  0.81767 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2679  hypothetical protein  36.31 
 
 
352 aa  92  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0689913  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0488  hypothetical protein  32.11 
 
 
371 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.131577  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3492  hypothetical protein  28.24 
 
 
387 aa  91.3  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.705437  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0192  protein of unknown function UPF0118  39.74 
 
 
358 aa  90.5  4e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.146754  normal  0.226796 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3950  protein of unknown function UPF0118  28.28 
 
 
360 aa  90.1  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0826  hypothetical protein  30.21 
 
 
369 aa  90.1  6e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.981363  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4988  hypothetical protein  26.26 
 
 
347 aa  89.7  6e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0737  hypothetical protein  29.47 
 
 
356 aa  89.7  7e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.203827  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0549  protein of unknown function UPF0118  31.18 
 
 
384 aa  89.7  8e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0941477  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29820  hypothetical protein  25.74 
 
 
352 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0125581  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0937  PerM family permease  30 
 
 
374 aa  89  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2289  hypothetical protein  26.4 
 
 
353 aa  89  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.864507  normal  0.333993 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2709  hypothetical protein  32.63 
 
 
362 aa  87.8  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0253  hypothetical protein  30 
 
 
352 aa  88.6  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.077494  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1436  hypothetical protein  30 
 
 
352 aa  88.6  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1633  hypothetical protein  30 
 
 
352 aa  88.6  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2642  hypothetical protein  30 
 
 
352 aa  88.6  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00776691  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2503  hypothetical protein  30 
 
 
352 aa  88.6  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0289  hypothetical protein  30 
 
 
352 aa  88.6  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.700262  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0529  hypothetical protein  29.47 
 
 
352 aa  87.8  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5533  hypothetical protein  30.32 
 
 
355 aa  87.8  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3708  hypothetical protein  28.51 
 
 
355 aa  87.4  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.168874 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4931  hypothetical protein  32.22 
 
 
351 aa  86.7  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2050  hypothetical protein  26.82 
 
 
373 aa  85.9  9e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4556  hypothetical protein  29.26 
 
 
398 aa  85.9  9e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.173549  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3807  hypothetical protein  29.26 
 
 
353 aa  85.9  9e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.911463  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0271  hypothetical protein  26.77 
 
 
379 aa  85.9  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3717  hypothetical protein  29.26 
 
 
350 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0661403  normal  0.22421 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4053  hypothetical protein  30 
 
 
361 aa  85.5  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.920687 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2015  protein of unknown function UPF0118  27.33 
 
 
354 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000281213 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1907  protein of unknown function UPF0118  27 
 
 
352 aa  85.1  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0338  protein of unknown function UPF0118  32.69 
 
 
363 aa  85.1  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0916  protein of unknown function UPF0118  27.67 
 
 
355 aa  85.1  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.116301  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2209  hypothetical protein  26.84 
 
 
409 aa  85.1  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1821  hypothetical protein  27 
 
 
381 aa  85.1  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.693161 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0540  protein of unknown function UPF0118  30.82 
 
 
349 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2610  protein of unknown function UPF0118  32.25 
 
 
370 aa  84.3  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2958  protein of unknown function UPF0118  36.23 
 
 
339 aa  84.3  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1707  protein of unknown function UPF0118  35.91 
 
 
504 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1300  protein of unknown function UPF0118  28.57 
 
 
345 aa  83.2  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.316018  normal  0.608638 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2676  hypothetical protein  36.87 
 
 
388 aa  83.2  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2012  protein of unknown function UPF0118  30.77 
 
 
363 aa  82.8  0.000000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.578603 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1042  protein of unknown function UPF0118  32.83 
 
 
368 aa  82.8  0.000000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.840746  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0582  hypothetical protein  34.64 
 
 
367 aa  82.8  0.000000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0275552  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3734  hypothetical protein  29.03 
 
 
350 aa  82.8  0.000000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3487  hypothetical protein  31.88 
 
 
354 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4931  hypothetical protein  29.21 
 
 
353 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.850306  normal  0.602485 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4162  hypothetical protein  27.25 
 
 
350 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1381  protein of unknown function UPF0118  36.62 
 
 
371 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.0000000171014  decreased coverage  0.00070323 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0472  acid membrane antigen A  24 
 
 
367 aa  81.6  0.00000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3249  hypothetical protein  30.59 
 
 
350 aa  81.6  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.691639  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1705  hypothetical protein  27.41 
 
 
349 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.873743  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1868  hypothetical protein  35.67 
 
 
399 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0467497  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0203  hypothetical protein  26.79 
 
 
362 aa  80.1  0.00000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>