More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_2958 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_2958  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 
339 aa  646    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0560  protein of unknown function UPF0118  62.69 
 
 
339 aa  434  1e-120  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2610  protein of unknown function UPF0118  42.11 
 
 
370 aa  225  8e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1950  protein of unknown function UPF0118  35.55 
 
 
346 aa  221  9.999999999999999e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.863146  normal  0.537489 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2311  protein of unknown function UPF0118  38.3 
 
 
393 aa  209  4e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0940  protein of unknown function UPF0118  35.58 
 
 
345 aa  200  3e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.726387  normal  0.96935 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1111  protein of unknown function UPF0118  39.75 
 
 
381 aa  181  1e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0398  protein of unknown function UPF0118  35.78 
 
 
425 aa  166  8e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.0034127  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2012  protein of unknown function UPF0118  30.54 
 
 
363 aa  153  4e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.578603 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0901  protein of unknown function UPF0118  27.27 
 
 
365 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0292  hypothetical protein  26.57 
 
 
391 aa  137  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2238  protein of unknown function UPF0118  29.72 
 
 
379 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.605073  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0549  protein of unknown function UPF0118  30 
 
 
384 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0941477  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2083  hypothetical protein  28.99 
 
 
356 aa  136  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.251587 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3492  hypothetical protein  27.84 
 
 
387 aa  134  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.705437  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2050  hypothetical protein  26.04 
 
 
373 aa  134  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0737  hypothetical protein  27.49 
 
 
356 aa  133  5e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.203827  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4931  hypothetical protein  30.92 
 
 
351 aa  132  9e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0338  hypothetical protein  28.32 
 
 
365 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88474  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2207  hypothetical protein  26.15 
 
 
354 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2425  hypothetical protein  27.86 
 
 
363 aa  129  6e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1563  hypothetical protein  29.34 
 
 
398 aa  129  8.000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.78708  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29820  hypothetical protein  27.71 
 
 
352 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0125581  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2181  protein of unknown function UPF0118  30.72 
 
 
376 aa  129  9.000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00612132  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3531  hypothetical protein  25.54 
 
 
354 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.43917  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11000  hypothetical protein  27.16 
 
 
346 aa  128  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2448  hypothetical protein  28.83 
 
 
415 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0466557  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4988  hypothetical protein  29.91 
 
 
347 aa  128  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1102  hypothetical protein  28.88 
 
 
365 aa  127  3e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00400546  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0338  protein of unknown function UPF0118  29.94 
 
 
363 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2573  membrane protein  28.69 
 
 
361 aa  126  4.0000000000000003e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1855  hypothetical protein  26.36 
 
 
354 aa  126  7e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0258165 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0488  hypothetical protein  30.09 
 
 
371 aa  125  7e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.131577  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3980  hypothetical protein  28.91 
 
 
352 aa  125  8.000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0869717 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0826  hypothetical protein  24.5 
 
 
369 aa  125  9e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.981363  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3378  hypothetical protein  26.43 
 
 
354 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2289  hypothetical protein  27.85 
 
 
353 aa  125  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.864507  normal  0.333993 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2549  hypothetical protein  27.39 
 
 
352 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705186  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3210  hypothetical protein  26.3 
 
 
354 aa  124  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.212604 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0152  putative lipoprotein  28.21 
 
 
361 aa  124  3e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1830  hypothetical protein  26.62 
 
 
354 aa  123  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0987  hypothetical protein  26.1 
 
 
394 aa  122  8e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.89372 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4411  protein of unknown function UPF0118  25.5 
 
 
389 aa  121  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4130  hypothetical protein  25 
 
 
406 aa  122  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.189132  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1226  hypothetical protein  26.5 
 
 
352 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3427  hypothetical protein  30.64 
 
 
355 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2229  hypothetical protein  27.41 
 
 
392 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0783  hypothetical protein  26.91 
 
 
353 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3249  hypothetical protein  30.83 
 
 
350 aa  119  7e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.691639  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3082  protein of unknown function UPF0118  28.87 
 
 
397 aa  119  7e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1653  hypothetical protein  29.24 
 
 
362 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.212682  normal  0.81767 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3717  hypothetical protein  26.3 
 
 
353 aa  119  9e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396811  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3950  protein of unknown function UPF0118  28.16 
 
 
360 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4053  hypothetical protein  29.39 
 
 
361 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.920687 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5533  hypothetical protein  28.21 
 
 
355 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0540  protein of unknown function UPF0118  27.53 
 
 
349 aa  117  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3717  hypothetical protein  27.56 
 
 
350 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0661403  normal  0.22421 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0491  hypothetical protein  28.06 
 
 
359 aa  117  3e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000229793  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0020  hypothetical protein  29.77 
 
 
358 aa  117  3e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3807  hypothetical protein  27.56 
 
 
353 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.911463  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0203  hypothetical protein  28 
 
 
362 aa  116  5e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4556  hypothetical protein  27.56 
 
 
398 aa  116  5e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.173549  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3708  hypothetical protein  27.88 
 
 
355 aa  116  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.168874 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0529  hypothetical protein  27.24 
 
 
352 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2413  hypothetical protein  25.15 
 
 
345 aa  115  7.999999999999999e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.480547  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13258  putative transmembrane protein  27.39 
 
 
339 aa  115  2.0000000000000002e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0792  protein of unknown function UPF0118  27 
 
 
344 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.101192 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0460  hypothetical protein  30.38 
 
 
352 aa  114  3e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.353952  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0400  hypothetical protein  30.38 
 
 
372 aa  114  3e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.413713  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1907  protein of unknown function UPF0118  31.88 
 
 
352 aa  114  3e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1821  hypothetical protein  31.88 
 
 
381 aa  114  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.693161 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2503  hypothetical protein  27.56 
 
 
352 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0289  hypothetical protein  27.56 
 
 
352 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.700262  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2642  hypothetical protein  27.56 
 
 
352 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00776691  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0253  hypothetical protein  27.56 
 
 
352 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.077494  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1633  hypothetical protein  27.56 
 
 
352 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1436  hypothetical protein  27.56 
 
 
352 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0937  PerM family permease  27.56 
 
 
374 aa  113  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0661  hypothetical protein  28.23 
 
 
351 aa  112  6e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0262  hypothetical protein  24.62 
 
 
334 aa  112  6e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00766044 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0810  protein of unknown function UPF0118  28.23 
 
 
351 aa  112  6e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4026  hypothetical protein  23.77 
 
 
360 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1868  hypothetical protein  28.7 
 
 
399 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0467497  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1154  hypothetical protein  25.51 
 
 
358 aa  109  6e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000550105  normal  0.0344505 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4931  hypothetical protein  29.69 
 
 
353 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.850306  normal  0.602485 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2868  hypothetical protein  26.44 
 
 
358 aa  109  8.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838475  normal  0.0422213 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1300  protein of unknown function UPF0118  25.81 
 
 
345 aa  108  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.316018  normal  0.608638 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2836  hypothetical protein  29.63 
 
 
352 aa  107  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.93454  normal  0.972453 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0228  hypothetical protein  28.93 
 
 
356 aa  107  4e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2369  hypothetical protein  28.28 
 
 
357 aa  107  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00120754  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7289  hypothetical protein  28.87 
 
 
353 aa  106  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1267  protein of unknown function UPF0118  27.38 
 
 
371 aa  106  7e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0792338  normal  0.0741439 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2764  hypothetical protein  27.16 
 
 
346 aa  105  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.327799  normal  0.0566584 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4731  hypothetical protein  26.73 
 
 
359 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.226742  hitchhiker  0.00240822 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2069  hypothetical protein  27.47 
 
 
391 aa  105  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0264155 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1639  hypothetical protein  23.42 
 
 
334 aa  103  3e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0916  protein of unknown function UPF0118  22.46 
 
 
355 aa  103  3e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.116301  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0854  membrane protein  26.35 
 
 
363 aa  102  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0563046  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0268  protein of unknown function UPF0118  26.63 
 
 
363 aa  102  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002589  predicted permease  27.89 
 
 
361 aa  101  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00334796  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>