More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4645 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2069  hypothetical protein  81.77 
 
 
391 aa  643    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0264155 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4645  hypothetical protein  100 
 
 
396 aa  777    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4349  hypothetical protein  56.3 
 
 
400 aa  432  1e-120  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.632987  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4118  hypothetical protein  56.3 
 
 
400 aa  434  1e-120  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00655828  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4193  hypothetical protein  56.3 
 
 
400 aa  434  1e-120  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.662681  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11122  hypothetical protein  51.91 
 
 
385 aa  382  1e-105  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0292  hypothetical protein  26.12 
 
 
391 aa  127  4.0000000000000003e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0549  protein of unknown function UPF0118  27.64 
 
 
384 aa  111  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0941477  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0826  hypothetical protein  27.17 
 
 
369 aa  108  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.981363  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2012  protein of unknown function UPF0118  25.58 
 
 
363 aa  107  3e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.578603 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4130  hypothetical protein  27.15 
 
 
406 aa  106  8e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.189132  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4411  protein of unknown function UPF0118  26.68 
 
 
389 aa  105  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0152  putative lipoprotein  25.34 
 
 
361 aa  102  8e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2311  protein of unknown function UPF0118  27.11 
 
 
393 aa  102  9e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0338  hypothetical protein  28.11 
 
 
365 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88474  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2448  hypothetical protein  25.38 
 
 
415 aa  99.4  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0466557  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0488  hypothetical protein  27.3 
 
 
371 aa  99  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.131577  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11000  hypothetical protein  27.83 
 
 
346 aa  99  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2413  hypothetical protein  27.63 
 
 
345 aa  98.2  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.480547  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2573  membrane protein  23.88 
 
 
361 aa  98.2  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0560  protein of unknown function UPF0118  26.8 
 
 
339 aa  97.1  5e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2868  hypothetical protein  28.03 
 
 
358 aa  95.9  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838475  normal  0.0422213 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0336  hypothetical protein  25.08 
 
 
372 aa  95.9  1e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000639163  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0987  hypothetical protein  24.92 
 
 
394 aa  95.5  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.89372 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3492  hypothetical protein  26.76 
 
 
387 aa  95.1  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.705437  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2083  hypothetical protein  25.43 
 
 
356 aa  95.1  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.251587 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3950  protein of unknown function UPF0118  26.32 
 
 
360 aa  94.4  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4931  hypothetical protein  28.24 
 
 
351 aa  94.4  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1563  hypothetical protein  24.85 
 
 
398 aa  94  4e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.78708  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3531  hypothetical protein  28.45 
 
 
354 aa  93.2  7e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.43917  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2289  hypothetical protein  26.84 
 
 
353 aa  92.8  9e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.864507  normal  0.333993 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1950  protein of unknown function UPF0118  25.07 
 
 
346 aa  91.7  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.863146  normal  0.537489 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0529  hypothetical protein  27.85 
 
 
352 aa  91.3  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0540  protein of unknown function UPF0118  26.3 
 
 
349 aa  91.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29820  hypothetical protein  25.77 
 
 
352 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0125581  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2425  hypothetical protein  28.38 
 
 
363 aa  91.7  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2238  protein of unknown function UPF0118  30.29 
 
 
379 aa  92  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.605073  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2610  protein of unknown function UPF0118  25.91 
 
 
370 aa  90.9  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2549  hypothetical protein  25.77 
 
 
352 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705186  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2207  hypothetical protein  27.15 
 
 
354 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0937  PerM family permease  26.43 
 
 
374 aa  90.9  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0491  hypothetical protein  26.86 
 
 
359 aa  90.1  6e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000229793  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2642  hypothetical protein  27.04 
 
 
352 aa  89.7  7e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00776691  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1633  hypothetical protein  27.04 
 
 
352 aa  89.7  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0253  hypothetical protein  27.04 
 
 
352 aa  89.7  7e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.077494  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0289  hypothetical protein  27.04 
 
 
352 aa  89.7  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.700262  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1855  hypothetical protein  25.42 
 
 
354 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0258165 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2503  hypothetical protein  27.04 
 
 
352 aa  89.7  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1436  hypothetical protein  27.04 
 
 
352 aa  89.7  7e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0916  protein of unknown function UPF0118  21.98 
 
 
355 aa  89.7  8e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.116301  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0203  hypothetical protein  27.12 
 
 
362 aa  89.4  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1830  hypothetical protein  28.45 
 
 
354 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2050  hypothetical protein  26.61 
 
 
373 aa  88.2  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4556  hypothetical protein  28.51 
 
 
398 aa  87.4  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.173549  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2709  hypothetical protein  24 
 
 
362 aa  87  5e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2958  protein of unknown function UPF0118  27.8 
 
 
339 aa  87  5e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0020  hypothetical protein  25.23 
 
 
358 aa  87  5e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5533  hypothetical protein  28.95 
 
 
355 aa  87  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3708  hypothetical protein  28.95 
 
 
355 aa  86.7  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.168874 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0901  protein of unknown function UPF0118  25.83 
 
 
365 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3717  hypothetical protein  28.57 
 
 
350 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0661403  normal  0.22421 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3082  protein of unknown function UPF0118  24.62 
 
 
397 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0338  protein of unknown function UPF0118  25.36 
 
 
363 aa  85.5  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3807  hypothetical protein  28.57 
 
 
353 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.911463  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1907  protein of unknown function UPF0118  26.9 
 
 
352 aa  84  0.000000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3980  hypothetical protein  25 
 
 
352 aa  84  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0869717 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4026  hypothetical protein  26.27 
 
 
360 aa  84  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1821  hypothetical protein  26.9 
 
 
381 aa  83.6  0.000000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.693161 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1226  hypothetical protein  26.54 
 
 
352 aa  83.2  0.000000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3210  hypothetical protein  26.5 
 
 
354 aa  82.8  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.212604 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0810  protein of unknown function UPF0118  28.22 
 
 
351 aa  82.8  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0661  hypothetical protein  28.22 
 
 
351 aa  82.8  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4988  hypothetical protein  25.76 
 
 
347 aa  82.4  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0228  hypothetical protein  27.08 
 
 
356 aa  81.3  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0940  protein of unknown function UPF0118  26.37 
 
 
345 aa  81.3  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.726387  normal  0.96935 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13258  putative transmembrane protein  27.46 
 
 
339 aa  80.9  0.00000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1578  protein of unknown function UPF0118  26.8 
 
 
373 aa  80.9  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.373133  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3249  hypothetical protein  26 
 
 
350 aa  80.1  0.00000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.691639  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0276  protein of unknown function UPF0118  24.37 
 
 
423 aa  79.7  0.00000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.133789  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4931  hypothetical protein  28.42 
 
 
353 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.850306  normal  0.602485 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1555  hypothetical protein  28.51 
 
 
347 aa  79.3  0.0000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3378  hypothetical protein  25.58 
 
 
354 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2181  protein of unknown function UPF0118  24.79 
 
 
376 aa  79.3  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00612132  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1300  protein of unknown function UPF0118  24.47 
 
 
345 aa  78.2  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.316018  normal  0.608638 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0286  hypothetical protein  28.51 
 
 
347 aa  78.6  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4053  hypothetical protein  24.86 
 
 
361 aa  78.2  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.920687 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1365  hypothetical protein  28.51 
 
 
347 aa  79  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0737  hypothetical protein  28.02 
 
 
356 aa  78.2  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.203827  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3717  hypothetical protein  26.98 
 
 
353 aa  76.6  0.0000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396811  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2369  hypothetical protein  26.2 
 
 
357 aa  76.3  0.0000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00120754  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002589  predicted permease  25.34 
 
 
361 aa  76.3  0.0000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00334796  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4731  hypothetical protein  26.62 
 
 
359 aa  75.9  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.226742  hitchhiker  0.00240822 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0738  acid membrane antigen A  24.01 
 
 
352 aa  75.9  0.000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.444287  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3734  hypothetical protein  27.71 
 
 
350 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7289  hypothetical protein  25.7 
 
 
353 aa  75.5  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1111  protein of unknown function UPF0118  24.92 
 
 
381 aa  74.3  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0399  protein of unknown function UPF0118  25.94 
 
 
346 aa  73.9  0.000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2294  hypothetical protein  27.2 
 
 
360 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1102  hypothetical protein  27.65 
 
 
365 aa  74.3  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00400546  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3427  hypothetical protein  24.57 
 
 
355 aa  73.6  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>