241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0738 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0738  acid membrane antigen A  100 
 
 
352 aa  690    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.444287  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0472  acid membrane antigen A  49.55 
 
 
367 aa  344  1e-93  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1276  acid membrane antigen A  47.97 
 
 
347 aa  329  4e-89  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1921  acid membrane antigen A  48.25 
 
 
348 aa  329  5.0000000000000004e-89  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1555  hypothetical protein  50.79 
 
 
347 aa  321  9.999999999999999e-87  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1365  hypothetical protein  50.79 
 
 
347 aa  321  9.999999999999999e-87  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0286  hypothetical protein  49.84 
 
 
347 aa  318  7.999999999999999e-86  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0381  hypothetical protein  49.23 
 
 
346 aa  309  4e-83  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.519933  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0399  protein of unknown function UPF0118  43.84 
 
 
346 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1677  hypothetical protein  37.88 
 
 
330 aa  231  2e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.696772  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1219  protein of unknown function UPF0118  30.59 
 
 
355 aa  137  2e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000032504  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2083  hypothetical protein  25.43 
 
 
356 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.251587 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1154  hypothetical protein  25.42 
 
 
358 aa  102  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000550105  normal  0.0344505 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29820  hypothetical protein  21.74 
 
 
352 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0125581  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0491  hypothetical protein  26.13 
 
 
359 aa  97.8  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000229793  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11000  hypothetical protein  24.71 
 
 
346 aa  97.8  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2549  hypothetical protein  22.54 
 
 
352 aa  96.7  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705186  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3492  hypothetical protein  22.94 
 
 
387 aa  94.7  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.705437  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0783  hypothetical protein  25.9 
 
 
353 aa  95.1  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0560  protein of unknown function UPF0118  23.94 
 
 
339 aa  95.1  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3717  hypothetical protein  25.45 
 
 
353 aa  92.4  9e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396811  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2238  protein of unknown function UPF0118  31.03 
 
 
379 aa  90.9  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.605073  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0152  putative lipoprotein  28.81 
 
 
361 aa  90.9  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1267  protein of unknown function UPF0118  22.19 
 
 
371 aa  90.9  3e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0792338  normal  0.0741439 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2012  protein of unknown function UPF0118  30.32 
 
 
363 aa  90.9  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.578603 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3082  protein of unknown function UPF0118  30.29 
 
 
397 aa  90.5  4e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0549  protein of unknown function UPF0118  22.62 
 
 
384 aa  90.5  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0941477  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0826  hypothetical protein  26.6 
 
 
369 aa  89.7  7e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.981363  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2425  hypothetical protein  25.86 
 
 
363 aa  89.7  7e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1830  hypothetical protein  23.58 
 
 
354 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0336  hypothetical protein  28.05 
 
 
372 aa  87.8  2e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000639163  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1855  hypothetical protein  23.4 
 
 
354 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0258165 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3531  hypothetical protein  23.28 
 
 
354 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.43917  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1226  hypothetical protein  26.87 
 
 
352 aa  87.4  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2573  membrane protein  27.43 
 
 
361 aa  87.8  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0338  protein of unknown function UPF0118  22.45 
 
 
363 aa  87.4  4e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0292  hypothetical protein  22.5 
 
 
391 aa  87.4  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2050  hypothetical protein  24.55 
 
 
373 aa  86.7  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0338  hypothetical protein  22.69 
 
 
365 aa  86.7  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88474  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3950  protein of unknown function UPF0118  21.7 
 
 
360 aa  86.3  7e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7289  hypothetical protein  24.86 
 
 
353 aa  86.3  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2709  hypothetical protein  24.47 
 
 
362 aa  86.3  8e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0488  hypothetical protein  24.64 
 
 
371 aa  86.3  8e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.131577  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0916  protein of unknown function UPF0118  25.56 
 
 
355 aa  85.9  9e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.116301  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0854  membrane protein  27.49 
 
 
363 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0563046  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2207  hypothetical protein  22.99 
 
 
354 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2289  hypothetical protein  21.43 
 
 
353 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.864507  normal  0.333993 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2448  hypothetical protein  26.7 
 
 
415 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0466557  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1563  hypothetical protein  25.36 
 
 
398 aa  84.3  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.78708  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2416  protein of unknown function UPF0118  29.95 
 
 
378 aa  85.1  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.25064  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0901  protein of unknown function UPF0118  23.81 
 
 
365 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3708  hypothetical protein  25.62 
 
 
355 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.168874 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3210  hypothetical protein  23.41 
 
 
354 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.212604 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1653  hypothetical protein  24.02 
 
 
362 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.212682  normal  0.81767 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4026  hypothetical protein  27.66 
 
 
360 aa  84  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5533  hypothetical protein  25.62 
 
 
355 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3189  protein of unknown function UPF0118  24.49 
 
 
361 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000846761  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2868  hypothetical protein  21.73 
 
 
358 aa  83.6  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838475  normal  0.0422213 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3378  hypothetical protein  22.81 
 
 
354 aa  83.2  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3980  hypothetical protein  22.7 
 
 
352 aa  83.2  0.000000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0869717 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4411  protein of unknown function UPF0118  23.58 
 
 
389 aa  82  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1102  hypothetical protein  24.76 
 
 
365 aa  82  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00400546  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4130  hypothetical protein  23.9 
 
 
406 aa  82.4  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.189132  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4731  hypothetical protein  22.63 
 
 
359 aa  81.6  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.226742  hitchhiker  0.00240822 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1950  protein of unknown function UPF0118  21.8 
 
 
346 aa  80.5  0.00000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.863146  normal  0.537489 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0020  hypothetical protein  25.29 
 
 
358 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4349  hypothetical protein  24 
 
 
400 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.632987  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3717  hypothetical protein  24.56 
 
 
350 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0661403  normal  0.22421 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4556  hypothetical protein  24.56 
 
 
398 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.173549  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3807  hypothetical protein  24.56 
 
 
353 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.911463  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4118  hypothetical protein  24 
 
 
400 aa  79.7  0.00000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00655828  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4193  hypothetical protein  24 
 
 
400 aa  79.7  0.00000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.662681  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0987  hypothetical protein  22.71 
 
 
394 aa  79.7  0.00000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.89372 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4931  hypothetical protein  23.02 
 
 
353 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.850306  normal  0.602485 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4053  hypothetical protein  21.69 
 
 
361 aa  79.3  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.920687 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4988  hypothetical protein  21.49 
 
 
347 aa  79  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2679  hypothetical protein  24.27 
 
 
352 aa  79  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0689913  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2676  hypothetical protein  23.26 
 
 
388 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0268  protein of unknown function UPF0118  22.32 
 
 
363 aa  77.8  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2294  hypothetical protein  22.15 
 
 
360 aa  77  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1907  protein of unknown function UPF0118  24.52 
 
 
352 aa  77  0.0000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1868  hypothetical protein  30.06 
 
 
399 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0467497  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0540  protein of unknown function UPF0118  22.58 
 
 
349 aa  76.3  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1821  hypothetical protein  23.67 
 
 
381 aa  76.3  0.0000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.693161 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2958  protein of unknown function UPF0118  23.02 
 
 
339 aa  76.3  0.0000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4931  hypothetical protein  20.83 
 
 
351 aa  76.3  0.0000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0785  hypothetical protein  26.6 
 
 
363 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0785663 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0661  hypothetical protein  22.22 
 
 
351 aa  75.5  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1300  protein of unknown function UPF0118  23.21 
 
 
345 aa  75.9  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.316018  normal  0.608638 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0810  protein of unknown function UPF0118  22.22 
 
 
351 aa  75.5  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2601  hypothetical protein  21.41 
 
 
352 aa  74.7  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.99204  normal  0.455316 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1881  hypothetical protein  25.69 
 
 
367 aa  74.7  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000322257  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2181  protein of unknown function UPF0118  22.79 
 
 
376 aa  74.7  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00612132  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3181  hypothetical protein  24.26 
 
 
419 aa  74.3  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.423402  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03420  hypothetical protein  27.66 
 
 
361 aa  73.9  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0582  hypothetical protein  22.56 
 
 
367 aa  73.9  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0275552  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1578  protein of unknown function UPF0118  20.53 
 
 
373 aa  73.9  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.373133  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0276  protein of unknown function UPF0118  25.93 
 
 
423 aa  73.9  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.133789  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0253  hypothetical protein  23.72 
 
 
352 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.077494  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0937  PerM family permease  23.72 
 
 
374 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>