256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1881 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1881  hypothetical protein  100 
 
 		 367 aa  731    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000322257  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0152  putative lipoprotein  26.72 
 
 		 361 aa  124  4e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2289  hypothetical protein  23.18 
 
 		 353 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.864507  normal  0.333993 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2573  membrane protein  27.35 
 
 		 361 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3492  hypothetical protein  25.76 
 
 		 387 aa  114  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.705437  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3950  protein of unknown function UPF0118  26.7 
 
 		 360 aa  113  7.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0540  protein of unknown function UPF0118  24.93 
 
 		 349 aa  113  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0292  hypothetical protein  26.3 
 
 		 391 aa  112  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2083  hypothetical protein  24.39 
 
 		 356 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.251587 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0987  hypothetical protein  26.82 
 
 		 394 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.89372 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0783  hypothetical protein  26.86 
 
 		 353 aa  110  5e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0488  hypothetical protein  26.23 
 
 		 371 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.131577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5533  hypothetical protein  25.47 
 
 		 355 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3708  hypothetical protein  25.27 
 
 		 355 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.168874 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0338  hypothetical protein  25.68 
 
 		 365 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88474  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0491  hypothetical protein  24.73 
 
 		 359 aa  107  4e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000229793  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1267  protein of unknown function UPF0118  25.92 
 
 		 371 aa  106  5e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0792338  normal  0.0741439 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3717  hypothetical protein  24.73 
 
 		 350 aa  106  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0661403  normal  0.22421 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3807  hypothetical protein  24.73 
 
 		 353 aa  106  6e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.911463  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11000  hypothetical protein  24.59 
 
 		 346 aa  106  8e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1154  hypothetical protein  25 
 
 		 358 aa  105  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000550105  normal  0.0344505 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4556  hypothetical protein  24.59 
 
 		 398 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.173549  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0472  acid membrane antigen A  25.8 
 
 		 367 aa  105  1e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1276  acid membrane antigen A  26.55 
 
 		 347 aa  104  2e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2425  hypothetical protein  24.79 
 
 		 363 aa  104  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29820  hypothetical protein  25.48 
 
 		 352 aa  103  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0125581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0737  hypothetical protein  27.22 
 
 		 356 aa  102  7e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.203827  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2549  hypothetical protein  25.21 
 
 		 352 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705186  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0826  hypothetical protein  25.33 
 
 		 369 aa  101  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.981363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2448  hypothetical protein  23.85 
 
 		 415 aa  101  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0466557  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4053  hypothetical protein  28.49 
 
 		 361 aa  101  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.920687 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0399  protein of unknown function UPF0118  24.92 
 
 		 346 aa  101  2e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3082  protein of unknown function UPF0118  26.67 
 
 		 397 aa  101  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002589  predicted permease  27.6 
 
 		 361 aa  101  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00334796  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4026  hypothetical protein  28.17 
 
 		 360 aa  100  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0549  protein of unknown function UPF0118  25.93 
 
 		 384 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0941477  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1226  hypothetical protein  26.19 
 
 		 352 aa  100  5e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4931  hypothetical protein  23.97 
 
 		 353 aa  99.8  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.850306  normal  0.602485 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2012  protein of unknown function UPF0118  26.65 
 
 		 363 aa  99.8  7e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.578603 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2181  protein of unknown function UPF0118  26.96 
 
 		 376 aa  99  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00612132  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3980  hypothetical protein  26.76 
 
 		 352 aa  98.6  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0869717 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1677  hypothetical protein  25.07 
 
 		 330 aa  98.2  2e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.696772  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0276  protein of unknown function UPF0118  24.78 
 
 		 423 aa  97.1  4e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.133789  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4731  hypothetical protein  25.89 
 
 		 359 aa  97.1  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.226742  hitchhiker  0.00240822 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4988  hypothetical protein  25.07 
 
 		 347 aa  97.1  5e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1102  hypothetical protein  25.44 
 
 		 365 aa  95.9  9e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00400546  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3717  hypothetical protein  24.93 
 
 		 353 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396811  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0020  hypothetical protein  24.86 
 
 		 358 aa  95.9  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3427  hypothetical protein  25.41 
 
 		 355 aa  94.7  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2015  protein of unknown function UPF0118  25.92 
 
 		 354 aa  94.7  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000281213 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2207  hypothetical protein  24.73 
 
 		 354 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2212  protein of unknown function UPF0118  25 
 
 		 355 aa  94.4  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000181482  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3249  hypothetical protein  31.08 
 
 		 350 aa  94.4  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.691639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1219  protein of unknown function UPF0118  25.75 
 
 		 355 aa  94  4e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000032504  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3531  hypothetical protein  24.38 
 
 		 354 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.43917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1907  protein of unknown function UPF0118  29.95 
 
 		 352 aa  93.2  6e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2998  hypothetical protein  25.88 
 
 		 359 aa  93.2  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0529  hypothetical protein  22.13 
 
 		 352 aa  92.8  9e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0738  acid membrane antigen A  25.69 
 
 		 352 aa  92  1e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.444287  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0854  membrane protein  26.19 
 
 		 363 aa  92  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0563046  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03420  hypothetical protein  27.14 
 
 		 361 aa  92.4  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1921  acid membrane antigen A  26.33 
 
 		 348 aa  92  1e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1821  hypothetical protein  29.47 
 
 		 381 aa  92.4  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.693161 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4931  hypothetical protein  25.21 
 
 		 351 aa  91.7  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3189  protein of unknown function UPF0118  25.66 
 
 		 361 aa  91.7  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000846761  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2413  hypothetical protein  23.22 
 
 		 345 aa  91.7  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.480547  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0268  protein of unknown function UPF0118  22.51 
 
 		 363 aa  92  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4411  protein of unknown function UPF0118  23.77 
 
 		 389 aa  91.7  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4130  hypothetical protein  23.84 
 
 		 406 aa  90.9  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.189132  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0937  PerM family permease  22.16 
 
 		 374 aa  90.5  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0253  hypothetical protein  22 
 
 		 352 aa  90.1  5e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.077494  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0289  hypothetical protein  22 
 
 		 352 aa  90.1  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.700262  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2503  hypothetical protein  22 
 
 		 352 aa  90.1  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1436  hypothetical protein  22 
 
 		 352 aa  90.1  5e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1633  hypothetical protein  22 
 
 		 352 aa  90.1  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2642  hypothetical protein  22 
 
 		 352 aa  90.1  5e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00776691  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1855  hypothetical protein  23.3 
 
 		 354 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0258165 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0203  hypothetical protein  28.21 
 
 		 362 aa  89.7  7e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3210  hypothetical protein  23.77 
 
 		 354 aa  89.7  8e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.212604 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2294  hypothetical protein  27.97 
 
 		 360 aa  89.4  8e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1830  hypothetical protein  23.32 
 
 		 354 aa  89.7  8e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0940  protein of unknown function UPF0118  23.74 
 
 		 345 aa  89.4  9e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.726387  normal  0.96935 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3378  hypothetical protein  24.93 
 
 		 354 aa  89.4  9e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7289  hypothetical protein  23.77 
 
 		 353 aa  89.4  9e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1555  hypothetical protein  23.64 
 
 		 347 aa  89  1e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0901  protein of unknown function UPF0118  25 
 
 		 365 aa  89  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1563  hypothetical protein  26.57 
 
 		 398 aa  89.4  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.78708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0286  hypothetical protein  23.17 
 
 		 347 aa  88.6  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1365  hypothetical protein  23.6 
 
 		 347 aa  88.6  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2311  protein of unknown function UPF0118  25.56 
 
 		 393 aa  88.2  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2029  hypothetical protein  27.11 
 
 		 348 aa  87  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.850073 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2238  protein of unknown function UPF0118  27.51 
 
 		 379 aa  85.9  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.605073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0792  protein of unknown function UPF0118  26.21 
 
 		 344 aa  85.9  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.101192 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2868  hypothetical protein  23.28 
 
 		 358 aa  85.9  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838475  normal  0.0422213 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1578  protein of unknown function UPF0118  20.68 
 
 		 373 aa  85.9  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.373133  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0661  hypothetical protein  26.35 
 
 		 351 aa  85.1  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0810  protein of unknown function UPF0118  26.35 
 
 		 351 aa  85.1  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0338  protein of unknown function UPF0118  25.71 
 
 		 363 aa  84  0.000000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1732  protein of unknown function UPF0118  25.86 
 
 		 355 aa  83.6  0.000000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000390095  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2709  hypothetical protein  22.64 
 
 		 362 aa  83.2  0.000000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>