201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1921 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1921  acid membrane antigen A  100 
 
 
348 aa  666    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0381  hypothetical protein  69.57 
 
 
346 aa  456  1e-127  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.519933  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1276  acid membrane antigen A  57.35 
 
 
347 aa  394  1e-108  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1555  hypothetical protein  58.49 
 
 
347 aa  372  1e-102  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0286  hypothetical protein  57.86 
 
 
347 aa  370  1e-101  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1365  hypothetical protein  58.18 
 
 
347 aa  370  1e-101  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0472  acid membrane antigen A  51.52 
 
 
367 aa  331  1e-89  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0738  acid membrane antigen A  48.25 
 
 
352 aa  329  5.0000000000000004e-89  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.444287  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0399  protein of unknown function UPF0118  49.52 
 
 
346 aa  300  2e-80  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1677  hypothetical protein  45.51 
 
 
330 aa  253  3e-66  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.696772  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1219  protein of unknown function UPF0118  31.1 
 
 
355 aa  139  4.999999999999999e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000032504  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0901  protein of unknown function UPF0118  25.53 
 
 
365 aa  107  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2549  hypothetical protein  24.4 
 
 
352 aa  107  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705186  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29820  hypothetical protein  24.11 
 
 
352 aa  105  9e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0125581  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3980  hypothetical protein  25.23 
 
 
352 aa  105  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0869717 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2425  hypothetical protein  27.27 
 
 
363 aa  104  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2289  hypothetical protein  23.4 
 
 
353 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.864507  normal  0.333993 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0152  putative lipoprotein  27.59 
 
 
361 aa  101  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0987  hypothetical protein  26.24 
 
 
394 aa  100  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.89372 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3492  hypothetical protein  25.93 
 
 
387 aa  99.4  8e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.705437  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11000  hypothetical protein  24.79 
 
 
346 aa  98.6  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3210  hypothetical protein  24.4 
 
 
354 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.212604 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4931  hypothetical protein  25.87 
 
 
353 aa  97.1  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.850306  normal  0.602485 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7289  hypothetical protein  23.5 
 
 
353 aa  97.1  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0529  hypothetical protein  23.31 
 
 
352 aa  96.7  5e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3807  hypothetical protein  23.46 
 
 
353 aa  96.3  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.911463  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3378  hypothetical protein  25.38 
 
 
354 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4556  hypothetical protein  23.46 
 
 
398 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.173549  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3717  hypothetical protein  23.46 
 
 
350 aa  95.9  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0661403  normal  0.22421 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3717  hypothetical protein  24.27 
 
 
353 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396811  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0253  hypothetical protein  23.6 
 
 
352 aa  94  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.077494  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1226  hypothetical protein  24.2 
 
 
352 aa  94  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1436  hypothetical protein  23.6 
 
 
352 aa  94  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1633  hypothetical protein  23.6 
 
 
352 aa  94  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2642  hypothetical protein  23.6 
 
 
352 aa  94  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00776691  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2503  hypothetical protein  23.6 
 
 
352 aa  94  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0289  hypothetical protein  23.6 
 
 
352 aa  94  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.700262  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0937  PerM family permease  23.6 
 
 
374 aa  93.6  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0338  hypothetical protein  24.85 
 
 
365 aa  94  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88474  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5533  hypothetical protein  22.63 
 
 
355 aa  94  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3708  hypothetical protein  22.63 
 
 
355 aa  93.6  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.168874 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1102  hypothetical protein  25.72 
 
 
365 aa  93.2  6e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00400546  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3531  hypothetical protein  23.17 
 
 
354 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.43917  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0540  protein of unknown function UPF0118  23.31 
 
 
349 aa  92  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2207  hypothetical protein  23.17 
 
 
354 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0549  protein of unknown function UPF0118  21.51 
 
 
384 aa  91.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0941477  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1907  protein of unknown function UPF0118  25.23 
 
 
352 aa  90.1  5e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1821  hypothetical protein  25.23 
 
 
381 aa  89.7  6e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.693161 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3082  protein of unknown function UPF0118  31.79 
 
 
397 aa  89  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2083  hypothetical protein  23.75 
 
 
356 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.251587 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3249  hypothetical protein  25.64 
 
 
350 aa  87.8  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.691639  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1830  hypothetical protein  22.35 
 
 
354 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0292  hypothetical protein  25.56 
 
 
391 aa  87.4  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4053  hypothetical protein  24.3 
 
 
361 aa  86.7  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.920687 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3950  protein of unknown function UPF0118  24.1 
 
 
360 aa  85.9  9e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2012  protein of unknown function UPF0118  27.79 
 
 
363 aa  85.1  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.578603 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1267  protein of unknown function UPF0118  22.12 
 
 
371 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0792338  normal  0.0741439 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1855  hypothetical protein  22.58 
 
 
354 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0258165 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2709  hypothetical protein  26.63 
 
 
362 aa  84.3  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2573  membrane protein  25.76 
 
 
361 aa  84.3  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4026  hypothetical protein  26.53 
 
 
360 aa  84  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0338  protein of unknown function UPF0118  26.13 
 
 
363 aa  83.2  0.000000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0020  hypothetical protein  25.48 
 
 
358 aa  83.2  0.000000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0488  hypothetical protein  24.76 
 
 
371 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.131577  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3189  protein of unknown function UPF0118  25.97 
 
 
361 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000846761  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0737  hypothetical protein  27.18 
 
 
356 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.203827  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1881  hypothetical protein  25.56 
 
 
367 aa  80.9  0.00000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000322257  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002589  predicted permease  26.02 
 
 
361 aa  80.5  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00334796  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0491  hypothetical protein  26.96 
 
 
359 aa  80.1  0.00000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000229793  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4988  hypothetical protein  22.42 
 
 
347 aa  79.7  0.00000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03420  hypothetical protein  25 
 
 
361 aa  79.3  0.00000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1653  hypothetical protein  24.1 
 
 
362 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.212682  normal  0.81767 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2238  protein of unknown function UPF0118  30.67 
 
 
379 aa  77.4  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.605073  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2601  hypothetical protein  28.17 
 
 
352 aa  77.4  0.0000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.99204  normal  0.455316 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0560  protein of unknown function UPF0118  24.48 
 
 
339 aa  76.3  0.0000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1300  protein of unknown function UPF0118  23.03 
 
 
345 aa  76.3  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.316018  normal  0.608638 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4931  hypothetical protein  25.07 
 
 
351 aa  75.9  0.0000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3427  hypothetical protein  22.96 
 
 
355 aa  74.3  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2868  hypothetical protein  26.92 
 
 
358 aa  73.9  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838475  normal  0.0422213 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2050  hypothetical protein  23.36 
 
 
373 aa  73.6  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4130  hypothetical protein  25.36 
 
 
406 aa  73.9  0.000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.189132  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2679  hypothetical protein  25 
 
 
352 aa  73.9  0.000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0689913  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1154  hypothetical protein  24.78 
 
 
358 aa  73.2  0.000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000550105  normal  0.0344505 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0810  protein of unknown function UPF0118  26.65 
 
 
351 aa  72.4  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2448  hypothetical protein  28.12 
 
 
415 aa  72.4  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0466557  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0661  hypothetical protein  26.65 
 
 
351 aa  72.4  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2416  protein of unknown function UPF0118  25.21 
 
 
378 aa  72  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.25064  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4411  protein of unknown function UPF0118  24.93 
 
 
389 aa  72  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4731  hypothetical protein  23.61 
 
 
359 aa  71.2  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.226742  hitchhiker  0.00240822 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0785  hypothetical protein  25.35 
 
 
363 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0785663 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0582  hypothetical protein  23.2 
 
 
367 aa  70.5  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0275552  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0336  hypothetical protein  28.25 
 
 
372 aa  70.1  0.00000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000639163  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11122  hypothetical protein  27.36 
 
 
385 aa  69.7  0.00000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2764  hypothetical protein  24.14 
 
 
346 aa  68.9  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.327799  normal  0.0566584 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2998  hypothetical protein  28.05 
 
 
359 aa  68.9  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3181  hypothetical protein  20.12 
 
 
419 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.423402  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0826  hypothetical protein  26.67 
 
 
369 aa  67.8  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.981363  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0203  hypothetical protein  25.6 
 
 
362 aa  67.4  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1868  hypothetical protein  30.06 
 
 
399 aa  67.8  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0467497  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0783  hypothetical protein  25.81 
 
 
353 aa  66.6  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>