228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1677 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1677  hypothetical protein  100 
 
 		 330 aa  646    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.696772  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1921  acid membrane antigen A  45.51 
 
 		 348 aa  253  3e-66  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0399  protein of unknown function UPF0118  45.34 
 
 		 346 aa  251  8.000000000000001e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1276  acid membrane antigen A  40.57 
 
 		 347 aa  243  3e-63  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0738  acid membrane antigen A  37.88 
 
 		 352 aa  231  2e-59  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.444287  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0286  hypothetical protein  39.68 
 
 		 347 aa  227  2e-58  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1365  hypothetical protein  39.68 
 
 		 347 aa  226  3e-58  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1555  hypothetical protein  39.68 
 
 		 347 aa  226  5.0000000000000005e-58  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0472  acid membrane antigen A  39.69 
 
 		 367 aa  225  7e-58  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0381  hypothetical protein  41.69 
 
 		 346 aa  213  3.9999999999999995e-54  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.519933  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1219  protein of unknown function UPF0118  32.54 
 
 		 355 aa  139  6e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000032504  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0152  putative lipoprotein  29.41 
 
 		 361 aa  119  7e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002589  predicted permease  29.53 
 
 		 361 aa  103  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00334796  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2573  membrane protein  27.14 
 
 		 361 aa  103  4e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0549  protein of unknown function UPF0118  24.13 
 
 		 384 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0941477  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03420  hypothetical protein  27.68 
 
 		 361 aa  96.3  6e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0488  hypothetical protein  27.75 
 
 		 371 aa  95.5  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.131577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0292  hypothetical protein  24.13 
 
 		 391 aa  95.5  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4411  protein of unknown function UPF0118  25.44 
 
 		 389 aa  95.9  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4130  hypothetical protein  25.15 
 
 		 406 aa  95.1  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.189132  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3082  protein of unknown function UPF0118  29.83 
 
 		 397 aa  93.2  5e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0338  protein of unknown function UPF0118  26.41 
 
 		 363 aa  91.3  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2012  protein of unknown function UPF0118  25.74 
 
 		 363 aa  90.9  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.578603 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0826  hypothetical protein  24.4 
 
 		 369 aa  90.9  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.981363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1102  hypothetical protein  31.76 
 
 		 365 aa  88.6  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00400546  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2676  hypothetical protein  28.57 
 
 		 388 aa  87.8  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0491  hypothetical protein  27.2 
 
 		 359 aa  88.2  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000229793  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3492  hypothetical protein  26.46 
 
 		 387 aa  87.8  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.705437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2448  hypothetical protein  29.44 
 
 		 415 aa  88.2  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0466557  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0020  hypothetical protein  25.5 
 
 		 358 aa  87.8  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0203  hypothetical protein  29.52 
 
 		 362 aa  87.4  3e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0338  hypothetical protein  22.51 
 
 		 365 aa  87.8  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88474  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29820  hypothetical protein  23.89 
 
 		 352 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0125581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1881  hypothetical protein  25.07 
 
 		 367 aa  85.9  9e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000322257  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2549  hypothetical protein  24.63 
 
 		 352 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705186  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4931  hypothetical protein  26.34 
 
 		 353 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.850306  normal  0.602485 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2083  hypothetical protein  22.51 
 
 		 356 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.251587 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5533  hypothetical protein  26.98 
 
 		 355 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0916  protein of unknown function UPF0118  26.41 
 
 		 355 aa  83.2  0.000000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.116301  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3708  hypothetical protein  26.98 
 
 		 355 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.168874 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2425  hypothetical protein  27.81 
 
 		 363 aa  82.8  0.000000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4026  hypothetical protein  22.99 
 
 		 360 aa  82.8  0.000000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2289  hypothetical protein  24.19 
 
 		 353 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.864507  normal  0.333993 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4556  hypothetical protein  26.64 
 
 		 398 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.173549  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3807  hypothetical protein  26.64 
 
 		 353 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.911463  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3717  hypothetical protein  26.64 
 
 		 350 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0661403  normal  0.22421 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1907  protein of unknown function UPF0118  25 
 
 		 352 aa  81.3  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2238  protein of unknown function UPF0118  31.52 
 
 		 379 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.605073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0901  protein of unknown function UPF0118  26.75 
 
 		 365 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1821  hypothetical protein  25 
 
 		 381 aa  81.3  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.693161 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1154  hypothetical protein  23.93 
 
 		 358 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000550105  normal  0.0344505 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1868  hypothetical protein  26.26 
 
 		 399 aa  80.1  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0467497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0582  hypothetical protein  24.86 
 
 		 367 aa  79.3  0.00000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0275552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2294  hypothetical protein  35.29 
 
 		 360 aa  79  0.00000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0737  hypothetical protein  28.78 
 
 		 356 aa  78.6  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.203827  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0529  hypothetical protein  22.78 
 
 		 352 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7289  hypothetical protein  22.77 
 
 		 353 aa  78.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0987  hypothetical protein  23.48 
 
 		 394 aa  79  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.89372 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3249  hypothetical protein  26.34 
 
 		 350 aa  77.4  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.691639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2050  hypothetical protein  22.96 
 
 		 373 aa  77  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0937  PerM family permease  25.73 
 
 		 374 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1300  protein of unknown function UPF0118  25.11 
 
 		 345 aa  76.6  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.316018  normal  0.608638 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4988  hypothetical protein  24.47 
 
 		 347 aa  77  0.0000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0540  protein of unknown function UPF0118  26.2 
 
 		 349 aa  76.6  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0253  hypothetical protein  25.73 
 
 		 352 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.077494  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0810  protein of unknown function UPF0118  23.91 
 
 		 351 aa  76.3  0.0000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1436  hypothetical protein  25.73 
 
 		 352 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1633  hypothetical protein  25.73 
 
 		 352 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2642  hypothetical protein  25.73 
 
 		 352 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00776691  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2503  hypothetical protein  25.73 
 
 		 352 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0289  hypothetical protein  25.73 
 
 		 352 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.700262  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0661  hypothetical protein  23.91 
 
 		 351 aa  76.3  0.0000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2998  hypothetical protein  26.47 
 
 		 359 aa  75.1  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0783  hypothetical protein  26.6 
 
 		 353 aa  74.7  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3980  hypothetical protein  21.88 
 
 		 352 aa  74.7  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0869717 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1707  protein of unknown function UPF0118  26.01 
 
 		 504 aa  73.9  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2868  hypothetical protein  24.73 
 
 		 358 aa  74.3  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838475  normal  0.0422213 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1226  hypothetical protein  26.37 
 
 		 352 aa  73.2  0.000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4053  hypothetical protein  22.71 
 
 		 361 aa  72.8  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.920687 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0560  protein of unknown function UPF0118  21.52 
 
 		 339 aa  72  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1671  hypothetical protein  26.7 
 
 		 334 aa  72.4  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2029  hypothetical protein  25.14 
 
 		 348 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.850073 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2958  protein of unknown function UPF0118  23.46 
 
 		 339 aa  71.6  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1563  hypothetical protein  24.55 
 
 		 398 aa  71.6  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.78708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4731  hypothetical protein  23.72 
 
 		 359 aa  71.2  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.226742  hitchhiker  0.00240822 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3950  protein of unknown function UPF0118  25.53 
 
 		 360 aa  70.9  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2416  protein of unknown function UPF0118  24.09 
 
 		 378 aa  70.1  0.00000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.25064  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3717  hypothetical protein  22.3 
 
 		 353 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396811  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2311  protein of unknown function UPF0118  28.18 
 
 		 393 aa  68.2  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3210  hypothetical protein  20.76 
 
 		 354 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.212604 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11000  hypothetical protein  21.57 
 
 		 346 aa  67.8  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3181  hypothetical protein  24.75 
 
 		 419 aa  67  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.423402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1653  hypothetical protein  25 
 
 		 362 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.212682  normal  0.81767 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3378  hypothetical protein  23.74 
 
 		 354 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1381  protein of unknown function UPF0118  29.95 
 
 		 371 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.0000000171014  decreased coverage  0.00070323 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0276  protein of unknown function UPF0118  21.43 
 
 		 423 aa  65.9  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.133789  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1950  protein of unknown function UPF0118  23.3 
 
 		 346 aa  65.1  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.863146  normal  0.537489 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2679  hypothetical protein  23.96 
 
 		 352 aa  65.5  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0689913  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2709  hypothetical protein  22.32 
 
 		 362 aa  64.7  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2221  lipoprotein, putative  25.61 
 
 		 349 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0102435  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>