More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0276 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0276  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 		 423 aa  842    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.133789  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2012  protein of unknown function UPF0118  29.3 
 
 		 363 aa  141  1.9999999999999998e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.578603 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0203  hypothetical protein  28.53 
 
 		 362 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2181  protein of unknown function UPF0118  28.48 
 
 		 376 aa  126  9e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00612132  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2207  hypothetical protein  28.2 
 
 		 354 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3531  hypothetical protein  27.62 
 
 		 354 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.43917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0783  hypothetical protein  26.11 
 
 		 353 aa  123  6e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2573  membrane protein  26.15 
 
 		 361 aa  123  7e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0987  hypothetical protein  27.25 
 
 		 394 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.89372 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2238  protein of unknown function UPF0118  27.07 
 
 		 379 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.605073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3492  hypothetical protein  28.57 
 
 		 387 aa  120  3.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.705437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0292  hypothetical protein  27.01 
 
 		 391 aa  120  3.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0338  protein of unknown function UPF0118  27.27 
 
 		 363 aa  119  7.999999999999999e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4026  hypothetical protein  29.77 
 
 		 360 aa  119  7.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1830  hypothetical protein  27.75 
 
 		 354 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0826  hypothetical protein  25.35 
 
 		 369 aa  117  5e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.981363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29820  hypothetical protein  26.13 
 
 		 352 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0125581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1154  hypothetical protein  25.65 
 
 		 358 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000550105  normal  0.0344505 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3980  hypothetical protein  27.15 
 
 		 352 aa  114  4.0000000000000004e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0869717 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2083  hypothetical protein  25.63 
 
 		 356 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.251587 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2549  hypothetical protein  25.53 
 
 		 352 aa  113  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705186  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0549  protein of unknown function UPF0118  28.25 
 
 		 384 aa  113  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0941477  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1102  hypothetical protein  26.39 
 
 		 365 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00400546  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2289  hypothetical protein  27.16 
 
 		 353 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.864507  normal  0.333993 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0152  putative lipoprotein  26.35 
 
 		 361 aa  112  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2050  hypothetical protein  26.38 
 
 		 373 aa  111  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0491  hypothetical protein  26.9 
 
 		 359 aa  110  5e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000229793  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2868  hypothetical protein  26.63 
 
 		 358 aa  110  6e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838475  normal  0.0422213 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1267  protein of unknown function UPF0118  27.2 
 
 		 371 aa  110  6e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0792338  normal  0.0741439 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1821  hypothetical protein  27.11 
 
 		 381 aa  110  6e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.693161 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2709  hypothetical protein  29.4 
 
 		 362 aa  109  9.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1907  protein of unknown function UPF0118  27.11 
 
 		 352 aa  109  9.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3082  protein of unknown function UPF0118  29.44 
 
 		 397 aa  109  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0854  membrane protein  25.27 
 
 		 363 aa  108  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0563046  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0901  protein of unknown function UPF0118  27.11 
 
 		 365 aa  108  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3717  hypothetical protein  25.35 
 
 		 353 aa  108  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396811  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4411  protein of unknown function UPF0118  26.09 
 
 		 389 aa  108  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1855  hypothetical protein  26.45 
 
 		 354 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0258165 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4130  hypothetical protein  25.21 
 
 		 406 aa  107  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.189132  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3249  hypothetical protein  27.94 
 
 		 350 aa  107  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.691639  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2416  protein of unknown function UPF0118  23.5 
 
 		 378 aa  107  4e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.25064  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0529  hypothetical protein  27.71 
 
 		 352 aa  107  6e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4931  hypothetical protein  26.47 
 
 		 351 aa  106  8e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7289  hypothetical protein  29.33 
 
 		 353 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0937  PerM family permease  27.41 
 
 		 374 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3950  protein of unknown function UPF0118  25.58 
 
 		 360 aa  105  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0338  hypothetical protein  25.8 
 
 		 365 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88474  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4053  hypothetical protein  27.71 
 
 		 361 aa  105  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.920687 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2448  hypothetical protein  23.58 
 
 		 415 aa  104  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0466557  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2425  hypothetical protein  31.05 
 
 		 363 aa  103  5e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0289  hypothetical protein  27.41 
 
 		 352 aa  103  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.700262  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0253  hypothetical protein  27.41 
 
 		 352 aa  103  6e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.077494  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1436  hypothetical protein  27.41 
 
 		 352 aa  103  6e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3210  hypothetical protein  25.44 
 
 		 354 aa  103  6e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.212604 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2503  hypothetical protein  27.41 
 
 		 352 aa  103  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2642  hypothetical protein  27.41 
 
 		 352 aa  103  6e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00776691  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1226  hypothetical protein  24.55 
 
 		 352 aa  103  6e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1633  hypothetical protein  27.41 
 
 		 352 aa  103  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0916  protein of unknown function UPF0118  22.35 
 
 		 355 aa  103  8e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.116301  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2311  protein of unknown function UPF0118  26.16 
 
 		 393 aa  102  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0488  hypothetical protein  31.84 
 
 		 371 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.131577  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0460  hypothetical protein  23.99 
 
 		 352 aa  101  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.353952  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0400  hypothetical protein  23.99 
 
 		 372 aa  101  3e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.413713  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4200  hypothetical protein  24.71 
 
 		 346 aa  100  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2610  protein of unknown function UPF0118  25 
 
 		 370 aa  100  5e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3378  hypothetical protein  25.15 
 
 		 354 aa  100  6e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0020  hypothetical protein  28.1 
 
 		 358 aa  100  6e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0540  protein of unknown function UPF0118  25.9 
 
 		 349 aa  100  6e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11000  hypothetical protein  26.47 
 
 		 346 aa  99.8  8e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4556  hypothetical protein  26.19 
 
 		 398 aa  99.8  8e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.173549  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1653  hypothetical protein  26.41 
 
 		 362 aa  99  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.212682  normal  0.81767 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3734  hypothetical protein  27.3 
 
 		 350 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2294  hypothetical protein  29.1 
 
 		 360 aa  98.2  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3717  hypothetical protein  26.19 
 
 		 350 aa  98.6  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0661403  normal  0.22421 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3807  hypothetical protein  26.19 
 
 		 353 aa  98.6  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.911463  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0810  protein of unknown function UPF0118  26.9 
 
 		 351 aa  97.4  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0661  hypothetical protein  26.9 
 
 		 351 aa  97.4  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3427  hypothetical protein  22.41 
 
 		 355 aa  96.7  7e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5533  hypothetical protein  25.6 
 
 		 355 aa  96.7  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0268  protein of unknown function UPF0118  27.3 
 
 		 363 aa  96.3  9e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2413  hypothetical protein  25.42 
 
 		 345 aa  96.3  9e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.480547  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3189  protein of unknown function UPF0118  29.13 
 
 		 361 aa  95.9  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000846761  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1950  protein of unknown function UPF0118  28.51 
 
 		 346 aa  95.5  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.863146  normal  0.537489 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4988  hypothetical protein  26.45 
 
 		 347 aa  95.9  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3708  hypothetical protein  25.3 
 
 		 355 aa  95.5  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.168874 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1563  hypothetical protein  27.49 
 
 		 398 aa  95.1  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.78708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0785  hypothetical protein  27.63 
 
 		 363 aa  94.4  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0785663 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1300  protein of unknown function UPF0118  28.49 
 
 		 345 aa  94.4  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.316018  normal  0.608638 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3487  hypothetical protein  27.81 
 
 		 354 aa  94.4  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13258  putative transmembrane protein  23.67 
 
 		 339 aa  94  4e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2601  hypothetical protein  26.02 
 
 		 352 aa  93.6  5e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.99204  normal  0.455316 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3181  hypothetical protein  24.64 
 
 		 419 aa  92.4  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.423402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2369  hypothetical protein  25.53 
 
 		 357 aa  92.4  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00120754  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0940  protein of unknown function UPF0118  24.02 
 
 		 345 aa  92  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.726387  normal  0.96935 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0560  protein of unknown function UPF0118  23.87 
 
 		 339 aa  92  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1578  protein of unknown function UPF0118  28.63 
 
 		 373 aa  90.9  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.373133  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1276  acid membrane antigen A  23.4 
 
 		 347 aa  90.9  3e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1868  hypothetical protein  30.46 
 
 		 399 aa  91.3  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0467497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1705  hypothetical protein  26.71 
 
 		 349 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.873743  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4162  hypothetical protein  26.27 
 
 		 350 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>