276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0191 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0191  hypothetical protein  100 
 
 
336 aa  672    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1711  hypothetical protein  88.69 
 
 
336 aa  624  1e-177  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.1929  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0751  hypothetical protein  88.1 
 
 
336 aa  618  1e-176  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0245  hypothetical protein  71.73 
 
 
336 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1639  hypothetical protein  45.02 
 
 
334 aa  314  9.999999999999999e-85  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0262  hypothetical protein  45.32 
 
 
334 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00766044 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0574  hypothetical protein  45.71 
 
 
321 aa  298  6e-80  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.877456  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1671  hypothetical protein  46.18 
 
 
334 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0445  hypothetical protein  39.77 
 
 
393 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000355219  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2944  hypothetical protein  28.43 
 
 
368 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.81591  decreased coverage  0.00297728 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2217  hypothetical protein  25.75 
 
 
351 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.253249  normal  0.0953517 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0372  hypothetical protein  26.2 
 
 
339 aa  113  5e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1326  hypothetical protein  23.87 
 
 
354 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4988  hypothetical protein  26.83 
 
 
347 aa  100  5e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2311  protein of unknown function UPF0118  26.71 
 
 
393 aa  94.4  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0560  protein of unknown function UPF0118  25.3 
 
 
339 aa  94.4  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2207  hypothetical protein  25.07 
 
 
354 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2050  hypothetical protein  26.74 
 
 
373 aa  90.9  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3531  hypothetical protein  25.07 
 
 
354 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.43917  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0614  hypothetical protein  25.93 
 
 
358 aa  89.4  8e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3492  hypothetical protein  26.69 
 
 
387 aa  88.2  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.705437  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1653  hypothetical protein  27.27 
 
 
362 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.212682  normal  0.81767 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1830  hypothetical protein  24.48 
 
 
354 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1855  hypothetical protein  24.48 
 
 
354 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0258165 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3717  hypothetical protein  24.48 
 
 
353 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396811  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2610  protein of unknown function UPF0118  27.1 
 
 
370 aa  83.6  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0901  protein of unknown function UPF0118  24.45 
 
 
365 aa  83.2  0.000000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1821  hypothetical protein  32.4 
 
 
381 aa  83.2  0.000000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.693161 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2212  protein of unknown function UPF0118  27.7 
 
 
355 aa  82.8  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000181482  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1907  protein of unknown function UPF0118  32.4 
 
 
352 aa  82.8  0.000000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4411  protein of unknown function UPF0118  25.86 
 
 
389 aa  82  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0987  hypothetical protein  23.51 
 
 
394 aa  82.4  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.89372 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4130  hypothetical protein  25.84 
 
 
406 aa  81.6  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.189132  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1950  protein of unknown function UPF0118  23.55 
 
 
346 aa  81.6  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.863146  normal  0.537489 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11000  hypothetical protein  26.04 
 
 
346 aa  81.6  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4931  hypothetical protein  25.22 
 
 
351 aa  79.7  0.00000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3980  hypothetical protein  32.62 
 
 
352 aa  79.3  0.00000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0869717 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2425  hypothetical protein  28.41 
 
 
363 aa  79  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3950  protein of unknown function UPF0118  23.3 
 
 
360 aa  77.8  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1581  protein of unknown function UPF0118  28.27 
 
 
341 aa  77.4  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0769558 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3378  hypothetical protein  29.32 
 
 
354 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0697  protein of unknown function UPF0118  24.86 
 
 
368 aa  76.3  0.0000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.612025  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2612  protein of unknown function UPF0118  22.33 
 
 
363 aa  76.3  0.0000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.751344  normal  0.787744 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3210  hypothetical protein  28.27 
 
 
354 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.212604 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2549  hypothetical protein  23.65 
 
 
352 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705186  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0540  protein of unknown function UPF0118  29.57 
 
 
349 aa  75.9  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3708  hypothetical protein  27.42 
 
 
355 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.168874 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1300  protein of unknown function UPF0118  23.69 
 
 
345 aa  75.5  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.316018  normal  0.608638 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2083  hypothetical protein  29.84 
 
 
356 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.251587 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1226  hypothetical protein  30.23 
 
 
352 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29820  hypothetical protein  24.58 
 
 
352 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0125581  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0826  hypothetical protein  24.77 
 
 
369 aa  75.5  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.981363  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1267  protein of unknown function UPF0118  24.78 
 
 
371 aa  74.7  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0792338  normal  0.0741439 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5533  hypothetical protein  27.42 
 
 
355 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0338  hypothetical protein  22.9 
 
 
365 aa  73.6  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88474  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0020  hypothetical protein  25.53 
 
 
358 aa  72.8  0.000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4731  hypothetical protein  26.7 
 
 
359 aa  72.8  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.226742  hitchhiker  0.00240822 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1144  protein of unknown function UPF0118  26.24 
 
 
341 aa  72.8  0.000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.158987  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4053  hypothetical protein  28.41 
 
 
361 aa  72.8  0.000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.920687 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3717  hypothetical protein  26.88 
 
 
350 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0661403  normal  0.22421 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2289  hypothetical protein  26.88 
 
 
353 aa  72  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.864507  normal  0.333993 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3807  hypothetical protein  26.88 
 
 
353 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.911463  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0292  hypothetical protein  23.56 
 
 
391 aa  72.4  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4931  hypothetical protein  27.53 
 
 
353 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.850306  normal  0.602485 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4556  hypothetical protein  27.27 
 
 
398 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.173549  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0276  protein of unknown function UPF0118  25.1 
 
 
423 aa  70.9  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.133789  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1154  hypothetical protein  27.03 
 
 
358 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000550105  normal  0.0344505 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0940  protein of unknown function UPF0118  22.56 
 
 
345 aa  70.1  0.00000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.726387  normal  0.96935 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0529  hypothetical protein  28.88 
 
 
352 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4026  hypothetical protein  23.01 
 
 
360 aa  70.1  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0289  hypothetical protein  28.88 
 
 
352 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.700262  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1633  hypothetical protein  28.88 
 
 
352 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0253  hypothetical protein  28.88 
 
 
352 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.077494  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1436  hypothetical protein  28.88 
 
 
352 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2642  hypothetical protein  28.88 
 
 
352 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00776691  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2503  hypothetical protein  28.88 
 
 
352 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0783  hypothetical protein  23.01 
 
 
353 aa  69.7  0.00000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0937  PerM family permease  28.88 
 
 
374 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2709  hypothetical protein  22.26 
 
 
362 aa  68.2  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2416  protein of unknown function UPF0118  27.22 
 
 
378 aa  66.6  0.0000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.25064  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0398  protein of unknown function UPF0118  24.26 
 
 
425 aa  66.6  0.0000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.0034127  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0737  hypothetical protein  24.78 
 
 
356 aa  66.2  0.0000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.203827  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0549  protein of unknown function UPF0118  22.92 
 
 
384 aa  65.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0941477  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3427  hypothetical protein  22.99 
 
 
355 aa  65.9  0.0000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13258  putative transmembrane protein  23.68 
 
 
339 aa  65.1  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0488  hypothetical protein  22.92 
 
 
371 aa  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.131577  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2958  protein of unknown function UPF0118  27.33 
 
 
339 aa  65.9  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3249  hypothetical protein  28.98 
 
 
350 aa  65.9  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.691639  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1102  hypothetical protein  24.63 
 
 
365 aa  63.2  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00400546  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1040  hypothetical protein  26.48 
 
 
366 aa  63.5  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00428171  unclonable  0.0000000129007 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2012  protein of unknown function UPF0118  25.23 
 
 
363 aa  63.2  0.000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.578603 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0203  hypothetical protein  23.1 
 
 
362 aa  62.4  0.000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2998  hypothetical protein  27.88 
 
 
359 aa  62  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1111  protein of unknown function UPF0118  24.84 
 
 
381 aa  61.6  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3205  sporulation integral membrane protein YtvI  23.6 
 
 
362 aa  61.6  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000954806  hitchhiker  0.000000642415 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2015  protein of unknown function UPF0118  25.83 
 
 
354 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000281213 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0792  protein of unknown function UPF0118  26.29 
 
 
344 aa  61.6  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.101192 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2229  hypothetical protein  22.71 
 
 
392 aa  61.2  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1275  hypothetical protein  22.46 
 
 
354 aa  60.8  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0113  hypothetical protein  23.67 
 
 
346 aa  60.8  0.00000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0968389  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>