90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0697 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0697  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 		 368 aa  715    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.612025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2209  protein of unknown function UPF0118  35.14 
 
 		 393 aa  182  8.000000000000001e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0133966  normal  0.166807 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2094  hypothetical protein  32.16 
 
 		 348 aa  147  3e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0787184  normal  0.014964 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3012  hypothetical protein  27.04 
 
 		 387 aa  133  3.9999999999999996e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1131  permease  38.17 
 
 		 431 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1587  protein of unknown function UPF0118  32.48 
 
 		 363 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0245  hypothetical protein  25.15 
 
 		 336 aa  83.6  0.000000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0191  hypothetical protein  24.86 
 
 		 336 aa  76.3  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1711  hypothetical protein  24.2 
 
 		 336 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.1929  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0574  hypothetical protein  24.38 
 
 		 321 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.877456  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0262  hypothetical protein  22.32 
 
 		 334 aa  72  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00766044 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3181  hypothetical protein  30.53 
 
 		 419 aa  69.3  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.423402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0751  hypothetical protein  24.2 
 
 		 336 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1639  hypothetical protein  24.06 
 
 		 334 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2311  protein of unknown function UPF0118  29.67 
 
 		 393 aa  66.2  0.0000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2212  protein of unknown function UPF0118  26.05 
 
 		 355 aa  65.9  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000181482  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1326  hypothetical protein  28.57 
 
 		 354 aa  63.5  0.000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0445  hypothetical protein  22.64 
 
 		 393 aa  62.8  0.000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000355219  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1671  hypothetical protein  27.33 
 
 		 334 aa  62.4  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0560  protein of unknown function UPF0118  26.19 
 
 		 339 aa  62.8  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0372  hypothetical protein  22.89 
 
 		 339 aa  61.2  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2944  hypothetical protein  24.49 
 
 		 368 aa  60.1  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.81591  decreased coverage  0.00297728 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2644  hypothetical protein  26.02 
 
 		 393 aa  59.3  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0940  protein of unknown function UPF0118  31.05 
 
 		 345 aa  57  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.726387  normal  0.96935 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2868  hypothetical protein  29.59 
 
 		 358 aa  54.7  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838475  normal  0.0422213 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  24.85 
 
 		 351 aa  53.9  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2012  protein of unknown function UPF0118  25.72 
 
 		 363 aa  53.1  0.000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.578603 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0792  protein of unknown function UPF0118  24.45 
 
 		 344 aa  52.8  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.101192 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2217  hypothetical protein  26.26 
 
 		 351 aa  52.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.253249  normal  0.0953517 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1578  protein of unknown function UPF0118  25.27 
 
 		 373 aa  51.6  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.373133  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2425  hypothetical protein  27.01 
 
 		 363 aa  52  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2416  protein of unknown function UPF0118  23.63 
 
 		 378 aa  51.6  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.25064  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2392  hypothetical protein  22.36 
 
 		 349 aa  51.6  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.89361 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3189  protein of unknown function UPF0118  25.23 
 
 		 361 aa  51.2  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000846761  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0268  protein of unknown function UPF0118  23.56 
 
 		 363 aa  51.2  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1732  protein of unknown function UPF0118  26.73 
 
 		 355 aa  50.8  0.00004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000390095  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4026  hypothetical protein  26.32 
 
 		 360 aa  50.1  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3492  hypothetical protein  22.85 
 
 		 387 aa  49.3  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.705437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0823  protein of unknown function UPF0118  23.66 
 
 		 358 aa  48.9  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.74505  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3031  protein of unknown function UPF0118  23.19 
 
 		 377 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0257  response regulator receiver domain-containing protein  24.85 
 
 		 357 aa  49.3  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.492639 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0798  protein of unknown function UPF0118  26.94 
 
 		 380 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2229  hypothetical protein  32.14 
 
 		 392 aa  48.9  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0987  hypothetical protein  21.72 
 
 		 394 aa  49.3  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.89372 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1448  hypothetical protein  22 
 
 		 402 aa  48.5  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000360654  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0399  protein of unknown function UPF0118  24.79 
 
 		 346 aa  48.1  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  22 
 
 		 402 aa  48.5  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0747  hypothetical protein  26.94 
 
 		 381 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.122791  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0398  protein of unknown function UPF0118  25.9 
 
 		 425 aa  47.8  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.0034127  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0854  membrane protein  25.57 
 
 		 363 aa  47.8  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0563046  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0783  hypothetical protein  23.17 
 
 		 353 aa  47  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0020  hypothetical protein  26.98 
 
 		 358 aa  47  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0292  hypothetical protein  25.74 
 
 		 391 aa  46.2  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3102  hypothetical protein  22.44 
 
 		 352 aa  46.2  0.0009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1154  hypothetical protein  23.42 
 
 		 358 aa  45.8  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000550105  normal  0.0344505 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2015  protein of unknown function UPF0118  24.8 
 
 		 354 aa  45.8  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000281213 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1381  protein of unknown function UPF0118  29.08 
 
 		 371 aa  45.8  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.0000000171014  decreased coverage  0.00070323 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3210  hypothetical protein  23.43 
 
 		 354 aa  46.2  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.212604 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1042  protein of unknown function UPF0118  24.31 
 
 		 368 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.840746  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1950  protein of unknown function UPF0118  27.2 
 
 		 346 aa  45.1  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.863146  normal  0.537489 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2029  hypothetical protein  23.34 
 
 		 348 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.850073 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0657  permease  21.95 
 
 		 384 aa  45.1  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.036358  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1990  protein of unknown function UPF0118  22.4 
 
 		 372 aa  45.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3427  hypothetical protein  24.28 
 
 		 355 aa  45.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3378  hypothetical protein  23.43 
 
 		 354 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2709  hypothetical protein  28.12 
 
 		 362 aa  44.3  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2601  hypothetical protein  25.14 
 
 		 352 aa  44.3  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.99204  normal  0.455316 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  22.27 
 
 		 405 aa  44.7  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2818  hypothetical protein  20.69 
 
 		 363 aa  43.9  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1102  hypothetical protein  25.86 
 
 		 365 aa  43.9  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00400546  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4200  hypothetical protein  21.49 
 
 		 346 aa  44.3  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1973  hypothetical protein  28 
 
 		 382 aa  43.9  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000012652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0916  protein of unknown function UPF0118  22.32 
 
 		 355 aa  43.5  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.116301  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  22.15 
 
 		 355 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  22.15 
 
 		 355 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  22.15 
 
 		 355 aa  43.1  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  22.15 
 
 		 355 aa  43.1  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  22.15 
 
 		 355 aa  43.1  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4731  hypothetical protein  33.05 
 
 		 359 aa  43.1  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.226742  hitchhiker  0.00240822 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0826  hypothetical protein  23.35 
 
 		 369 aa  43.1  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.981363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4556  hypothetical protein  25.91 
 
 		 398 aa  43.1  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.173549  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4325  permease  22.92 
 
 		 372 aa  43.1  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4337  permease  22.92 
 
 		 372 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  26.11 
 
 		 351 aa  43.1  0.008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2448  hypothetical protein  25.91 
 
 		 415 aa  43.1  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0466557  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4711  sporulation integral membrane protein YtvI  22.92 
 
 		 372 aa  43.1  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000506038 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0937  PerM family permease  25.91 
 
 		 374 aa  42.7  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1300  protein of unknown function UPF0118  26.34 
 
 		 345 aa  42.7  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.316018  normal  0.608638 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4722  sporulation integral membrane protein YtvI  22.92 
 
 		 372 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3717  hypothetical protein  22.41 
 
 		 353 aa  42.7  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396811  normal  0.610069 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>