17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1131 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1131  permease  100 
 
 		 431 aa  837    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3012  hypothetical protein  32.42 
 
 		 387 aa  172  1e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2209  protein of unknown function UPF0118  34.77 
 
 		 393 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0133966  normal  0.166807 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2094  hypothetical protein  34.25 
 
 		 348 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0787184  normal  0.014964 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0697  protein of unknown function UPF0118  31.52 
 
 		 368 aa  140  3.9999999999999997e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.612025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1587  protein of unknown function UPF0118  30.06 
 
 		 363 aa  83.2  0.000000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1326  hypothetical protein  24.85 
 
 		 354 aa  59.7  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0574  hypothetical protein  25.51 
 
 		 321 aa  58.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.877456  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4118  hypothetical protein  25.87 
 
 		 400 aa  56.6  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00655828  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4193  hypothetical protein  25.87 
 
 		 400 aa  56.6  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.662681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4349  hypothetical protein  25.12 
 
 		 400 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.632987  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1639  hypothetical protein  22.87 
 
 		 334 aa  54.3  0.000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2944  hypothetical protein  24.08 
 
 		 368 aa  53.9  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.81591  decreased coverage  0.00297728 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0262  hypothetical protein  22.16 
 
 		 334 aa  48.9  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00766044 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2416  protein of unknown function UPF0118  26.88 
 
 		 378 aa  47  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.25064  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0445  hypothetical protein  20.62 
 
 		 393 aa  45.4  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000355219  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14120  predicted permease  28.35 
 
 		 476 aa  43.1  0.009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.209203  normal  0.521602 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>