84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1587 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_1587  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 		 363 aa  697    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2094  hypothetical protein  40.9 
 
 		 348 aa  243  3.9999999999999997e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0787184  normal  0.014964 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2209  protein of unknown function UPF0118  37.36 
 
 		 393 aa  187  2e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0133966  normal  0.166807 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3012  hypothetical protein  32.56 
 
 		 387 aa  151  2e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0697  protein of unknown function UPF0118  32 
 
 		 368 aa  146  5e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.612025  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1131  permease  29.78 
 
 		 431 aa  94.4  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0574  hypothetical protein  25.75 
 
 		 321 aa  89  1e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.877456  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1639  hypothetical protein  25.53 
 
 		 334 aa  88.2  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0262  hypothetical protein  23.71 
 
 		 334 aa  84.3  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00766044 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2311  protein of unknown function UPF0118  29.79 
 
 		 393 aa  79  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0940  protein of unknown function UPF0118  27.69 
 
 		 345 aa  73.2  0.000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.726387  normal  0.96935 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4026  hypothetical protein  23.9 
 
 		 360 aa  68.6  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0560  protein of unknown function UPF0118  25.32 
 
 		 339 aa  67.4  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0245  hypothetical protein  23.01 
 
 		 336 aa  66.6  0.0000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0792  protein of unknown function UPF0118  23.99 
 
 		 344 aa  66.2  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.101192 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0191  hypothetical protein  21.94 
 
 		 336 aa  64.7  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7289  hypothetical protein  24.42 
 
 		 353 aa  64.3  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.815912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2083  hypothetical protein  22.42 
 
 		 356 aa  63.9  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.251587 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0338  hypothetical protein  25.29 
 
 		 365 aa  63.9  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88474  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0751  hypothetical protein  23.51 
 
 		 336 aa  63.2  0.000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0987  hypothetical protein  24.78 
 
 		 394 aa  62.4  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.89372 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1671  hypothetical protein  25.89 
 
 		 334 aa  62.8  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0445  hypothetical protein  22.22 
 
 		 393 aa  62.4  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000355219  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1711  hypothetical protein  22.78 
 
 		 336 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.1929  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0783  hypothetical protein  25.79 
 
 		 353 aa  61.2  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2448  hypothetical protein  25.07 
 
 		 415 aa  59.3  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0466557  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2549  hypothetical protein  23.53 
 
 		 352 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705186  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3189  protein of unknown function UPF0118  26.32 
 
 		 361 aa  58.2  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000846761  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29820  hypothetical protein  23.22 
 
 		 352 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0125581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2610  protein of unknown function UPF0118  26.84 
 
 		 370 aa  57  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13258  putative transmembrane protein  22.57 
 
 		 339 aa  56.2  0.0000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3980  hypothetical protein  21.96 
 
 		 352 aa  55.1  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0869717 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0737  hypothetical protein  25.43 
 
 		 356 aa  54.3  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.203827  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0488  hypothetical protein  24.89 
 
 		 371 aa  54.3  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.131577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3492  hypothetical protein  24.93 
 
 		 387 aa  53.9  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.705437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3717  hypothetical protein  22.35 
 
 		 353 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396811  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0398  protein of unknown function UPF0118  27.38 
 
 		 425 aa  53.1  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.0034127  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0540  protein of unknown function UPF0118  21.02 
 
 		 349 aa  53.1  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1653  hypothetical protein  26 
 
 		 362 aa  52.8  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.212682  normal  0.81767 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5533  hypothetical protein  23.61 
 
 		 355 aa  52.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0549  protein of unknown function UPF0118  22.81 
 
 		 384 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0941477  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3378  hypothetical protein  23.69 
 
 		 354 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2413  hypothetical protein  25.07 
 
 		 345 aa  51.6  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.480547  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3708  hypothetical protein  23.18 
 
 		 355 aa  51.2  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.168874 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0292  hypothetical protein  21.99 
 
 		 391 aa  50.8  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1259  protein of unknown function UPF0118  23.31 
 
 		 345 aa  50.4  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.324845  normal  0.520711 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3950  protein of unknown function UPF0118  22.87 
 
 		 360 aa  50.4  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3249  hypothetical protein  24.43 
 
 		 350 aa  50.4  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.691639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3427  hypothetical protein  25.39 
 
 		 355 aa  50.1  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11000  hypothetical protein  22.42 
 
 		 346 aa  48.9  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0460  hypothetical protein  23.46 
 
 		 352 aa  48.1  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.353952  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1154  hypothetical protein  23.83 
 
 		 358 aa  48.1  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000550105  normal  0.0344505 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4556  hypothetical protein  22.75 
 
 		 398 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.173549  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3717  hypothetical protein  22.64 
 
 		 350 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0661403  normal  0.22421 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0020  hypothetical protein  23.48 
 
 		 358 aa  47.8  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3807  hypothetical protein  22.64 
 
 		 353 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.911463  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0400  hypothetical protein  23.46 
 
 		 372 aa  47.4  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.413713  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2289  hypothetical protein  22.38 
 
 		 353 aa  47.4  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.864507  normal  0.333993 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2868  hypothetical protein  24.57 
 
 		 358 aa  46.2  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838475  normal  0.0422213 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2209  hypothetical protein  23.22 
 
 		 409 aa  45.4  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4931  hypothetical protein  26.07 
 
 		 351 aa  45.8  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4411  protein of unknown function UPF0118  24.64 
 
 		 389 aa  45.4  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0429  sporulation integral membrane protein YtvI  27.61 
 
 		 375 aa  45.4  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3210  hypothetical protein  22.77 
 
 		 354 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.212604 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4988  hypothetical protein  23.14 
 
 		 347 aa  45.1  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0937  PerM family permease  22.96 
 
 		 374 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4130  hypothetical protein  25 
 
 		 406 aa  45.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.189132  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2425  hypothetical protein  23.5 
 
 		 363 aa  45.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1326  hypothetical protein  23.72 
 
 		 354 aa  44.3  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4931  hypothetical protein  23.47 
 
 		 353 aa  44.7  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.850306  normal  0.602485 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0253  hypothetical protein  22.96 
 
 		 352 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.077494  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1436  hypothetical protein  22.96 
 
 		 352 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1633  hypothetical protein  22.96 
 
 		 352 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2642  hypothetical protein  22.96 
 
 		 352 aa  43.9  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00776691  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2503  hypothetical protein  22.96 
 
 		 352 aa  43.9  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0289  hypothetical protein  22.96 
 
 		 352 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.700262  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0529  hypothetical protein  22.45 
 
 		 352 aa  43.5  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2050  hypothetical protein  25.3 
 
 		 373 aa  43.9  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0854  membrane protein  23.24 
 
 		 363 aa  43.5  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0563046  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2601  hypothetical protein  24.78 
 
 		 352 aa  43.5  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.99204  normal  0.455316 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0614  hypothetical protein  25.21 
 
 		 358 aa  43.5  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0276  protein of unknown function UPF0118  22.34 
 
 		 423 aa  43.1  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.133789  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1581  protein of unknown function UPF0118  31.82 
 
 		 341 aa  43.1  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0769558 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0472  acid membrane antigen A  23.98 
 
 		 367 aa  42.7  0.01  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>